黄秋葵对南方根结线虫抗性的转录组分析

发布时间：2021-05-31 16:03

　　为了解黄秋葵抗南方根结线虫相关基因组学,利用Illumina Hi-seq TM2500高通量测序技术研究受南方根结线虫侵染后黄秋葵种质12C2转录组基因的差异表达。结果表明,接种南方根结线虫18 h后,从接种和未接种的黄秋葵种质12C2根尖中共获得71.49 Gb有效数据,Q30碱基百分比均达到94.0%以上。共获得2 318个差异表达基因（DEGs）,包括1 156个上调基因,1 162个下调基因,其中功能注释基因2 202个。根据unigene库序列进行GO、KOG和KEGG注释,细胞壁代谢相关基因——内切葡聚糖酶基因家族、聚半乳糖醛酸酶基因家族、葡聚糖内-1,3-β葡糖苷酶基因家族和果胶裂解酶基因家族下调表达,植物激素代谢相关基因——生长素响应蛋白基因、生长素流入运输载体基因下调表达,茉莉酸合成酶基因上调表达,调控相关基因表达的WRKY和MYB转录因子基因家族上调表达,参与植物细胞的膜联蛋白基因家族上调表达,植物细胞周期蛋白基因家族下调表达。本研究结果为开展黄秋葵抗南方根结线虫基因组学和分子生物学研究奠定了基础。 

【文章来源】：核农学报. 2020,34(12)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

差异表达基因KOG功能注释

【参考文献】：
期刊论文
[1]黄秋葵根结线虫病的病原鉴定[J]. 练冬梅,赖正锋,姚运法,洪建基.  福建农业科技. 2019(03)
[2]黄秋葵花和果荚转录组测序及类黄酮代谢差异表达分析[J]. 姚运法,张少平,练冬梅,赖正锋,黄慧明,洪建基.  西北植物学报. 2018(11)
[3]超声波辅助提取秋葵果胶工艺优化及理化性质分析[J]. 吴剑夫,程安玮,孙金月,祝霞.  核农学报. 2018(10)
[4]紫色黄秋葵转录组功能基因测序及分析[J]. 张少平,邱珊莲,郑云云,张帅,吴松海,何炎森,郑开斌.  核农学报. 2017(04)
[5]植物膜联蛋白基因研究进展[J]. 王立科,张边江,唐宁,杨平,周峰,陈全战.  分子植物育种. 2016(08)
[6]非模式生物转录组研究[J]. 刘红亮,郑丽明,刘青青,权富生,张涌.  遗传. 2013(08)
[7]茉莉酸合成相关基因Spr2与LePrs在番茄抗根结线虫中的作用[J]. 张立宁,程继鸿,杨瑞,孙中华,吴春霞,王绍辉.  中国农业科学. 2011(19)
[8]黄秋葵的应用价值及栽培技术研究进展[J]. 刘东祥,叶花兰,刘国道.  安徽农业科学. 2006(15)

博士论文
[1]烟草对南方根结线虫抗性机理研究[D]. 邢雪霞.河南农业大学 2018
[2]辣椒与根结线虫不亲和互作相关基因的分离及功能分析[D]. 茆振川.西北农林科技大学 2007



本文编号：3208546