醋栗番茄（Solanum pimpinellifolium）RIL群体苗期耐盐耐旱QTL定位
发布时间：2021-08-23 22:42
随着全球淡水资源日趋减少和土壤盐渍化程度的不断加剧,干旱和盐害已成为影响作物可持续生产的主要非生物胁迫因子。蔬菜作物喜肥水,其产量和品质易受干旱和盐胁迫的影响,其中仅次于马铃薯的第二大蔬菜作物番茄（Solanum lycopersicum）对盐胁迫中度敏感,对干旱敏感。而鉴于现有栽培种番茄遗传背景狭窄,其耐盐和耐旱遗传改良一直较为缓慢。相反,一些番茄的野生或野生近缘种生长在环境条件极度恶劣的安第斯山脉或太平洋沿岸,通过漫长演化,适应了干旱和盐碱环境条件,蕴含优异的抗逆基因,为未来番茄耐旱和耐盐碱遗传改良提供了可能。本论文以耐盐、耐旱性较强的醋栗番茄（S.pimpinellifolium）PI365967（PI）和普通栽培种番茄Moneymaker（MM）为亲本,构建了一个F10代重组自交系（Recombinant Inbred Line,RIL）群体,并对其进行了苗期耐盐、耐旱性鉴定,采用全基因组低倍重测序（1.5×）策略,定位了番茄苗期耐盐和耐旱相关的QTL,并预测了候选基因,从基因组水平探讨了其耐盐和耐旱机制,主要研究结果概括如下:（1）以栽培种Moneymaker为母本,野生醋栗...
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：63 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
英文缩略表
第一章 绪论
1.1 番茄的耐盐耐旱研究进展
1.1.1 番茄的耐盐和耐旱性
1.1.2 番茄耐盐和耐旱遗传资源
1.1.3 番茄耐盐和耐旱鉴定方法
1.1.4 番茄耐盐和耐旱基因/QTLs的挖掘
1.1.5 番茄耐盐和耐旱遗传改良现状
1.2 重组自交系及其研究进展
1.2.1 重组自交系（RIL）群体及其利用
1.2.2 番茄RIL群体的利用现状
1.3 全基因组重测序及其在基因定位中的应用
1.3.1 全基因组重测序
1.3.2 全基因组重测序在基因定位中的应用
1.3.3 全基因组关联分析在番茄作物研究的现状
1.4 本研究的目的和技术路线
1.4.1 研究目的
1.4.2 技术路线
第二章 S. pimpinellifolium RIL群体及遗传图谱的构建
2.1 材料与方法
2.1.1 试验材料
2.1.2 试验方法
2.1.3 种子收获及保存
2.1.4 表型调查
2.1.5 数据统计与分析
2.1.6 遗传连锁图谱构建
2.2 结果与分析
2.2.1 RIL群体的构建
2.2.2 醋栗番茄PI365967 RIL群体表型性状分析
2.2.3 RIL群体遗传连锁图谱的构建
2.3 讨论
2.3.1 RIL群体的构建
2.3.2 醋栗番茄遗传连锁图谱的利用现状
第三章 S. pimpinellifolium RIL群体苗期耐盐QTL定位
3.1 材料与方法
3.1.1 试验材料
3.1.2 盐处理方法
3.1.3 盐害调查
3.1.4 表型数据及GWAS分析
3.2 结果与分析
3.2.1 RIL群体苗期耐盐鉴定
3.2.2 RIL群体苗期耐盐QTL定位
3.3 讨论
3.3.1 番茄苗期耐盐表型鉴定
3.3.2 番茄苗期耐盐QTL定位
3.3.3 S. pimpinellifolium PI365967耐盐机制分析
第四章 S. pimpinellifolium RIL群体苗期耐旱QTL定位
4.1 材料与方法
4.1.1 试验材料
4.1.2 干旱处理方法
4.1.3 耐旱分级
4.1.4 统计分析
4.2 结果与分析
4.2.1 RIL群体苗期耐旱鉴定
4.2.2 苗期耐旱性QTL的精细定位
4.3 讨论
4.3.1 番茄耐旱QTL定位
4.3.2 番茄耐旱候选基因分析
第五章 全文结论
参考文献
附录
附表
致谢
作者简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国近60年干旱演变特征分析[J]. 刘小龙,虞美秀. 干旱区资源与环境. 2015(12)
[2]论我国土壤保护宏观战略[J]. 赵其国,骆永明. 中国科学院院刊. 2015(04)
[3]中国盐渍土资源现状及改良利用对策[J]. 杨真,王宝山. 山东农业科学. 2015(04)
[4]玉米锌指蛋白基因ZmAN14过表达转基因烟草对非生物胁迫的响应[J]. 宣宁,柳絮,张华,陈高,刘国霞,边斐,姚方印. 中国农业科学. 2015(05)
[5]利用重组自交系群体构建番茄AFLP遗传连锁图谱[J]. 陈丽静,王利,王玉坤,陶承光,李君明,王晓武,李天来. 园艺学报. 2012(12)
[6]利用渐渗系群体初步定位番茄苗期耐旱QTL[J]. 刘磊,宋燕,李君明. 园艺学报. 2011(10)
[7]茄子甲硫氨酸亚砜还原酶（SmMsrA）基因cDNA全长的克隆和分析[J]. 张映,陈钰辉,张振贤,方智远,连勇,刘富中. 园艺学报. 2011(08)
[8]番茄芽期耐盐QTL定位及其效应的初步分析[J]. 余庆辉,王柏柯,刘磊,杨生保,杨涛,李君明,侯喜林. 西北植物学报. 2010(09)
[9]利用Solanum pennellii LA716渐渗系群体对番茄苗期耐盐QTLs进行定位及QTL效应的初步分析[J]. 余庆辉,刘磊,王柏柯,杨生保,杨涛,李君明,侯喜林. 中国农业科学. 2010(04)
[10]PEG胁迫下新疆主要加工番茄萌芽期耐旱性评价[J]. 张余洋,王文杰,郭玲,于军,李汉霞. 中国农学通报. 2009(24)
博士论文
[1]白菜花青苷和黄酮醇苷自然变异及遗传机制研究[D]. 郭宁.中国农业科学院 2014
[2]番茄非生物逆境基因的鉴定及作用机理解析[D]. 李金华.华中农业大学 2013
[3]利用野生番茄Solanum pennellii LA716渐渗系群体进行番茄耐盐相关QTLs定位[D]. 余庆辉.南京农业大学 2011
[4]基于潘那利番茄渐渗系发掘干旱胁迫响应基因及功能分析[D]. 弓鹏娟.华中农业大学 2010
硕士论文
[1]野生种番茄Solanum pennellii苗期耐盐主效QTL的精细定位[D]. 周龙溪.中国农业科学院 2013
[2]基于重测序数据的群体SNP位点检测及基因型判断[D]. 何伟明.华南理工大学 2013
[3]利用拟南芥BOUNTIFUL和HARDY基因以及表皮蜡质合成基因提高番茄耐旱和耐盐性[D]. 孙玉燕.中国农业科学院 2012
[4]转codA基因番茄提高耐盐性的研究[D]. 张文.山东农业大学 2012
[5]番茄特异PCR遗传连锁图谱的构建及苗期耐盐QTL定位[D]. 张艳芳.内蒙古农业大学 2008
本文编号：3358727
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：63 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
英文缩略表
第一章 绪论
1.1 番茄的耐盐耐旱研究进展
1.1.1 番茄的耐盐和耐旱性
1.1.2 番茄耐盐和耐旱遗传资源
1.1.3 番茄耐盐和耐旱鉴定方法
1.1.4 番茄耐盐和耐旱基因/QTLs的挖掘
1.1.5 番茄耐盐和耐旱遗传改良现状
1.2 重组自交系及其研究进展
1.2.1 重组自交系（RIL）群体及其利用
1.2.2 番茄RIL群体的利用现状
1.3 全基因组重测序及其在基因定位中的应用
1.3.1 全基因组重测序
1.3.2 全基因组重测序在基因定位中的应用
1.3.3 全基因组关联分析在番茄作物研究的现状
1.4 本研究的目的和技术路线
1.4.1 研究目的
1.4.2 技术路线
第二章 S. pimpinellifolium RIL群体及遗传图谱的构建
2.1 材料与方法
2.1.1 试验材料
2.1.2 试验方法
2.1.3 种子收获及保存
2.1.4 表型调查
2.1.5 数据统计与分析
2.1.6 遗传连锁图谱构建
2.2 结果与分析
2.2.1 RIL群体的构建
2.2.2 醋栗番茄PI365967 RIL群体表型性状分析
2.2.3 RIL群体遗传连锁图谱的构建
2.3 讨论
2.3.1 RIL群体的构建
2.3.2 醋栗番茄遗传连锁图谱的利用现状
第三章 S. pimpinellifolium RIL群体苗期耐盐QTL定位
3.1 材料与方法
3.1.1 试验材料
3.1.2 盐处理方法
3.1.3 盐害调查
3.1.4 表型数据及GWAS分析
3.2 结果与分析
3.2.1 RIL群体苗期耐盐鉴定
3.2.2 RIL群体苗期耐盐QTL定位
3.3 讨论
3.3.1 番茄苗期耐盐表型鉴定
3.3.2 番茄苗期耐盐QTL定位
3.3.3 S. pimpinellifolium PI365967耐盐机制分析
第四章 S. pimpinellifolium RIL群体苗期耐旱QTL定位
4.1 材料与方法
4.1.1 试验材料
4.1.2 干旱处理方法
4.1.3 耐旱分级
4.1.4 统计分析
4.2 结果与分析
4.2.1 RIL群体苗期耐旱鉴定
4.2.2 苗期耐旱性QTL的精细定位
4.3 讨论
4.3.1 番茄耐旱QTL定位
4.3.2 番茄耐旱候选基因分析
第五章 全文结论
参考文献
附录
附表
致谢
作者简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国近60年干旱演变特征分析[J]. 刘小龙,虞美秀. 干旱区资源与环境. 2015(12)
[2]论我国土壤保护宏观战略[J]. 赵其国,骆永明. 中国科学院院刊. 2015(04)
[3]中国盐渍土资源现状及改良利用对策[J]. 杨真,王宝山. 山东农业科学. 2015(04)
[4]玉米锌指蛋白基因ZmAN14过表达转基因烟草对非生物胁迫的响应[J]. 宣宁,柳絮,张华,陈高,刘国霞,边斐,姚方印. 中国农业科学. 2015(05)
[5]利用重组自交系群体构建番茄AFLP遗传连锁图谱[J]. 陈丽静,王利,王玉坤,陶承光,李君明,王晓武,李天来. 园艺学报. 2012(12)
[6]利用渐渗系群体初步定位番茄苗期耐旱QTL[J]. 刘磊,宋燕,李君明. 园艺学报. 2011(10)
[7]茄子甲硫氨酸亚砜还原酶（SmMsrA）基因cDNA全长的克隆和分析[J]. 张映,陈钰辉,张振贤,方智远,连勇,刘富中. 园艺学报. 2011(08)
[8]番茄芽期耐盐QTL定位及其效应的初步分析[J]. 余庆辉,王柏柯,刘磊,杨生保,杨涛,李君明,侯喜林. 西北植物学报. 2010(09)
[9]利用Solanum pennellii LA716渐渗系群体对番茄苗期耐盐QTLs进行定位及QTL效应的初步分析[J]. 余庆辉,刘磊,王柏柯,杨生保,杨涛,李君明,侯喜林. 中国农业科学. 2010(04)
[10]PEG胁迫下新疆主要加工番茄萌芽期耐旱性评价[J]. 张余洋,王文杰,郭玲,于军,李汉霞. 中国农学通报. 2009(24)
博士论文
[1]白菜花青苷和黄酮醇苷自然变异及遗传机制研究[D]. 郭宁.中国农业科学院 2014
[2]番茄非生物逆境基因的鉴定及作用机理解析[D]. 李金华.华中农业大学 2013
[3]利用野生番茄Solanum pennellii LA716渐渗系群体进行番茄耐盐相关QTLs定位[D]. 余庆辉.南京农业大学 2011
[4]基于潘那利番茄渐渗系发掘干旱胁迫响应基因及功能分析[D]. 弓鹏娟.华中农业大学 2010
硕士论文
[1]野生种番茄Solanum pennellii苗期耐盐主效QTL的精细定位[D]. 周龙溪.中国农业科学院 2013
[2]基于重测序数据的群体SNP位点检测及基因型判断[D]. 何伟明.华南理工大学 2013
[3]利用拟南芥BOUNTIFUL和HARDY基因以及表皮蜡质合成基因提高番茄耐旱和耐盐性[D]. 孙玉燕.中国农业科学院 2012
[4]转codA基因番茄提高耐盐性的研究[D]. 张文.山东农业大学 2012
[5]番茄特异PCR遗传连锁图谱的构建及苗期耐盐QTL定位[D]. 张艳芳.内蒙古农业大学 2008
本文编号：3358727
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