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香蕉Aux/IAA家族鉴定及其在P.indica诱导的FocTR4抗性中的表达分析

发布时间:2021-04-26 02:16
  香蕉(Musa spp.)是世界四大水果之一,不断恶化的自然环境(干旱、盐碱、热胁迫、寒潮等等)和病虫害是近些年香蕉产业发展的主要限制因素,其中病原为尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种(Fusarium oxysporum f.sp.cubense Tropical Race 4,FocTR4)的香蕉枯萎病影响最为严重。改良现有品种和选育产量高、风味好且抗逆的香蕉新品种是最根本的解决办法,而香蕉栽培种大多为三倍体,常规杂交育种存在一定障碍,所以转基因育种是未来香蕉育种的重要途径,挖掘抗逆基因是第一步。印度梨形孢(Piriformospora indica,P.indica)是近些年来被定殖于多种植物以增强植株本身抗逆能力的类丛枝菌根真菌。前期研究发现定殖P.indica的‘天宝蕉’相对于无定殖植株在感染FocTR4后一定程度上延缓了其病情发展。已有研究表明FocTR4和P.indica对植物体生长素具有较大影响,在此前提下,本研究开展了在枯萎病菌侵染两个月时四组实验组处理[无任何处理的对照组(CK)、P.indica定殖组(P+)、P.indica定殖和FocTR4侵染组(PF)、Foc... 

【文章来源】:福建农林大学福建省

【文章页数】:97 页

【学位级别】:硕士

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摘要
ABSTRACT
第一章 引言
    1 Aux/IAA基因家族研究现状
        1.1 Aux/IAA家族基因编码蛋白结构特征
        1.2 Aux/IAA基因家族与植物生长发育
        1.3 Aux/IAA基因家族与植物抗逆
            1.3.1 Aux/IAA基因家族与非生物胁迫
            1.3.2 Aux/IAA基因家族与生物胁迫
    2 香蕉枯萎病防控和抗病育种研究现状
        2.1 香蕉枯萎病的防治
            2.1.1 化学防治
            2.1.2 生物防治
            2.1.3 轮作与套种
            2.1.4 综合防控
        2.2 抗枯萎病香蕉育种
            2.2.1 诱变育种
            2.2.2 芽变选种
            2.2.3 组培苗突变体筛选育种
            2.2.4 选择育种
            2.2.5 常规杂交育种
            2.2.6 遗传改良转基因育种
        2.3 香蕉抗病基因和枯萎病菌致病基因的挖掘
            2.3.1 香蕉抗病基因的挖掘
            2.3.2 枯萎病菌致病相关基因的挖掘
    3 P.indica增强植物抗病性研究现状
    4 本研究的意义及主要内容
        4.1 研究意义
        4.2 主要研究内容
第二章 P.indica和FocTR4对香蕉生长素含量及部分生长素相关基因表达的影响分析
    1 材料与方法
        1.1 材料
            1.1.1 植物材料
            1.1.2 试剂
        1.2 方法
            1.2.1 植物材料处理
            1.2.2 生长素含量测定
            1.2.3 RNA提取和定量反转录
            1.2.4 生长素相关基因的选择
            1.2.5 实时定量PCR
    2 结果与分析
        2.1 FocTR4侵染两个月后四组样品表型观察
        2.2 四组样品生长素含量测定
        2.3 生长素相关基因的表达分析
    3 讨论
第三章 香蕉Aux/IAA基因家族成员鉴定、生物信息学分析及密码子偏好性分析
    第一节 香蕉Aux/IAA基因家族成员鉴定和生物信息学分析
        1 材料与方法
            1.1 材料
            1.2 方法
                1.2.1 数据库检索和理化性质分析
                1.2.2 系统进化关系分析
                1.2.3 基因结构分析
                1.2.4 染色体定位
                1.2.5 保守基序分析
                1.2.6 可变剪切验证
        2 结果与分析
            2.1 香蕉Aux/IAA家族成员基本信息、蛋白理化性质分析
            2.2 系统进化关系分析
            2.3 香蕉Aux/IAA家族成员基因结构分析
            2.4 染色体定位分析结果
            2.5 蛋白质结构域和保守基序分析
            2.6 可变剪切验证结果
        3 讨论
            3.1 香蕉Aux/IAA基因家族成员较多且存在可变剪切现象
            3.2 保守结构域和基序与Aux/IAA定位及功能相关
    第二节 香蕉Aux/IAA基因家族密码子偏好性分析
        1 材料与方法
            1.1 材料
            1.2 方法
        2 结果与分析
            2.1 香蕉Aux/IAA基因家族的ENC和 GC分析
            2.2 同义密码子相对使用度(RSCU)分析
            2.3 最优密码子的确定
            2.4 香蕉Aux/IAA基因家族成员碱基组成分析
            2.5 香蕉Aux/IAA基因家族成员受体系统选择
        3 讨论
            3.1 香蕉Aux/IAA基因家族密码子偏好性分析
            3.2 香蕉Aux/IAA基因家族密码子偏好性的影响因素
            3.3 香蕉Aux/IAA基因家族成员受体系统选择
第四章 香蕉Aux/IAA基因家族成员启动子顺式作用元件预测与部分成员定量表达分析
    1 材料与方法
        1.1 材料
        1.2 方法
    2 结果与分析
    3 讨论
第五章 香蕉Aux/IAA家族部分成员在P.indica诱导的FocTR4抗性中的表达分析
    1 材料与方法
        1.1 材料
        1.2 方法
    2 结果与分析
    3 讨论
第六章 成员MaIAA25、MaIAA31亚细胞定位分析
    1 材料与方法
        1.1 材料
            1.1.1 植物材料
            1.1.2 载体和菌种
            1.1.3 试剂
            1.1.4 培养基
        1.2 方法
            1.2.1 引物设计和PCR扩增
            1.2.2 单酶切和目的片段回收
            1.2.3 重组载体构建和大肠杆菌转化
            1.2.4 农杆菌转化和鉴定
            1.2.5 农杆菌介导法侵染洋葱表皮细胞及显微观察
    2 结果与分析
    3 讨论
第七章 结论与展望
    1 结论
        1.1 P.indica和FocTR4对香蕉生长素含量及部分生长素相关基因表达的影响分析
        1.2 香蕉Aux/IAA家族成员鉴定、生物信息学分析及密码子偏好性分析
            1.2.1 香蕉Aux/IAA家族成员鉴定和生物信息学分析
            1.2.2 香蕉Aux/IAA家族成员密码子偏好性分析
        1.3 香蕉Aux/IAA基因家族成员启动子顺式作用元件预测与部分成员定量表达分析
        1.4 香蕉Aux/IAA家族部分成员在P.indica诱导的FocTR4抗性中的表达分析
        1.5 成员MaIAA25、MaIAA31亚细胞定位分析
    2 展望
参考文献
在学硕士期间发表学术论文与研究成果
致谢


【参考文献】:
期刊论文
[1]施用淡紫拟青霉与套作对香蕉枯萎病控病作用的影响[J]. 汪军,王国芬,杨腊英,郭立佳,潘江禹,毛超,戴青冬,黄俊生.  果树学报. 2013(05)
[2]菌株BM-24的分离鉴定及对香蕉枯萎病菌的抑菌活性[J]. 黄霄,陈波,周登博,谭昕,张锡炎.  植物保护学报. 2013(02)
[3]不同药剂防治香蕉枯萎病效果评价[J]. 郭立佳,杨腊英,彭军,王国芬,梁昌聪,刘磊,黄俊生.  中国农学通报. 2013(01)
[4]香蕉枯萎病生防菌AF11的鉴定及其定殖研究[J]. 胡伟,赵兰凤,张亮,杨江舟,张静,李华兴.  中国生物防治学报. 2012(03)
[5]茶树抗寒调控转录因子ICE1密码子偏性分析[J]. 时慧,王玉,杨路成,丁兆堂.  园艺学报. 2012(07)
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[7]密码子偏性的分析方法及相关研究进展[J]. 吴宪明,吴松锋,任大明,朱云平,贺福初.  遗传. 2007(04)
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[9]香蕉枯萎病及其防治研究进展[J]. 王振中.  中国植保导刊. 2006(07)
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博士论文
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[2]复合拮抗菌发酵液对香蕉枯萎病及土壤微生物区系的影响[D]. 周登博.海南大学 2013
[3]水稻组织特异表达启动子的分离克隆、功能分析及应用[D]. 叶荣建.华中农业大学 2012

硕士论文
[1]单子叶植物基因组结构和功能的比较基因组研究[D]. 于佳祥.华北理工大学 2016
[2]玉米苗期干旱胁迫下可变剪接及其调控因子的研究[D]. 李娇.郑州大学 2013
[3]香蕉枯萎病拮抗芽孢杆菌的筛选及其定殖特性研究[D]. 朱利林.海南大学 2012
[4]香蕉与枯萎病病程相关基因的鉴定[D]. 郑雯.海南大学 2010



本文编号:3160535

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