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基于转录组测序的苦瓜热激蛋白相关基因分析

发布时间:2021-08-24 18:25
  为获得苦瓜叶片高温胁迫状态下表达的相关基因,本研究以高温胁迫下苦瓜叶片为实验材料,采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术对正常温度(26℃)和高温胁迫(38℃)下苦瓜叶片转录测序后进行组装,再利用KEGG、Pfam、Swiss-Prot和NR数据库平台对热激蛋白的相关功能基因筛选,共获得24个热激蛋白相关基因,包括得20个热激蛋白基因、2个位于叶绿体中的小热激蛋白以及2个热激转录因子。聚类分析研究表明,涉及到热激蛋白相关的20个Unigene广泛分布于3大类中,其中c42567和c43094这两个亲缘关系最近;两个小热激蛋白c42963和c12133的亲缘关系次之;c35683和c3040两个热激转录因子亲缘关系最远。通过本次研究中获取的24个热激蛋白相关Unigene信息,有助于深入研究苦瓜耐高温胁迫机理等提供数据信息。 

【文章来源】:分子植物育种. 2020,18(10)北大核心CSCD

【文章页数】:9 页

【部分图文】:

基于转录组测序的苦瓜热激蛋白相关基因分析


24个热激蛋白相关Unigene亲缘关系分析

【参考文献】:
期刊论文
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硕士论文
[1]低温胁迫下西葫芦转录组分析与SSR分子标记开发[D]. 张宏亮.山西农业大学 2015



本文编号:3360495

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