粤西半集约化对虾养殖环境及虾体中抗生素耐药基因动态特征分析
发布时间：2024-05-19 13:00
我国是世界水产养殖大国,近年来养殖环境安全和水产品质量安全日益受到重视。抗生素因能防治养殖生物的细菌性疾病,以及能促进养殖生物的生长,而广泛应用于农业生产中。但抗生素不能被养殖生物完全吸收代谢而长期残留在环境中,进而导致抗生素耐药菌(antibiotic resistance bacteria,ARB)、耐药基因(antibiotic resistance genes,ARGs)等问题的产生。可见,抗生素和ARGs已逐渐成为了一种新型的环境污染物,有必要对其加以关注。目前关于水产养殖环境及水产品中抗生素及ARGs的浓度水平方面的研究报道,大多还只是单次采样研究,而在对虾养殖环境及虾体中抗生素及ARGs的研究则更是甚为少见。基于此,本研究在广东茂名对虾养殖主产区,连续三个养殖生产周期跟踪采集了相关样品,以固相萃取-超高效液相色谱串联质谱法检测不同养殖时期水源水、池塘水体、沉积物、成虾及饲料等各要素中的抗生素浓度水平;以实时荧光定量PCR测定了其中的ARGs的丰度;并利用冗余分析法(RDA分析)研究了抗生素、ARGs以及主要环境因子间的相互关系。以期阐明抗生素及ARGs在粤西半集约化对虾养...
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1.1 抗生素在水产养殖中的使用情况
1.1.1 抗生素的种类
1.1.2 抗生素在水产养殖中的使用情况
1.1.3 抗生素在水产养殖环境及水产品中的残留情况
1.2 水产养殖中ARGs的浓度分布
1.3 抗生素、ARGs和环境因子之间的关系研究
1.4 研究目的及意义
1.5 技术路线
第二章 抗生素在对虾养殖环境及对虾肌肉中的残留状况
2.1 实验材料
2.1.1 抗生素标准品
2.1.2 实验试剂及耗材
2.1.3 主要仪器与设备
2.2 实验方法
2.2.1 样品的采集
2.2.1.1 采样地点
2.2.1.2 采样前准备
2.2.1.3 样品的采集
2.2.2 抗生素的提取与纯化
2.2.2.1 水样中抗生素的提取方法
2.2.2.2 沉积物和饲料中抗生素的提取方法
2.2.2.3 对虾肌肉中抗生素的提取与纯化
2.2.3 仪器检测与分析
2.3 数据分析
2.4 实验结果
2.4.1 抗生素在对虾养殖水环境中的检出情况
2.4.2 抗生素在沉积物中的检出情况
2.4.3 抗生素在虾料中的检出情况
2.4.4 抗生素在对虾肌肉中的检出情况
2.5 讨论与小结
2.5.1 讨论
2.5.1.1 对虾养殖环境中抗生素的分布特征及浓度变化
2.5.1.2 对虾养殖池塘中抗生素的来源
2.5.2 小结
第三章 ARGs在对虾养殖环境及对虾肠道中的浓度及分布特征
3.1 实验材料
3.1.1 实验耗材
3.1.2 实验试剂
3.1.3 主要仪器与设备
3.2 研究方法
3.2.1 样品采集
3.2.1.1 采样地点
3.2.1.2 采样前准备
3.2.1.3 样品的采集
3.2.2 总DNA的提取
3.2.3 RT-qPCR
3.2.3.1 标准曲线的建立
3.2.3.2 RT-qPCR定量检测
3.3 数据分析
3.4 结果与分析
3.4.1 水样中ARGs的浓度
3.4.2 沉积物中ARGs的浓度
3.4.3 虾肠道中ARGs的浓度
3.5 讨论与小结
3.5.1 讨论
3.5.1.1 不同种类的ARGs在对虾养殖环境及虾体中的浓度差异
3.5.1.2 ARGs在对虾养殖环境中的分布特征
3.5.1.3 ARGs在对虾养殖过程中的浓度变化
3.5.2 小结
第四章 抗生素、ARGs和环境因子之间的关系
4.1 实验方法
4.1.1 采样地点
4.1.2 样品的采集
4.1.3 环境因子的检测
4.1.4 数据分析方法
4.2 分析结果
4.2.1 养殖环境中环境因子的监测结果
4.2.1.1 对虾养殖水体中环境因子的监测结果
4.2.1.2 沉积物中环境因子的监测结果
4.2.2 抗生素与环境因子之间的关系
4.2.2.1 养殖水中抗生素与环境因子之间的关系
4.2.2.2 沉积物中抗生素与环境因子之间的关系
4.2.3 ARGs与环境因子之间的关系
4.2.3.1 养殖水中ARGs与环境因子之间的关系
4.2.3.2 沉积物中ARGs与环境因子之间的关系
4.2.4 抗生素和ARGs的之间的关系
4.2.4.1 养殖水中抗生素与ARGs之间的关系
4.2.4.2 沉积物中抗生素与ARGs之间的关系
4.3 讨论与小结
4.3.1 讨论
4.3.1.1 环境因子对抗生素及ARGs的影响
4.3.1.2 抗生素与耐药基因的关系
4.3.2 小结
第五章 结论与展望
5.1 结论
5.2 展望
参考文献
附录
攻读硕士期间发表论文及参加会议情况
致谢
本文编号：3978072
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1.1 抗生素在水产养殖中的使用情况
1.1.1 抗生素的种类
1.1.2 抗生素在水产养殖中的使用情况
1.1.3 抗生素在水产养殖环境及水产品中的残留情况
1.2 水产养殖中ARGs的浓度分布
1.3 抗生素、ARGs和环境因子之间的关系研究
1.4 研究目的及意义
1.5 技术路线
第二章 抗生素在对虾养殖环境及对虾肌肉中的残留状况
2.1 实验材料
2.1.1 抗生素标准品
2.1.2 实验试剂及耗材
2.1.3 主要仪器与设备
2.2 实验方法
2.2.1 样品的采集
2.2.1.1 采样地点
2.2.1.2 采样前准备
2.2.1.3 样品的采集
2.2.2 抗生素的提取与纯化
2.2.2.1 水样中抗生素的提取方法
2.2.2.2 沉积物和饲料中抗生素的提取方法
2.2.2.3 对虾肌肉中抗生素的提取与纯化
2.2.3 仪器检测与分析
2.3 数据分析
2.4 实验结果
2.4.1 抗生素在对虾养殖水环境中的检出情况
2.4.2 抗生素在沉积物中的检出情况
2.4.3 抗生素在虾料中的检出情况
2.4.4 抗生素在对虾肌肉中的检出情况
2.5 讨论与小结
2.5.1 讨论
2.5.1.1 对虾养殖环境中抗生素的分布特征及浓度变化
2.5.1.2 对虾养殖池塘中抗生素的来源
2.5.2 小结
第三章 ARGs在对虾养殖环境及对虾肠道中的浓度及分布特征
3.1 实验材料
3.1.1 实验耗材
3.1.2 实验试剂
3.1.3 主要仪器与设备
3.2 研究方法
3.2.1 样品采集
3.2.1.1 采样地点
3.2.1.2 采样前准备
3.2.1.3 样品的采集
3.2.2 总DNA的提取
3.2.3 RT-qPCR
3.2.3.1 标准曲线的建立
3.2.3.2 RT-qPCR定量检测
3.3 数据分析
3.4 结果与分析
3.4.1 水样中ARGs的浓度
3.4.2 沉积物中ARGs的浓度
3.4.3 虾肠道中ARGs的浓度
3.5 讨论与小结
3.5.1 讨论
3.5.1.1 不同种类的ARGs在对虾养殖环境及虾体中的浓度差异
3.5.1.2 ARGs在对虾养殖环境中的分布特征
3.5.1.3 ARGs在对虾养殖过程中的浓度变化
3.5.2 小结
第四章 抗生素、ARGs和环境因子之间的关系
4.1 实验方法
4.1.1 采样地点
4.1.2 样品的采集
4.1.3 环境因子的检测
4.1.4 数据分析方法
4.2 分析结果
4.2.1 养殖环境中环境因子的监测结果
4.2.1.1 对虾养殖水体中环境因子的监测结果
4.2.1.2 沉积物中环境因子的监测结果
4.2.2 抗生素与环境因子之间的关系
4.2.2.1 养殖水中抗生素与环境因子之间的关系
4.2.2.2 沉积物中抗生素与环境因子之间的关系
4.2.3 ARGs与环境因子之间的关系
4.2.3.1 养殖水中ARGs与环境因子之间的关系
4.2.3.2 沉积物中ARGs与环境因子之间的关系
4.2.4 抗生素和ARGs的之间的关系
4.2.4.1 养殖水中抗生素与ARGs之间的关系
4.2.4.2 沉积物中抗生素与ARGs之间的关系
4.3 讨论与小结
4.3.1 讨论
4.3.1.1 环境因子对抗生素及ARGs的影响
4.3.1.2 抗生素与耐药基因的关系
4.3.2 小结
第五章 结论与展望
5.1 结论
5.2 展望
参考文献
附录
攻读硕士期间发表论文及参加会议情况
致谢
本文编号：3978072
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