基于ITS和cpDNA petB-petD序列的寒兰群体遗传结构及遗传多样性研究
发布时间：2021-01-21 08:11
兰科是开花植物中最大的科之一,也是植物保护当中的“旗舰”类群。寒兰（Cymbidium kanran）隶属于兰科（Orchidaceae）兰属（Cymbidium）,具有很高的观赏价值和经济价值。我国寒兰资源十分丰富,但近年来随着人们的滥采滥挖,野生寒兰资源及其生境遭到了破坏,对寒兰资源的保护刻不容缓。本研究在调查我国野生寒兰资源分布的基础上,采集了我国7省10个寒兰居群的132个个体,利用ITS和cpDNA分子标记研究其遗传多样性以及遗传结构,分析了寒兰居群的遗传分化、基因流、居群动态等特点,并提出了相应的保护策略,为寒兰资源的保护和可持续利用提供了参考。主要研究结果如下:（1）ITS序列比对排列后长度为658bp,G+C含量在57.60%-68.39%之间,平均为65.99%;ITS1序列G+C含量在53.91%-71.19%之间,平均为67.57%;5.8S序列G+C含量在56.31%-60.74%之间,平均为57.69%;ITS2序列G+C含量在67.86%-70.63%之间,平均为69.82%;cpDNA petB-petD序列比对排列后长度为536bp,G+C含量在33.2...
【文章来源】：南昌大学江西省 211工程院校
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
8S-26SrDNA基本结构
第 2 章 材料与方法2.1 实验材料2.1.1 实验材料采集实验所用寒兰样本分别采自于广西省桂林市（GL）、福建省武夷山市（WYS）、湖南省靖州县（JZ）、湖北省来凤县（LF）、贵州省榕江县（RJ）、浙江省云和县（YH）以及江西省的崇义县（CY）、宜丰县（YF）、寻乌县（XW）和龙南县（LN），共 7 个省份 10 个样地，10 个寒兰居群总计 132 个样本，其中江西省包括 4 个居群，作为外类群的春兰采自于湖北省来凤县。寒兰样本采集结束后，将植株带回并栽种于南昌大学先骕园兰花大棚中，实验时选取新鲜幼嫩无病虫害的叶片。寒兰各居群采样地信息见图 2.1 和表 2.1。
部分样本电泳结果如图3.1 所示。用微量分光光度计测定样本的浓度和纯度，浓度在 100-300ng/μl 之间，A260/A280 值在 1.6-2.0 之间，符合本实验的要求。用筛选出的引物以及建立的PCR 反应体系分别对 ITS 和 cpDNA petB-petD 片段进行扩增，扩增产物琼脂糖凝胶电泳结果显示，ITS 序列长度在 750bp 左右，cpDNApetB-petD 序列长度在600bp 左右。图 3.2 和图 3.3 分别为 ITS 和 cpDNApetB-petD 序列部分扩增产物电泳图。图 3.1 基因组 DNA 电泳图Fig. 3.1 The electrophoretogram of genome DNA注：M 为 DL5000 DNAMarkerNote: M represents DL5000 DNAMarker图 3.2 ITS 序列部分扩增产物电泳图Fig. 3.2 The electrophoretogram of ITS amplification products注：M 为 DL2000 DNAMarker；1-15 为 RJ1-15；16-22 为 LN1-7Note: M represents DL2000 DNAMarker ; 1-15 represent RJ1-15; 16-22 represent LN1-7, respectively
【参考文献】：
期刊论文
[1]寒兰种子无菌萌发及根状茎诱导分化技术研究[J]. 陈进燎,胡庆林,张艺祎,李云霞,欧碧华,翟俊文. 中国园艺文摘. 2016(12)
[2]基于SRAP标记的国兰种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建[J]. 唐源江,曹雯静,吴坤林. 中国农业科学. 2015(09)
[3]寒兰栽培管理[J]. 李浩新. 中国花卉园艺. 2014(24)
[4]寒兰种质资源表型性状多样性分析[J]. 段艳皊,范义荣,敖素燕,宁惠娟,郭雨楠. 中国农学通报. 2014(16)
[5]寒兰株系间遗传多样性和亲缘关系的SSR分子标记分析[J]. 徐晓薇,江南,杨俊波,杨燕萍,王丽芳. 核农学报. 2011(06)
[6]寒兰盆苗栽培适宜基质配比研究[J]. 姜运力,刘兰,王莲辉,陈景艳,罗在柒. 安徽农业科学. 2010(26)
[7]寒兰品种类型的SRAP分子鉴定[J]. 蹇黎,朱利泉. 中国农业科学. 2010(15)
[8]遗传多样性研究进展[J]. 马静,安永平,王彩芬,张文银. 陕西农业科学. 2010(01)
[9]rDNA ITS区序列分子标记技术在植物学研究中的应用[J]. 牛宪立,姬可平,吴群,吕国庆. 生物信息学. 2009(04)
[10]兰花的传粉与保护研究[J]. 李鹏,郑桂灵,周峰. 北方园艺. 2009(05)
博士论文
[1]铁皮石斛种质资源的鉴定与评价研究[D]. 包英华.广州中医药大学 2014
硕士论文
[1]寒兰成花机理及花期调控研究[D]. 龚湉.福建农林大学 2015
[2]基于ITS和cpDNA分子标记的江西野生寒兰居群遗传结构研究[D]. 张威.南昌大学 2014
[3]东亚特有珍稀兰科植物扇脉杓兰的遗传多样性与谱系地理学研究[D]. 李星霖.华东师范大学 2014
[4]基于ITS和cpDNA分子标记的江西建兰野生居群遗传结构研究[D]. 李亚.南昌大学 2013
[5]基于ITS和cpDNA江西蕙兰野生居群遗传结构研究[D]. 龚黄莎.南昌大学 2013
[6]基于ITS和trnH-psbA对川西南杓兰的分子系统学研究[D]. 张业栋.四川农业大学 2012
[7]秦岭冷杉和巴山冷杉的种群遗传结构及谱系地理学的比较研究[D]. 张启伟.广西师范大学 2012
[8]60Co-γ射线对寒兰根状茎的辐射诱变效应研究[D]. 李婧嫄.南昌大学 2011
[9]江西省野生寒兰的ISSR遗传多样性研究[D]. 孙小琴.南昌大学 2010
[10]基于cpDNA单倍型的银杏群体遗传与谱系分析[D]. 曾真.浙江大学 2008
本文编号：2990803
【文章来源】：南昌大学江西省 211工程院校
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
8S-26SrDNA基本结构
第 2 章 材料与方法2.1 实验材料2.1.1 实验材料采集实验所用寒兰样本分别采自于广西省桂林市（GL）、福建省武夷山市（WYS）、湖南省靖州县（JZ）、湖北省来凤县（LF）、贵州省榕江县（RJ）、浙江省云和县（YH）以及江西省的崇义县（CY）、宜丰县（YF）、寻乌县（XW）和龙南县（LN），共 7 个省份 10 个样地，10 个寒兰居群总计 132 个样本，其中江西省包括 4 个居群，作为外类群的春兰采自于湖北省来凤县。寒兰样本采集结束后，将植株带回并栽种于南昌大学先骕园兰花大棚中，实验时选取新鲜幼嫩无病虫害的叶片。寒兰各居群采样地信息见图 2.1 和表 2.1。
部分样本电泳结果如图3.1 所示。用微量分光光度计测定样本的浓度和纯度，浓度在 100-300ng/μl 之间，A260/A280 值在 1.6-2.0 之间，符合本实验的要求。用筛选出的引物以及建立的PCR 反应体系分别对 ITS 和 cpDNA petB-petD 片段进行扩增，扩增产物琼脂糖凝胶电泳结果显示，ITS 序列长度在 750bp 左右，cpDNApetB-petD 序列长度在600bp 左右。图 3.2 和图 3.3 分别为 ITS 和 cpDNApetB-petD 序列部分扩增产物电泳图。图 3.1 基因组 DNA 电泳图Fig. 3.1 The electrophoretogram of genome DNA注：M 为 DL5000 DNAMarkerNote: M represents DL5000 DNAMarker图 3.2 ITS 序列部分扩增产物电泳图Fig. 3.2 The electrophoretogram of ITS amplification products注：M 为 DL2000 DNAMarker；1-15 为 RJ1-15；16-22 为 LN1-7Note: M represents DL2000 DNAMarker ; 1-15 represent RJ1-15; 16-22 represent LN1-7, respectively
【参考文献】：
期刊论文
[1]寒兰种子无菌萌发及根状茎诱导分化技术研究[J]. 陈进燎,胡庆林,张艺祎,李云霞,欧碧华,翟俊文. 中国园艺文摘. 2016(12)
[2]基于SRAP标记的国兰种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建[J]. 唐源江,曹雯静,吴坤林. 中国农业科学. 2015(09)
[3]寒兰栽培管理[J]. 李浩新. 中国花卉园艺. 2014(24)
[4]寒兰种质资源表型性状多样性分析[J]. 段艳皊,范义荣,敖素燕,宁惠娟,郭雨楠. 中国农学通报. 2014(16)
[5]寒兰株系间遗传多样性和亲缘关系的SSR分子标记分析[J]. 徐晓薇,江南,杨俊波,杨燕萍,王丽芳. 核农学报. 2011(06)
[6]寒兰盆苗栽培适宜基质配比研究[J]. 姜运力,刘兰,王莲辉,陈景艳,罗在柒. 安徽农业科学. 2010(26)
[7]寒兰品种类型的SRAP分子鉴定[J]. 蹇黎,朱利泉. 中国农业科学. 2010(15)
[8]遗传多样性研究进展[J]. 马静,安永平,王彩芬,张文银. 陕西农业科学. 2010(01)
[9]rDNA ITS区序列分子标记技术在植物学研究中的应用[J]. 牛宪立,姬可平,吴群,吕国庆. 生物信息学. 2009(04)
[10]兰花的传粉与保护研究[J]. 李鹏,郑桂灵,周峰. 北方园艺. 2009(05)
博士论文
[1]铁皮石斛种质资源的鉴定与评价研究[D]. 包英华.广州中医药大学 2014
硕士论文
[1]寒兰成花机理及花期调控研究[D]. 龚湉.福建农林大学 2015
[2]基于ITS和cpDNA分子标记的江西野生寒兰居群遗传结构研究[D]. 张威.南昌大学 2014
[3]东亚特有珍稀兰科植物扇脉杓兰的遗传多样性与谱系地理学研究[D]. 李星霖.华东师范大学 2014
[4]基于ITS和cpDNA分子标记的江西建兰野生居群遗传结构研究[D]. 李亚.南昌大学 2013
[5]基于ITS和cpDNA江西蕙兰野生居群遗传结构研究[D]. 龚黄莎.南昌大学 2013
[6]基于ITS和trnH-psbA对川西南杓兰的分子系统学研究[D]. 张业栋.四川农业大学 2012
[7]秦岭冷杉和巴山冷杉的种群遗传结构及谱系地理学的比较研究[D]. 张启伟.广西师范大学 2012
[8]60Co-γ射线对寒兰根状茎的辐射诱变效应研究[D]. 李婧嫄.南昌大学 2011
[9]江西省野生寒兰的ISSR遗传多样性研究[D]. 孙小琴.南昌大学 2010
[10]基于cpDNA单倍型的银杏群体遗传与谱系分析[D]. 曾真.浙江大学 2008
本文编号：2990803
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