番茄SOD基因家族的全基因组鉴定及盐胁迫下表达分析

发布时间：2021-01-16 03:27

　　番茄对盐中度敏感,主要种植在温暖和干旱地区,而这些地区的土壤盐度往往较高,其生长发育和产量易受到盐渍及干旱等逆境胁迫的影响。逆境胁迫易导致植物体内的活性氧（reactiveoxygenspecies,ROS）浓度升高,产生一系列的生化反应,造成细胞功能紊乱甚至死亡。超氧化物歧化酶（Superoxide dismutase,SOD）作为抗氧化系统的第一道防线,能够有效的清除植物体内的活性氧,使植物减轻或免于环境胁迫带来的伤害。已有研究表明番茄SOD酶活性在盐渍,干旱等非生物胁迫下发生明显改变,说明SOD与番茄抗逆过程具有密切的联系。但目前关于番茄SOD（SlSOD）基因及其表达的调控机制还知之甚少。因此本研究通过运用生物信息学、遗传学、分子生物学等手段对SlSOD基因家族成员类型、基因结构、蛋白保守序列及其在植物中的进化关系和启动子中顺式元件等进行了系统的鉴定分析,并对其成员在非生物胁迫（盐渍和干旱处理）和激素处理条件下的表达模式进行研究,以探讨SOD在番茄抗逆过程中的作用。主要研究结果如下:1.在全基因组水平上对SlSOD基因家族进行了鉴定,共获得9个候选基因,分别是 4 个 Cu/Z... 

【文章来源】：南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：75 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
缩略词
第一章 文献综述
    1.1 超氧化物歧化酶的研究进展
        1.1.1 SOD的分类及亚细胞位置
        1.1.2 SOD基因的表达模式
        1.1.3 植物SOD与非生物胁迫
        1.1.4 植物SOD与生物胁迫
        1.1.5 SOD基因过表达对植物抗逆性的影响
        1.1.6 番茄中SOD的研究进展
    1.2 研究意义
    1.3 研究内容
第二章 番茄SOD基因家族的生物信息学分析
    2.1 材料与方法
        2.1.1 数据检索与收集
        2.1.2 基因的染色体位置和复制鉴定
        2.1.3 基因结构分析
        2.1.4 SlSOD蛋白的物理化学性质,亚细胞位置预测及保守基序分析
        2.1.5 SODs进化树的构建
    2.2 结果与分析
        2.2.1 在全基因组水平上鉴定番茄中SOD基因家族
        2.2.2 SlSOD基因的染色体分布及内含子/外显子结构分析
        2.2.3 物理化学性质及亚细胞定位
        2.2.4 SlSOD蛋白质保守序列分析
        2.2.5 SOD基因在植物中的进化分析
    2.3 讨论与结论
第三章 番茄SOD基因家族在非生物胁迫和激素处理下的表达模式分析
    3.1 材料与试剂
        3.1.1 材料
        3.1.2 试剂
        3.1.3 仪器
        3.1.4 试验方法
    3.2 结果与分析
        3.2.1 基因启动子中的顺式元件功能预测分析
        3.2.2 SlSOD基因在番茄不同组织中的表达模式分析
        3.2.3 SlSOD基因在盐和干旱胁迫下的表达模式分析
        3.2.4 SlSOD基因在不同的激素处理下的表达模式分析
    3.3 讨论与结论
        3.3.1 SlSOD基因家族启动子可能受逆境、不同激素和光的诱导
        3.3.2 SlSOD基因家族不同成员对盐渍和干旱胁迫的特异性响应
        3.3.3 SlSOD基因家族不同成员对激素胁迫的特异性响应
全文结论
全文创新点
展望
参考文献
攻读硕士期间发表的论文
致谢



本文编号：2980070