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黄瓜根发育异常突变体及其候选基因的鉴定

发布时间:2020-12-20 14:06
  黄瓜(Cucumis sativus L.2n=2x=14)为葫芦科甜瓜属植物,是世界上主要的蔬菜作物,也是我国广泛栽培的设施蔬菜作物之一。根作为植物的营养器官,在植株整个生长发育历程中发挥着至关重要的作用。根是黄瓜植株的重要组成部分,具有吸收营养物质和水分等功能。黄瓜根发育异常表型是研究植株根发育机理及培育优良品种的理想性状,但是相关研究报道较少。本研究在前期构建黄瓜EMS诱变突变体库基础上构建了黄瓜EMS诱变根发育异常突变体‘Csrod(Cucumis sativus root dysplasia)’的M3代遗传群体,对其进行表型鉴定,并利用MutMap+技术对突变表型和野生表型混池分别进行重测序分析,对根发育异常候选基因进行了初步定位,运用KASP基因分型技术对候选SNP在M3代群体中进行了鉴定,并最终确定了黄瓜EMS诱变根发育异常候选基因。主要结果如下:(1)表型鉴定结果表明,黄瓜根发育异常突变体‘Csrod’在根发育等方面与野生型存在显著差异。根发育异常突变体‘Csrod’根部较野生型生长慢、只能生长至1-2 ... 

【文章来源】:东北农业大学黑龙江省 211工程院校

【文章页数】:55 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

黄瓜根发育异常突变体及其候选基因的鉴定


技术路线

筛选装置,克力,板根


注:a)生长至第 4 d 根长度观察;b)生长至第 14 d 根长度观察。Note: a) Observation of root length growing to the 4th day; b) Observe the root length growing to the 14th day.图 2-1 亚克力板根系筛选装置Figure 2-1 Acrylic root system screening device2.2.2 表型鉴定方法WT

全基因组,实验流程,数据质量,测序


图 2-2 全基因组重测序实验流程图 Experimental flow chart of whole genome 滤并评估测序质量。Clean Reads 是指过,数据质量越好。为了得到 Clean Read

【参考文献】:
期刊论文
[1]黄瓜突变体库的构建及表型变异的初步研究[J]. 薛红霞,蒋举卫,李晓丽,宋晓飞,郑金双,闫立英,孙成振.  核农学报. 2019(03)
[2]水稻突变体库的构建及部分性状分析[J]. 李臻,王庆国,刘炜,潘教文.  山东农业科学. 2018(11)
[3]小麦EMS突变体的创制与性状鉴定[J]. 袁秀芳,王丹峰,殷慧娟,何方,刘树兵.  山东农业科学. 2018(07)
[4]玉米突变体库创制及雄性不育突变体鉴定[J]. 李新鹏,李京琳,陈小朋,曾翔,龙湍,安保光,张维,吴永忠,黄培劲.  玉米科学. 2018(03)
[5]不同N-甲基-N-亚硝基脲处理下高粱离体花粉的活力解析[J]. 岑慧慧,田承华,程庆军,屈雅娟,牛鹏飞,李楠,岳忠孝,李菁,崔桂梅,田怀东.  山西农业科学. 2018(05)
[6]紫外线对小麦叶锈病病菌流行学因素的影响[J]. 许换平,郭慧杰,张林,闫红飞,孟庆芳.  江苏农业科学. 2018(06)
[7]基于全基因组测序的MutMap方法在正向遗传学研究中的应用[J]. 袁金红,李俊华,袁娇娇,贾克利,李书粉,邓传良,高武军.  遗传. 2017(12)
[8]盐胁迫下G蛋白在拟南芥种子萌发和根生长发育中的作用[J]. 王绍杰,周索.  乡村科技. 2016(33)
[9]大豆SNP分型方法的比较[J]. 赵勇,刘晓冬,赵洪锟,袁翠平,齐广勋,王玉民,董英山.  分子植物育种. 2017(09)
[10]EMS诱变西瓜突变体库的构建及表型分析[J]. 侯艳,朱子成,朱娜娜,陈克农,栾非时,王学征.  西北植物学报. 2016(12)

博士论文
[1]黄瓜表皮毛发育及其相关基因CsTTG1和CsGL2的功能分析[D]. 陈春花.中国农业大学 2016
[2]大白菜EMS突变体库的创建与筛选鉴定[D]. 卢银.河北农业大学 2014

硕士论文
[1]玉米根系性状多样性及其对干旱胁迫的响应[D]. 乔胜.西北农林科技大学 2018
[2]黄瓜EMS诱变突变体库及TILLING平台的初步构建[D]. 薛存宝.东北农业大学 2016
[3]耐低磷水稻品种筛选和根系形态重塑机制[D]. 史春阳.扬州大学 2015
[4]EMS诱导黄瓜突变体的初步研究[D]. 张兵.山东农业大学 2012
[5]~(60)Co-γ射线对厚皮甜瓜的生物学效应研究[D]. 刘芹.新疆农业大学 2007



本文编号:2927998

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