日本结缕草铝胁迫转录响应及ZjOMT功能研究
【学位授予单位】:北京林业大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:S688.4
【图文】:
逑mg/kg,MDA含量、CAT和POD酶活力显著高于对照,达到极显著水平(P<0.01),逡逑叶绿素含量虽有下降但未达极显著水平(图2-1)。逡逑豸邋31逦15-1逦B逡逑§逦>逦AB逡逑f邋2'4'邋T邋T邋T邋A邋A逦12'邋A邋A逦^邋I逡逑—邋i邋#逦T邋r邋A逦0邋T邋T邋A邋I逡逑I逦1.8-上逦i逦N逦I逦I逦E逦9.邋i邋N邋*逡逑1逦i逡逑2逦1.2.逦|逦6-逡逑I逦8逡逑!逦0.6-逦g逦3_逡逑5逦2逡逑0逦逦y逦邋■逦:邋.:■逦k逦.....:-逦^逦.:逦,逦:逦.逦■逦Q逦^逡逑0逦20逦40逦60逦80逦100逦0逦20逦40逦60逦80逦100逡逑Concentration邋of邋Al>邋treatment邋(mg/kg邋soil)逦Concentration邋of邋Ab-*-邋treatment邋(mg/kg邋soil)逡逑S'逦600-j逦5逦16500逦!逡逑i逦u.逦B逡逑O)逦g逦0i逦丫逡逑塞逦560邋-逦I逦13200逦-邋?邋N逡逑AB逦i逦1逦A逦a逦A逡逑I逦52°*逦A逦A逦A逦^逦I逦|逦"°°-逦t逦I逦I逦I逡逑<i逦T逦:暴逦m逦_逦呡逦<3逡逑5邋480邋-上邋*逦5逦6600邋-逡逑^逦S逡逑f邋440邋-逦f邋3300-逡逑导逦1逡逑h-邋400逦逦逦逦逦.逦.逦,逦.邋Q邋0-1逦,逦,逦,逦,逦,逦
我们利用FDR与log2FC来筛选差异基因,筛选条件为FDR<0.05且l0g2FC>l,逡逑经过铝胁迫处理后,发现差异基因丨4,555个,上调的有9,710个,下调基因4,845个,逡逑(图2-2)。通过铝胁迫处理和对照之间的分析和比较,部分基因表达发生了变化,逡逑正因为这些基因的差异表达赋予了日本结缕草铝胁迫的抗性。逡逑Scatter邋plot逡逑pearson邋correlation:邋0.716逡逑?逦up-regulated邋genes邋(9710)逡逑_邋down-regulated邋genes邋(4845)逦#邋■暴逡逑0邋?邋not邋differential邋expressed邋(20188)逦^逡逑r逡逑?逦%邋?邋?逡逑CO逡逑9)逡逑产逦L"!逦1逦1逦1逦逡逑10-03逦1e-01逦1?+01逦1e+03逡逑Value邋of邋CK逡逑图2-2差异基因散点图逡逑Fig.邋2-2邋Scatter邋plot邋of邋differentially邋expressed邋genes逡逑表2-3列举了邋994个新基因中的16个表达量较高的差异表达基因,铝胁迫处理逡逑31逡逑
我们选取了邋4个下调已注释基因、4个上调已注释基因和4个未注析基因共12逡逑个基因对铝胁迫后不同时间段进行了邋q-PCR荧光定量分析,其结果与转录组测序结逡逑果相一致(图2-5)。其中两基因F调表达后有所逡逑回升似/ve邋fraracn冲基因下调较明显,而逡逑基因下调趋势较缓。上调己注释基因中,过氧化物酶(Peroxisome)、应激诱导蛋白逡逑(stress邋inducible邋protein)、锌指蛋白(zinc邋finger邋protein)基因基本逐步上调,而逡逑基因先升后降最终略高于未处理。新基因中跟水解酶相关的逡逑XLOC_000365、与阳离子结合相关的XLOC_006073都逐渐下调,与金属离子结合的逡逑XLOC_010540基因稳步上调,而与金属簇结合相关的XLOC_037486基因先上调后逡逑缓慢回落。在铝胁迫植物的整个过程中,许许多多基因参与其中,其表达模式也多种逡逑多样,有的在作用通路中形成负反馈调节,与其他基因共同形成动态平衡,无论基因逡逑的表达模式如何
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