甜瓜农艺性状与SSR标记的关联分析和特异材料的遗传构成
发布时间：2021-05-11 16:59
甜瓜种质资源极其丰富,表型变异也极为广泛,了解这些性状的遗传规律能够指导甜瓜育种。分子标记和生物信息学方法被广泛应用于图谱构建、遗传多样性分析和基因定位等方面,在当前甜瓜育种中有较大的应用空间和潜力。本研究利用62个SSR标记对甜瓜材料的8个农艺性状进行关联分析,挖掘出了与甜瓜农艺性状相关联的标记位点。另外通过序列比对,开发出了与甜瓜果肉颜色紧密连锁的InDel分子标记。本文旨在探寻和开发可应用于甜瓜育种中的功能型分子标记,以实现对甜瓜性状的预测以及快速筛选,达到精确育种的目标。主要研究内容及结果如下:1.对144份甜瓜材料3个季度的16个农艺性状表型数据分析发现,甜瓜性状变异极其丰富。其中8个质量性状多样性变化范围为0.362.29,平均值为1.16;8个数量性状的变异系数范围为10.0%49.0%,其中平均单瓜重的变异系数最大。三个季度平均单瓜重平均值的变化范围为25.671937.33 g,平均值为910.84 g,其变幅最大为74.5倍。结果表明材料群体具有丰富的表型变异。2.选取遗传多样性较高的8个性状,在14...
【文章来源】：天津大学天津市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：86 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第1章 绪论
1.1 甜瓜的特性
1.1.1 甜瓜的起源和分类
1.1.2 甜瓜的遗传多样性
1.2 甜瓜相关性状遗传研究进展
1.3 关联分析
1.3.1 关联分析的原理和策略
1.3.2 关联分析的基础—连锁不平衡
1.3.3 关联分析在作物中的研究进展
1.4 分子标记
1.4.1 SSR标记技术及应用
1.4.2 InDel标记技术及应用
1.4.3 SNP标记及应用
1.4.4 分子标记在甜瓜育种中的研究进展
1.5 研究内容及目的和意义
1.5.1 研究内容
1.5.2 研究目的和意义
1.5.3 技术路线
第2章 甜瓜重要性状与分子标记的关联分析
2.1 材料与方法
2.1.1 实验材料
2.1.2 表型性状调查及变异分析
2.1.3 DNA提取及检测
2.1.4 SSR标记全基因组扫描
2.1.5 SSR标记遗传多样性分析
2.1.6 SSR标记与甜瓜农艺性状关联分析
2.1.7 优异等位变异挖掘和特异材料分析
2.2 结果与分析
2.2.1 甜瓜表型性状遗传多样性分析
2.2.2 SSR标记多样性分析
2.2.3 基于遗传距离的聚类分析
2.2.4 群体结构分析
2.2.5 连锁不平衡分析
2.2.6 SSR标记对性状关联分析
2.2.7 部分性状关联位点等位变异表型效应及特异性材料分析
2.3 讨论
第3章 甜瓜果肉和果皮颜色相关分子标记的开发和应用
3.1 甜瓜果肉颜色相关分子标记InDel-Or1 的开发及应用
3.1.1 材料与方法
3.1.2 结果与分析
3.1.3 讨论
3.2 甜瓜果皮颜色相关分子标记的验证
3.2.1 材料与方法
3.2.2 结果与分析
3.2.3 讨论
第4章 全文结论
参考文献
附录
发表论文和参加科研情况说明
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]芝麻SNP和InDel标记遗传多样性、群体结构及连锁不平衡分析[J]. 魏利斌,苗红梅,李春,段迎辉,徐芳芳,张海洋. 分子植物育种. 2017(08)
[2]甜瓜果实相关性状QTL分析[J]. 栾非时,矫士琦,盛云燕,朱子成. 东北农业大学学报. 2017(03)
[3]甜瓜果实性状遗传规律的研究进展[J]. 于翠香,韩忠才,王占海,张海燕,杨贵春. 东北农业科学. 2016(03)
[4]InDel标记的研究和应用进展[J]. 杨洁,赫佳,王丹碧,施恩,杨文宇,耿其芳,王中生. 生物多样性. 2016(02)
[5]基于SSR标记的板栗地方品种遗传多样性与关联分析[J]. 江锡兵,汤丹,龚榜初,赖俊声. 园艺学报. 2015(12)
[6]甜瓜果实颜色3个质量性状基因的定位[J]. 杨光华,范荣,杨小锋,侯军亮,袁士臣,曹明,王学林,李劲松. 园艺学报. 2014(05)
[7]橙色果肉甜瓜β-胡萝卜素积累的分子机理[J]. 赵军林,于喜艳,王秀峰. 山东农业科学. 2014(05)
[8]甜瓜地方品种6个产量相关性状与SSR标记的关联分析[J]. 苏艳,胡建斌,黄松,王盼乔,李琼. 农业生物技术学报. 2013(11)
[9]甜瓜果实相关性状QTL分析[J]. 张雪娇,高鹏,栾非时. 中国蔬菜. 2013(18)
[10]中国甜瓜种质资源形态性状遗传多样性分析[J]. 胡建斌,马双武,简在海,王吉明,李琼,苏艳. 植物遗传资源学报. 2013(04)
博士论文
[1]黄瓜种质遗传多样性的形态和分子评价及其亲缘关系研究[D]. 李锡香.中国农业科学院 2002
本文编号：3181771
【文章来源】：天津大学天津市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：86 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第1章 绪论
1.1 甜瓜的特性
1.1.1 甜瓜的起源和分类
1.1.2 甜瓜的遗传多样性
1.2 甜瓜相关性状遗传研究进展
1.3 关联分析
1.3.1 关联分析的原理和策略
1.3.2 关联分析的基础—连锁不平衡
1.3.3 关联分析在作物中的研究进展
1.4 分子标记
1.4.1 SSR标记技术及应用
1.4.2 InDel标记技术及应用
1.4.3 SNP标记及应用
1.4.4 分子标记在甜瓜育种中的研究进展
1.5 研究内容及目的和意义
1.5.1 研究内容
1.5.2 研究目的和意义
1.5.3 技术路线
第2章 甜瓜重要性状与分子标记的关联分析
2.1 材料与方法
2.1.1 实验材料
2.1.2 表型性状调查及变异分析
2.1.3 DNA提取及检测
2.1.4 SSR标记全基因组扫描
2.1.5 SSR标记遗传多样性分析
2.1.6 SSR标记与甜瓜农艺性状关联分析
2.1.7 优异等位变异挖掘和特异材料分析
2.2 结果与分析
2.2.1 甜瓜表型性状遗传多样性分析
2.2.2 SSR标记多样性分析
2.2.3 基于遗传距离的聚类分析
2.2.4 群体结构分析
2.2.5 连锁不平衡分析
2.2.6 SSR标记对性状关联分析
2.2.7 部分性状关联位点等位变异表型效应及特异性材料分析
2.3 讨论
第3章 甜瓜果肉和果皮颜色相关分子标记的开发和应用
3.1 甜瓜果肉颜色相关分子标记InDel-Or1 的开发及应用
3.1.1 材料与方法
3.1.2 结果与分析
3.1.3 讨论
3.2 甜瓜果皮颜色相关分子标记的验证
3.2.1 材料与方法
3.2.2 结果与分析
3.2.3 讨论
第4章 全文结论
参考文献
附录
发表论文和参加科研情况说明
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]芝麻SNP和InDel标记遗传多样性、群体结构及连锁不平衡分析[J]. 魏利斌,苗红梅,李春,段迎辉,徐芳芳,张海洋. 分子植物育种. 2017(08)
[2]甜瓜果实相关性状QTL分析[J]. 栾非时,矫士琦,盛云燕,朱子成. 东北农业大学学报. 2017(03)
[3]甜瓜果实性状遗传规律的研究进展[J]. 于翠香,韩忠才,王占海,张海燕,杨贵春. 东北农业科学. 2016(03)
[4]InDel标记的研究和应用进展[J]. 杨洁,赫佳,王丹碧,施恩,杨文宇,耿其芳,王中生. 生物多样性. 2016(02)
[5]基于SSR标记的板栗地方品种遗传多样性与关联分析[J]. 江锡兵,汤丹,龚榜初,赖俊声. 园艺学报. 2015(12)
[6]甜瓜果实颜色3个质量性状基因的定位[J]. 杨光华,范荣,杨小锋,侯军亮,袁士臣,曹明,王学林,李劲松. 园艺学报. 2014(05)
[7]橙色果肉甜瓜β-胡萝卜素积累的分子机理[J]. 赵军林,于喜艳,王秀峰. 山东农业科学. 2014(05)
[8]甜瓜地方品种6个产量相关性状与SSR标记的关联分析[J]. 苏艳,胡建斌,黄松,王盼乔,李琼. 农业生物技术学报. 2013(11)
[9]甜瓜果实相关性状QTL分析[J]. 张雪娇,高鹏,栾非时. 中国蔬菜. 2013(18)
[10]中国甜瓜种质资源形态性状遗传多样性分析[J]. 胡建斌,马双武,简在海,王吉明,李琼,苏艳. 植物遗传资源学报. 2013(04)
博士论文
[1]黄瓜种质遗传多样性的形态和分子评价及其亲缘关系研究[D]. 李锡香.中国农业科学院 2002
本文编号：3181771
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/yylw/3181771.html
