基于SSR标记的四川枣亲缘关系及群体遗传结构分析

发布时间：2020-04-09 12:59

【摘要】：枣(Ziziphus jujuba Mill.)是原产于我国的鼠李科(Rhamnaceae)枣属(Ziziphus)植物。枣适应性强,丰产性好,果实营养价值和药用价值高,是我国重要的果树。我国枣种质资源丰富,分布广泛。北方地区是制干、鲜食(广温型、耐寒型)和兼用枣种质主要分布区,南方地区是我国高温型或高温高湿型鲜食枣资源的主要分布区。目前枣的研究报道多集中于我国北方枣种质,对南方枣种质的研究鲜有报道。本研究利用SSR分子标记方法对四川省枣种质资源进行亲缘关系、遗传多样性和群体遗传结构分析,为我国南方枣种质资源的有效利用奠定基础。主要研究结果如下:1.15对引物的多态位点百分率达100%,多态信息含量(PIC)在0.3557-0.8200之间(平均值为0.6677),均为中度或高度多态性信息引物,适合用于33个枣栽培品种(系)的亲缘关系分析。2.对33个枣栽培品种(系)的遗传多样性分析显示,15对引物共得到111个等位基因(Na),等位基因数在2-14之间,平均值为7.4,期望杂合度(He)和观测杂合度(Ho)分别在0.463-0.839和0.364-0.848之间,平均值分别为0.711和0.624,香农信息指数(I)在0.655-2.089之间,平均值为1.509,表明33个枣栽培品种(系)遗传多样性丰富。3.UPGMA聚类可将33个枣品种(系)中的30个完全区分开。沾冬2号、冬枣和蜀脆枣亲缘关系近,罗江调元枣、龙泉油枣、岐山米枣、长秋米枣四者属同物异名。武隆猪腰枣与其他枣品种(系)遗传关系远。4.21对引物在297份枣种质中的扩增结果除JSSR93(PIC=0.0772)和JSSR198(PIC=0.0421)外,PIC变幅在0.2576-0.8410之间(平均值为0.5284),为中度或高度多态性引物,适用于枣种质群体遗传结构分析。5.21对引物对297份枣种质的遗传多样性分析显示,297份枣种质的I变幅为0.111-1.908,平均值为1.142,He变幅为0.043-0.835,平均为0.578,遗传多样性水平中等。6.STRUCTURE分析和NJ聚类可将9个枣品种群分为四大类,崭山米枣1号、崭山苹果枣和崭山大果枣群体为第一大类群;罗江调元枣、龙泉油枣、岐山米枣、长秋米枣群体为第二大类群;汶川小枣群体为第三大类群;蜀脆枣群体为第四大类群7.分子变异分析(AMOVE)和主成分分析(PCA)表明,四川枣群体间存在高度的遗传分化,基因流小(G'st=0.521,Nm=0.432)。
【图文】：

图 1 部分枣品种 DNA 琼脂糖凝胶电泳检测图Fig.1 Electrophoretic product of DNA of some jujube cultivars.2 引物筛选及多态性分析.2.1 引物筛选利用罗江调元枣、崭山米枣 1 号、蜂蜜罐和冬枣（见附录）四个枣栽培品种的组 DNA 从 135 对 SSR 引物中筛选出带型质量高、扩增结果稳定且在各个样品中呈现出多态性的引物用于 PCR 扩增。分别筛选出了 15 对引物（表 3）用于 33川枣栽培品种（系）的亲缘关系研究和 21 对引物（表 4）用于 297 份四川枣种遗传多样性和群体遗传结构分析。

图 2 引物 JSSR131（A）、BFU0581（B）对 33 个枣栽培品种（系）的扩增结果Fig. 2 Amplification result of primer JSSR131(A) and BFU0581(B) on 33 cultivars (strains) of jujube21 对引物在 297 份材料中共得到 165 个等位基因，各个位点的等位基因数在 3-13之间，多态性信息含量（PIC）变幅在 0.2576-0.8410 之间，平均值为 0.5284（表 6），以上数据表明所选引物多态性高。引物的哈迪-温伯格平衡及其显著性检测结果表明，除 JSSR198 外其他引物在 P<0.001 时都极显著偏离哈迪-温伯格平衡，其中偏离程度最小的为 JSSR128，偏离程度最大的为 Zjuju021。3.3 四川枣栽培品种（系）亲缘关系分析3.3.1 遗传多样性分析本试验对采自四川省的 33 个枣栽培品种（系）进行了遗传多样性评价。平均每
【学位授予单位】：四川农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：S665.1

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本文编号：2620786