甜橙NADPH氧化酶基因家族的鉴定及抗寒性分析
发布时间：2021-01-14 09:51
植物NADPH氧化酶是巨噬细胞NADPH氧化酶gp91phox的同源物,其一般以基因家族的形式存在。研究表明,植物NADPH氧化酶在生物和非生物胁迫中起重要的作用;但其在柑橘逆境响应中的作用尚不清楚。因此,本研究通过生物信息学筛选了甜橙NADPH氧化酶基因家族成员;采用qRT-PCR方法分析其在甜橙不同组织、不同逆境胁迫与激素处理下的基因表达特性;通过病毒诱导的基因沉默方法初步分析NADPH氧化酶基因的抗寒功能;最后分析了甜橙在低温胁迫下的生理生化指标变化。主要研究结果如下:1.通过生物信息学分析,在甜橙基因组中共发现14个NADPH氧化酶家族成员。这些NADPH氧化酶基因共分布在5条染色体上,主要集中分布在5号、7号和8号染色体。氨基酸序列同源性对比发现,14个基因成员氨基酸序列同源性较低,且外显子-内含子结构差异大,外显子的数目在5～14之间。启动子分析结果发现,NADPH氧化酶基因的启动子区域含有大量顺式作用元件,如光响应元件、防御胁迫响应元件等;这表明柑橘NADPH氧化酶基因可能参与多种功能的调控,如生长和发育、对非生物和生物胁迫的应激反应等。通过qRT-PCR方法分析NADP...
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：69 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
甜橙NADPH氧化酶基因家族的染色体定位
?Ｃｓ８ｇ１７６４０．１???Ｃｓ５ｇ１１８９０．１??图２－３甜橙ＮＡＤＰＨ氧化酶基因家族的系统进化树分析??Ｆｉｇｕｒｅ?２－３?Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ?ｔｒｅｅ?Ａｎａｌｙ
２７??２．２．６?ＮＡＤＰＨ氧化酶基因响应ＡＢＡ诱导的表达分析??如图２－６所示，通过对ＡＢＡ处理进行ｑＲＴ－ＰＣＲ分析发现，Ｃｓ４ｇ０６９２０＿ｌ的表达水平在处??理后第６小时显著上调；Ｃｓ５ｇ０２９４０．１和Ｃｓ７ｇｌ９３２０．４的表达水平在第３小时后都显著上调，??其中Ｃｓ７ｇｌ９３２０．４表达水平达处理前的６．７５倍??３〇?＾０６９２０－１?ＣＳ５Ｉ０２９４０．１?＾ｇｌ９３２０．４??ｃ?７?ｃ?＿?ａ?３，?１?ａ??Ｉ?ｉ?ｉ?ｔ?ｉ?ｉ?６０?Ｉ??Ｏｈ?３ｈ?ｂｈ?１２ｈ?２４ｈ?油?６ｈ?１２ｈ?２４ｈ?６ｈ?１２ｈ?２４ｈ??图２－６?ＮＡＤＰＨ氧化酶基因响应ＡＢＡ诱导的表达分析??Ｆｉｇｕｒｅ?２－６?Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｐｒｏｆｉｌｅｓ?ｏｆ?ＮＡＤＰＨ?ｏｘｉｄａｓｅ?ｇｅｎｅｓ?ｉｎ?ｒｅｓｐｏｎｓｅ?ｔｏ?ＡＢＡ??２．２＿７?ＮＡＤＰＨ氧化酶基因响应ＳＡ诱导的表达分析??如图２－７所示，通过对ＳＡ处理进行ｑＲＴ－ＰＣＲ分析发现，Ｃｓ５ｇｌｌ８９０．１、Ｃｓ８ｇｌ７６４０．１的??表达表现出相同的变化模式，即先升高后降低，在处理后的第１２小时达到最高值；与之??相反，Ｃｓ８ｇｌ２０００．３在处理后的第３小时显著下降，之后维持较低的表达水平。??Ｃｓ５ｇｌｌ８９０．１?Ｃｓ８ｇｌ２０００．３?Ｃｓ８ｇｌ７６４０．１??６．０?－Ｉ?１＊２１?ａ?５Ｘ）?－｜?ａ??｜５－°－?Ｉ?Ｉ?４－°－?｜??１?：：?
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物抗寒性研究进展[J]. 李文明,辛建攀,魏驰宇,田如男. 江苏农业科学. 2017(12)
[2]低温胁迫对3种柑橘幼苗细胞膜及渗透调节的影响[J]. 徐卫平,蒋景龙,任绪明,李丽,李新生,赵桦. 分子植物育种. 2017(03)
[3]外源H2O2对低温胁迫下柑橘叶片抗寒性的影响[J]. 蒋景龙. 西北植物学报. 2016(03)
[4]不同时间下低温胁迫对油棕幼苗生理生化变化的影响[J]. 刘艳菊,曹红星,张如莲. 植物研究. 2015(06)
[5]茶树NADPH氧化酶基因的克隆、亚细胞定位与表达分析[J]. 王明乐,王伟东,赵真,黎星辉. 园艺学报. 2015(01)
[6]H2O2对牡丹愈伤组织分化及抗氧化酶活性的影响[J]. 贺丹,毛仓仓,陈颖,王政,何松林. 湖北农业科学. 2015(01)
[7]柑橘冻害抵抗分子机理研究进展[J]. 陈志远,邸丽俊,王国栋,黄新民,李新生,蒋景龙. 北方园艺. 2014(01)
[8]南昌市6种棕榈科植物低温胁迫的生理响应[J]. 徐维杰,袁婷,杨寅桂,喻苏琴. 江西农业大学学报. 2013(06)
[9]低温胁迫下植物生理反应机理研究进展[J]. 任军,黄志霖,曾立雄,施征. 世界林业研究. 2013(06)
[10]植物Rboh基因功能及其活性调节机制的研究进展[J]. 刘秋圆,贺浩华,胡丽芳. 生物技术通报. 2013(11)
博士论文
[1]灵芝基因沉默体系的建立及NADPH氧化酶基因家族功能分析[D]. 穆大帅.南京农业大学 2013
[2]低温胁迫与锻炼对草莓生理特性的影响和草莓几丁质酶基因的克隆[D]. 罗娅.四川农业大学 2007
[3]钙信号系统调节柑橘抗寒生理生化机理的研究[D]. 李新国.华中农业大学 2006
[4]烟草NADPH氧化酶在Na～+、Cu～（2+）胁迫中的活性变化及其作用[D]. 于中连.中国农业大学 2005
硕士论文
[1]抗寒转录因子BpMBF1基因转杨树的表达及功能分析[D]. 金晓红.山东农业大学 2018
[2]新疆野扁桃生物学特性、光合特性及抗寒性研究[D]. 邵丽珊.新疆农业大学 2016
[3]椪柑体细胞胚胎发生机理的初步研究[D]. 刘玉玲.扬州大学 2016
[4]低温胁迫下草莓NADPH氧化酶在ROS形成中的作用[D]. 何雨沩.四川农业大学 2015
[5]清水江流域柑橘受冻状况及恢复技术应用与示范[D]. 龙令炉.贵州大学 2009
本文编号：2976687
【文章来源】：扬州大学江苏省
【文章页数】：69 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
甜橙NADPH氧化酶基因家族的染色体定位
?Ｃｓ８ｇ１７６４０．１???Ｃｓ５ｇ１１８９０．１??图２－３甜橙ＮＡＤＰＨ氧化酶基因家族的系统进化树分析??Ｆｉｇｕｒｅ?２－３?Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ?ｔｒｅｅ?Ａｎａｌｙ
２７??２．２．６?ＮＡＤＰＨ氧化酶基因响应ＡＢＡ诱导的表达分析??如图２－６所示，通过对ＡＢＡ处理进行ｑＲＴ－ＰＣＲ分析发现，Ｃｓ４ｇ０６９２０＿ｌ的表达水平在处??理后第６小时显著上调；Ｃｓ５ｇ０２９４０．１和Ｃｓ７ｇｌ９３２０．４的表达水平在第３小时后都显著上调，??其中Ｃｓ７ｇｌ９３２０．４表达水平达处理前的６．７５倍??３〇?＾０６９２０－１?ＣＳ５Ｉ０２９４０．１?＾ｇｌ９３２０．４??ｃ?７?ｃ?＿?ａ?３，?１?ａ??Ｉ?ｉ?ｉ?ｔ?ｉ?ｉ?６０?Ｉ??Ｏｈ?３ｈ?ｂｈ?１２ｈ?２４ｈ?油?６ｈ?１２ｈ?２４ｈ?６ｈ?１２ｈ?２４ｈ??图２－６?ＮＡＤＰＨ氧化酶基因响应ＡＢＡ诱导的表达分析??Ｆｉｇｕｒｅ?２－６?Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｐｒｏｆｉｌｅｓ?ｏｆ?ＮＡＤＰＨ?ｏｘｉｄａｓｅ?ｇｅｎｅｓ?ｉｎ?ｒｅｓｐｏｎｓｅ?ｔｏ?ＡＢＡ??２．２＿７?ＮＡＤＰＨ氧化酶基因响应ＳＡ诱导的表达分析??如图２－７所示，通过对ＳＡ处理进行ｑＲＴ－ＰＣＲ分析发现，Ｃｓ５ｇｌｌ８９０．１、Ｃｓ８ｇｌ７６４０．１的??表达表现出相同的变化模式，即先升高后降低，在处理后的第１２小时达到最高值；与之??相反，Ｃｓ８ｇｌ２０００．３在处理后的第３小时显著下降，之后维持较低的表达水平。??Ｃｓ５ｇｌｌ８９０．１?Ｃｓ８ｇｌ２０００．３?Ｃｓ８ｇｌ７６４０．１??６．０?－Ｉ?１＊２１?ａ?５Ｘ）?－｜?ａ??｜５－°－?Ｉ?Ｉ?４－°－?｜??１?：：?
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物抗寒性研究进展[J]. 李文明,辛建攀,魏驰宇,田如男. 江苏农业科学. 2017(12)
[2]低温胁迫对3种柑橘幼苗细胞膜及渗透调节的影响[J]. 徐卫平,蒋景龙,任绪明,李丽,李新生,赵桦. 分子植物育种. 2017(03)
[3]外源H2O2对低温胁迫下柑橘叶片抗寒性的影响[J]. 蒋景龙. 西北植物学报. 2016(03)
[4]不同时间下低温胁迫对油棕幼苗生理生化变化的影响[J]. 刘艳菊,曹红星,张如莲. 植物研究. 2015(06)
[5]茶树NADPH氧化酶基因的克隆、亚细胞定位与表达分析[J]. 王明乐,王伟东,赵真,黎星辉. 园艺学报. 2015(01)
[6]H2O2对牡丹愈伤组织分化及抗氧化酶活性的影响[J]. 贺丹,毛仓仓,陈颖,王政,何松林. 湖北农业科学. 2015(01)
[7]柑橘冻害抵抗分子机理研究进展[J]. 陈志远,邸丽俊,王国栋,黄新民,李新生,蒋景龙. 北方园艺. 2014(01)
[8]南昌市6种棕榈科植物低温胁迫的生理响应[J]. 徐维杰,袁婷,杨寅桂,喻苏琴. 江西农业大学学报. 2013(06)
[9]低温胁迫下植物生理反应机理研究进展[J]. 任军,黄志霖,曾立雄,施征. 世界林业研究. 2013(06)
[10]植物Rboh基因功能及其活性调节机制的研究进展[J]. 刘秋圆,贺浩华,胡丽芳. 生物技术通报. 2013(11)
博士论文
[1]灵芝基因沉默体系的建立及NADPH氧化酶基因家族功能分析[D]. 穆大帅.南京农业大学 2013
[2]低温胁迫与锻炼对草莓生理特性的影响和草莓几丁质酶基因的克隆[D]. 罗娅.四川农业大学 2007
[3]钙信号系统调节柑橘抗寒生理生化机理的研究[D]. 李新国.华中农业大学 2006
[4]烟草NADPH氧化酶在Na～+、Cu～（2+）胁迫中的活性变化及其作用[D]. 于中连.中国农业大学 2005
硕士论文
[1]抗寒转录因子BpMBF1基因转杨树的表达及功能分析[D]. 金晓红.山东农业大学 2018
[2]新疆野扁桃生物学特性、光合特性及抗寒性研究[D]. 邵丽珊.新疆农业大学 2016
[3]椪柑体细胞胚胎发生机理的初步研究[D]. 刘玉玲.扬州大学 2016
[4]低温胁迫下草莓NADPH氧化酶在ROS形成中的作用[D]. 何雨沩.四川农业大学 2015
[5]清水江流域柑橘受冻状况及恢复技术应用与示范[D]. 龙令炉.贵州大学 2009
本文编号：2976687
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