西南特有植物大王杜鹃的转录组分析与EST-SSR分子标记开发

发布时间：2021-03-19 10:25

　　大王杜鹃（Rhododendron rex subsp.rex）为杜鹃花科（Ericaceae）杜鹃属（Rhododendron）常绿杜鹃亚属（Subgen.Hymenanthes）常绿小乔木,分布于云南东北部、四川西南部等地。由于长期外界人为干扰对其生境的破坏导致该物种目前呈相互隔离的片段化分布格局,其野生种群受到严重威胁,但目前对大王杜鹃基础生物学方面的研究几乎处于空白状态,特别是关于大王杜鹃基因组及遗传标记方面的信息十分有限,严重阻碍了大王杜鹃遗传多样性和种质资源的有效保护。鉴于此,本文在对大王杜鹃种群分布调查的基础上,开展了大王杜鹃的转录组分析、环境适应性及化学物质合成功能基因挖掘、EST-SSR和SNPs分子标记开发等方面研究,旨在为该物种的开发利用和种质资源保护提供科学依据。主要研究结果和结论如下:1.大王杜鹃转录组测序分析研究基于第二代测序技术（NGS）,通过Illumina HiSeq4000测序平台得到大王杜鹃新鲜叶片的转录组序列（NCBI登录号为SRP108011）,使用Blast算法（E<1E-5）与Nr,String,Swissprot和KEGG数据库比对... 

【文章来源】：云南大学云南省 211工程院校

【文章页数】：99 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

大王杜鹃所有unigenes长度分布

大王杜鹃Nr分布结果比较

大王杜鹃基因序列的GO综合分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]藏在深闺人不识的大王杜鹃[J]. 刘芳黎,申仕康.  大自然. 2017(03)
[2]杜鹃属植物保护生物学研究进展[J]. 马宏,李太强,刘雄芳,万友名,李钰莹,刘秀贤,李正红.  世界林业研究. 2017(04)
[3]园林园艺中的高山杜鹃[J]. 刘娟,刘红梅,张美娟.  园林. 2017(04)
[4]基于新一代高通量测序技术开发巨人半边莲Lobelia deckenii的SSR标记[J]. 米奇,龙志成,Muchuku John Kamau,陈进明,王青锋.  植物科学学报. 2015(06)
[5]秦岭山区美容杜鹃五个野生种群遗传多样性的ISSR分析[J]. 赵冰,郑茜子,李厚华.  广西植物. 2015(05)
[6]贵州百里杜鹃自然保护区杜鹃属植物分子系统学研究[J]. 何云松,王孜昌,黄家勇,张玉武,陈翔.  种子. 2015(09)
[7]大树杜鹃播种苗培育技术[J]. 毕玮,陈芳,刘敏,陈伟,吴涛,李贵祥.  辽宁林业科技. 2015(03)
[8]冷休克蛋白的生物学功能研究进展[J]. 王辉,丁协刚,李世文,郑航,郑新民.  中华临床医师杂志(电子版). 2015(08)
[9]贵州30种杜鹃属植物叶背表皮显微形态特征[J]. 陈翔,黄承玲,张玉武,李苇洁,龙成昌.  广西植物. 2015(01)
[10]高通量测序技术的发展及其在生命科学中的应用[J]. 杜玲,刘刚,陆健,刘丑生,哈福.  中国畜牧兽医. 2014(12)

博士论文
[1]利用RNA-seq技术在云南山茶中解析重要分子通路与开发多态性EST-SSR[D]. 姚秋阳.云南大学 2015
[2]杜仲4种活性成分合成系列基因多样性及序列特征[D]. 李铁柱.中南林业科技大学 2015
[3]长白山高山红景天保护遗传学研究[D]. 赵伟.吉林大学 2014
[4]长白山牛皮杜鹃的遗传多样性与分子亲缘地理学研究[D]. 刘雁飞.吉林大学 2013
[5]基于EST数据库和转录组测序的茶树DNA分子标记开发与应用研究[D]. 王丽鸳.中国农业科学院 2011

硕士论文
[1]云南轿子山大王杜鹃的种子生理及遗传多样性研究[D]. 苏应雄.云南大学 2017
[2]黎平杂边禾dss-1突变体光合生理特性及基因定位研究[D]. 陈锡.贵州大学 2016
[3]短花针茅SNP标记开发与遗传多样性研究[D]. 周俊梅.内蒙古大学 2015
[4]基于NSSR和CPSSR标记的台湾杉遗传多样性研究[D]. 李江伟.华中农业大学 2014
[5]沙冬青转录组、小RNA组及低温应答基因表达谱研究[D]. 宋志丹.中南林业科技大学 2012
[6]桉树EST-SNP的开发及EST图谱构建[D]. 张晓红.南京林业大学 2009
[7]丹顶鹤孵卵期行为比较和亲缘关系的研究[D]. 计子娟.东北农业大学 2009
[8]百合查尔酮合成酶基因（CHS）及其启动子的克隆与分析[D]. 杨丽.西北农林科技大学 2006



本文编号：3089433