越橘杜鹃花类菌根共生相关miRNA前体克隆及功能初探

发布时间：2021-08-20 04:39

　　越橘的果实富含碳水化合物及多种微量元素,具有多种生理活性功能。在自然界中,越橘根系一般会与真菌共生形成菌根,其可促进越橘对营养和水分的吸收,增加越橘对环境胁迫的抵抗能力。侵染越橘的菌根真菌为内生菌根真菌,专性寄生杜鹃花科植物,被称为杜鹃花类菌根真菌（Ericoid mycorrhizal fungi,EMF）。大量研究显示MicroRNA（miRNA）在菌根形成过程中起着重要作用,为挖掘菌根共生相关miRNA并了解其作用机制,本研究从菌根侵染过程中差异表达的miRNA入手,分析其靶基因功能以及miRNA对其靶基因的调控作用;并通过miRNA过表达及沉默策略分析miRNA前体功能。研究结果如下:（1）以越橘组培苗为材料,对越橘根系接种杜鹃花类菌根真菌Cryptosporiopsis ericae菌株ZE103;对未接种及接种一、二、三周的越橘毛根组织实施转录组测序。对过滤后的转录组原始数据进行挖掘,筛选出9种差异表达miRNA的靶基因Unigene。对149个miRNA靶基因的GO富集分析显示,miRNA靶基因主要富集于细胞（Cell）、细胞结构（Cell part）、细胞器（Organ... 

【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２－１转录组ｄｅ?ｎｏｖｏ组装图解??Ｆｉｇｕｒｅ?２－１?Ｓｃｈｅｍａｔｉｃ?ｏｖｅｒｖｉｅｗ?ｏｆ?ｔｈｅ?ａｓｓｅｍｂｌｙ?ｐｒｏｃｅｓｓ?ｉｎ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ?ｄｅ?ｎｏｖｏ??

图２－３?９种ｍｉＲＮＡ预测?

调控作用。??Ｌｅｖｅｌ２?ＧＯ?ｔｅｒｍｓ?ｏｆ?ａｌｌ??１２０?１?卜?７９．４７??１００－?ｒ?６６．２３??１｜」丨｜上??ｋ曙丨??／?？、?＾?＾?ｃ／?ｐｊ－ｎｃｅｓｓ．??／?穿》．?／?＾?－ｉｌｉｊｉａ？?Ｃｏｍｎｏ＾ｎｔ??Ｉ?§?／?／?Ｗｏｉｅｃｕｉａｒ?Ｆｉｍｃｔｉｃｒ：??／?／?／?／?／?／??Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ?Ｐｒｏｃｅｓｓ?Ｃｅｌｌｕｌａｒ?Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ?Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ?Ｆｕｎｃｔｉｏｎ??图２－４差异ｍｉＲＮＡ靶基因ＧＯ二级Ｔｅｒｍ注释结果??Ｆｉｇｕｒｅ?２－４?Ｓｅｃｏｎｄａｒｙ?ＧＯ－ｔｅｒｍ?ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ?ｒｅｓｕｌｔ?ｏｆ?ｔａｒｇｅｔ?ｇｅｎｅｓ?ｃｕｔ?ｂｙ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ??ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｍｉＲＮＡｓ??２．３．４?９种ｍｉＲＮＡ朝基因的ＫＥＧＧ通路分析??ＫＥＧＧ功能富集结果显示，９种ｍｉＲＮＡ靶基因可富集至２２条调控途径。依据各通??路的大类进行排序，基因信息处理（Ｇｅｎｅｔｉｃ?ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ?ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ）及代谢（Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ）??类所包含的基因数较多，分别为６８和６５个。在各调控途径中，剪接体调控途径??（Ｓｐｌｉｃｅｓｏｍｅ．?ｋｏ０３０４０?）、内质网蛋白加工途径（Ｐｒｏｔｅｉｎ?ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ?ｉｎ?ｅｎｄｏｐｌａｓｍｉｃ??ｒｅｔｉｃｕｌｕｍ．?ｋｏ０４１４１?）、核糖体生物发生途径（Ｒｉｂｏｓｏｍｅ?ｂｉｏｇｅｎｅｓｉｓ?ｉｎ?ｅｕｋａｒｙｏｔｅｓ．?ｋｏ０３００８）??及胞吞作用调控途径（Ｅｎｄ〇Ｃｙｔ〇Ｓｉｓ，ｋ〇０４１４４）富集的基因数

【参考文献】：
期刊论文
[1]菌根真菌提高植物耐盐性的研究进展[J]. 张建峰,谢金宏,田磊,吉丽,陈德国,田春杰.  北方园艺. 2019(23)
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[3]丛枝菌根真菌提高林木抗逆性机制研究进展[J]. 胡华英,曹升,张虹,周垂帆,何宗明,马祥庆.  世界林业研究. 2019(02)
[4]改进茎环引物RT-PCR法实时定量检测microRNA[J]. 薛慧慧,马骁骁,朱长保,晁天柱,肖君华,周宇荀.  现代生物医学进展. 2014(28)

博士论文
[1]矿质养分对枳（Poncirus trifoliata L.Raf）根毛生长发育的影响及其与丛枝菌根形成的关系[D]. 曹秀.华中农业大学 2014



本文编号：3352830