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海水胁迫下葡萄根系代谢的机理研究

发布时间:2021-08-13 14:05
  本文以贝达和3309C两个耐盐性差异较大的葡萄砧木品种为实验材料,研究了海水胁迫下葡萄根系生长、根际微生态环境、叶绿素荧光参数及光合能力等变化,并对盐胁迫下转录组数据进行分析,为葡萄海水胁迫下代谢反应提供理论依据。试验结果如下:1.海水胁迫下葡萄总根长、根尖数、根系体积以及根系表面积均受抑制。与3309C相比,海水胁迫下的贝达下降幅度较大,总根长、根尖数、根系体积以及根系表面积降低了29.1%、23.3%、49.0%、36.3%。2.海水胁迫下葡萄光合指标和荧光参数均受抑制。海水胁迫下3309C与贝达的蒸腾速率下降了55.8%、71.1%,净光合速率下降了34.1%、51.4%。贝达的下降程度明显高于3309C。3309C与贝达的细胞间CO2浓度分别上升了29.9%、59.9%。贝达的增幅程度明显大于3309C。海水胁迫下3309C和贝达的荧光参数的下降显著,其中3309C和贝达的qP分别下降了38.6%、62.9%;Yield分别下降了41.9%、62.3%;ETR分别下降了40.3%、49.2%。贝达降幅显著大于3309C。3.海水胁迫下葡萄根系植物琥珀酸脱氢... 

【文章来源】:浙江农林大学浙江省

【文章页数】:63 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

海水胁迫下葡萄根系代谢的机理研究


图5-1两个品种的葡萄根系总RNA的1%琼脂糖凝胶电泳图

基因,散点图,品种,聚类分析


3309C-SW vs 3309C-CK 贝达-SW vs 贝达-CK图 5-2 两个品种表达量散点图和基因相对表达量Figure 5-2 Scatter plot and relative gene expression of two varieties.5.2.2 差异基因聚类分析表达模式相似的基因通常具有相似的功能,Cluster 分析软件将贝达和 3309C 的对照和海水胁迫样品放在一起做聚类分析,聚类结果如下图 5-3 示,每列分别代表贝达-CK、3309C-CK、贝达-SW 和 3309C-SW,每行代表一个基因,不同表达情况用不同颜色表示,红色代表上调,蓝色代表下调。将两个样品具有相似表达情况的特定基因聚类在一起,有些基因在不同条件下的表达量存在较大差异,猜测这些基因在海水胁迫下启动不同的调控机制适应外界胁迫。根据表达量及基因功能的相似性,可以通过已知功能基因序列深入探讨其未知功能基因。

聚类图,差异表达基因,功能分析,功能注释


图 5-3 两个品种的差异基因聚类图Figure 5-3 Cluster map of differential gene in two varieties.3 差异基因 GO 功能分析GO 功能分析不仅可以提供差异表达基因的 GO 功能分类的注释,另一方面差异表达基因的 GO 功能所呈现出的显著性富集分析。通过与整个基因组背发现显着富集高表达基因的 Term。图 5-4 为差异表达基因 GO 注释聚类图,纵坐标代表基因数目,对所有基因达基因进行整体 GO 分类,贝达和 3309C 的描述细胞组件均有 15 类,描述的有 15 类,描述参与生物过程的有 15 类。根据公司在 NCBI 数据库和其他对,有 195 个差异表达基因,发现它们都有明确的功能注释,他们都有相应多个 GO 号。309C3—KC贝达—KC贝达—WS309C3—WS

【参考文献】:
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本文编号:3340566

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