草鱼α-淀粉酶基因5′侧翼序列研究

发布时间：2024-05-16 04:19

　　α-淀粉酶是生物获取能量所需要的重要酶类，在江河生态系统中，鱼类由不同的食性构成食物链体系，不同鱼类的能量获取途径不同，但进化过程中却保持着相似的α-淀粉酶基因序列；研究鱼类α-淀粉酶基因的表达调控序列，对揭示鱼类食性功能群机制具有意义。 本研究应用染色体步移方法，克隆获得草鱼的α-淀粉酶基因5′侧翼序列，长度为2,063bp。使用网络生物信息学预测软件对草鱼α-淀粉酶基因的5′侧翼序列进行分析，预测草鱼α-淀粉酶基因的启动子区域位于-252～-2bp处；草鱼α-淀粉酶基因转录起始位点（TSS）处于起始密码子（ATG）上游30bp处；预测的草鱼α-淀粉酶基因启动子区域包含有基本的启动子结构元件：TATA盒和CAAT盒。转录因子结合位点分析显示，草鱼α-淀粉酶基因5′侧翼-385bp位点存在HNF3调控元件，序列为：“5-TTTTTTTGT-3”；另外，还发现有5个GR调控元件，其中有一个具有回文结构，序列为“AGTTCTtgttgtTGTTCT”，可能具有应答糖皮质激素诱导的作用。 采用相同的方法，克隆得到鱤、鲮和广东鲂α-淀粉酶基因5′侧翼序列，长度分别2,268bp、1,635bp...

【文章页数】：62 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1-1实验原理简易图

图1-1实验原理简易图1：α-淀粉酶基因5′侧翼区域；2：α-淀粉酶基因外显子；“”：未知的序列；“”：获得的序列。Fig.1-1Thesimplediagramoftheprinciple1:α-amylasegene5′flankingseq....

图2-2草鱼α-淀粉酶基因外显子部分及推导的氨基酸序列

的α-淀粉酶结构一样，鱼类α-淀粉酶包含有8个α螺旋和8个β折叠；鱼类α-淀粉酶的氨基酸序列中参与形成二硫键的半胱氨酸（Cys）残基位点在不同物种中高度保守。获得的草鱼α-淀粉酶基因部分外显子序列推导的氨基酸序列中，包含有2个α螺旋：α1、α2，和....

图3-2轮步移PCR产物电泳图

_v3/promo/promoinit.cgi?dirDlation.com/pub/programs.html）b/programs/alibaba2/index.htmttp://www.urogene.org/cgi-bin/m基因5′侧翼序列的克隆，以草鱼基因....

图4-2α-淀粉酶基因5′侧翼近端序列比对Figure4-2Sequencealignmentof5′flankingproximalsequencesofα-amylasegene

斑马鱼草鱼鳡鲮广东鲂河鲀-1河鲀-2河鲀-3尖吻鲈马鱼1004340444137383935鱼10085817135413842鳡100836936403841鲮1006834413842东鲂....

本文编号：3974680