基于微卫星标记的青虾亲子鉴定技术建立及生长相关位点的筛选

发布时间：2024-03-20 20:01

　　青虾,学名日本沼虾(Macrobrachium nipponense),俗称河虾,是我国重要淡水养殖品种之一。由于青虾等甲壳类动物在生长发育过程中会经历多次蜕壳,常用的体外标记会随着蜕壳而丢失,同时由于青虾个体小而且离水极易死亡,体内标记也难以使用,个体标记和识别是青虾选育面临的主要困难之一。使用DNA分子标记进行亲缘关系分析可以克服蜕壳的制约,对青虾的损伤也很小,因此建立一种基于DNA分子标记的青虾亲子鉴定技术具有重要意义。微卫星具有多态性高、共显性遗传等优点,目前在水产动物亲子鉴定和数量性状相关基因研究中得到广泛应用,但迄今未见微卫星应用于青虾亲子鉴定的报道。本文从本实验室已开发的微卫星中筛选得到适用于亲子鉴定的微卫星组合,对3个全同胞家系进行亲子鉴定分析,并评估微卫星标记的鉴别能力,建立青虾亲子鉴定技术,同时为给青虾的性状相关分子标记的筛选提供一定参考数据,本文通过对微卫星位点与青虾体长、体重的相关性进行分析,初步筛选与生长性状相关的微卫星位点。从本实验室已开发的微卫星位点中,选择30对多态性较高的微卫星引物进行进一步筛选,通过对太湖野生群体16个随机个体的DNA检测,挑选条带清...

【文章页数】：72 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
    第一节 分子标记概述及其在甲壳动物中的应用
        1 分子标记概述
            1.1 限制性片段长度多态性(RFLP)
            1.2 扩增片段长度多态性(AFLP)
            1.3 微卫星DNA分子标记(SSR)
            1.4 单核苷酸多态性(SNP)
            1.5 其他分子标记
        2 分子标记在甲壳类动物遗传育种中的应用
            2.1 遗传多样性分析
            2.2 遗传连锁图谱的构建
            2.3 经济性状相关的分子标记筛选
            2.4 亲缘关系鉴定
                2.4.1 亲缘关系鉴定的原理
                2.4.2 可用于亲缘关系鉴定的标记
                2.4.3 亲缘关系鉴定概率
    第二节 本研究的目的意义
第二章 基于微卫星标记的青虾亲子鉴定技术建立
    1 实验材料
        1.1 实验用青虾
        1.2 实验仪器设备
        1.3 主要试剂
    2 实验方法及操作
        2.1 青虾基因组DNA提取
        2.2 基因组DNA电泳检测
        2.3 微卫星引物合成
        2.4 PCR引物的扩增反应及电泳检测
        2.5 聚丙烯酰胺凝胶的制备及电泳
        2.6 聚内烯酰胺凝胶的染色
        2.7 微卫星引物筛选
        2.8 亲子鉴定分析
    3 结果与分析
        3.1 微卫星分型
        3.2 家系遗传多样性分析
        3.3 微卫星位点排除率及模拟鉴定率分析
        3.4 家系鉴定率
    4 讨论
        4.1 微卫星位点的选择
        4.2 模拟分析与家系鉴定
        4.3 建立青虾亲子鉴定技术的意义
第三章 青虾生长性状相关微卫星标记的初步筛选
    1 实验材料
        1.1 实验用青虾
        1.2 主要仪器与试剂
    2 实验方法及操作
        2.1 青虾DNA的提取
        2.2 微卫星引物的合成
        2.3 PCR扩增和产物检测
        2.4 统计分析
    3 结果
        3.1 性状的表型值分布
        3.2 微卫星位点的多态性
        3.3 微卫星位点与体长、体重的相关分析
    4 讨论
全文结论
参考文献
附录
致谢
硕士期间发表的文章或专利



本文编号：3933227