板栗雌花序分化内源激素及分子调控机理研究
【学位单位】:武汉轻工大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2019
【中图分类】:S664.2
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
缩略表
第1章 前言
1.1 板栗概述
1.2 板栗花芽分化类型及特点
1.2.1 板栗花芽的类型
1.2.2 板栗花芽分化的特点
1.2.3 板栗花芽分化临界期的界定
1.3 板栗花芽分化的影响因素
1.3.1 品种、树龄与板栗花芽分化
1.3.2 营养物质与板栗花芽分化
1.3.3 植物激素与板栗花芽分化
1.4 植物成花途径的研究
1.4.1 春化途径
1.4.2 赤霉素途径
1.4.3 光周期途径
1.4.4 自主途径
1.4.5 成花抑制途径
1.4.6 年龄途径
1.5 高通量测序技术概述
1.5.1 转录组测序
1.5.2 代谢组学概述
1.6 本课题研究目的及意义
第2章 临界期前后板栗两种混合花芽的转录组分析
2.1 材料与仪器
2.1.1 实验材料
2.1.2 实验试剂
2.1.3 实验仪器
2.2 方法
2.2.1 RNA提取
2.2.2 文库构建
2.2.3 文库质检及上机测序
2.2.4 测序数据质控分析
2.2.5 比对参考基因组
2.2.6 基因表达水平定量
2.2.7 差异表达基因的筛选
2.2.8 差异基因的功能注释、GO分类与代谢通路分析
2.2.10 荧光定量PCR验证
2.3 结果与分析
2.3.1 板栗花芽总RNA质量检测
2.3.2 测序原始数据统计
2.3.3 Clean reads比对分析
2.3.4 基因功能注释
2.3.5 差异基因的KOG功能注释
2.3.6 差异基因的GO功能分类
2.3.7 差异基因GO富集分析
2.3.8 差异基因的KEGG代谢途径分析
2.3.9 与开花相关基因的筛选
2.3.10 差异基因的荧光定量
2.4 讨论
第3章 临界期前后板栗两种混合花芽的代谢组分析
3.1 材料与仪器
3.1.1 材料
3.1.2 试剂与仪器
3.2 实验方法
3.2.1 样品的提取
3.2.2 色谱质谱采集
3.2.3 原始数据处理
3.2.4 差异代谢物筛选
3.3 结果与分析
3.3.1 样本质控分析
3.3.2 主成分分析(PCA)
3.3.3 样本相关性分析
3.3.4 正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)
3.3.5 差异代谢物筛选结果
3.3.6 差异代谢物KEGG功能注释及富集分析
3.3.7 转录组与代谢组联合分析
3.4 讨论
第4章 板栗混合花芽临界期前后内源激素的差异分析
4.1 实验材料
4.2 实验方法
4.2.1 样品的提取
4.2.2 色谱质谱采集
4.2.3 激素定量与定性
4.3 结果与分析
4.3.1 样本质控分析
4.3.2 线性关系分析
4.3.3 激素定量分析
4.3.4 基于转录组筛选相关的激素基因
4.4 讨论
第5章 全文总结
5.1 研究结论
5.1.1 转录组数据分析
5.1.2 代谢组数据分析
5.1.3 内源激素的分析
5.2 本文创新点
5.3 展望
参考文献
致谢
附录A
攻读学位期间的研究成果
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本文编号:2892680
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