番茄Ty基因对TYLCV复制、转录和移动的影响及TYLCV侵染后番茄的转录组分析
发布时间：2021-09-08 21:25
番茄黄化曲叶病毒病是一类由双生病毒引起的重要病害,对番茄生产危害极大。源于野生番茄抗性基因的应用显著防止了该病的发生。为深入了解番茄Ty基因与病毒间的互作,本试验从两个方面进行研究:（1）分别选择含有Ty-2、Ty-1/Ty-3、Ty-1/Ty-3a、Ty-4和Ty-5的番茄材料,以我国主流TYLCV株系TYLCV-IL[CN:SH2]为病毒材料进行苗期接种,使用荧光定量PCR检测技术,研究Ty抗性基因对TYLCV复制、转录和移动的影响;（2）TYLCV侵染28 d后,对Ty-1/Ty-3番茄近等基因系进行转录组分析,研究Ty-1/Ty-3对TYLCV的抗性机制。主要研究结果如下:1.Ty-2具有较好的抑制病毒复制的能力,且不受季节影响;Ty-1/Ty-3有一定抑制病毒复制的能力,但抑制病毒复制的能力弱于Ty-2;Ty-1/Ty-3a和ty-5对TYLCV复制的抑制均受季节影响,春季温度低时,对TYLCV复制有强抑制性,秋季温度高时,抑制力下降;Ty-4春季抑制TYLCV的能力较弱,秋季几乎没有抑制力。2.Ty-2能有效抑制病毒表达,且不受季节影响。春季Ty-1/Ty-3有一定抑制TY...
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：81 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
英文缩略表
第一章 引言
1.1 TYLCD的分布
1.2 TYLCD的影响因素及发病症状
1.3 TYLCD的传毒介体和传毒特性
1.4 TYLCV的研究
1.4.1 TYLCD病原
1.4.2 TYLCV病毒基因组结构
1.4.3 病毒的侵染
1.4.4 病毒的复制
1.4.5 病毒的转录
1.4.6 病毒的移动
1.5 病毒的致病机理
1.6 番茄抗Ty基因简介
1.7 番茄与TYLCV的互作
1.8 试验设计
第二章 番茄Ty基因对TYLCV复制的影响
2.1 试验材料
2.1.1 试验样品
2.1.2 主要试剂及仪器设备
2.2 试验方法
2.2.1 pBinPLUS-SH2-1.4A的培养及提取
2.2.2 番茄苗的培养
2.2.3 接种病毒
2.2.4 DNA的提取
2.2.5 引物的设计及PCR检测
2.2.6 荧光定量PCR反应体系及条件
2.2.7 绝对定量标准曲线的制备
2.2.8 荧光定量PCR分析
2.3 结果与分析
2.3.1 TYLCV的特异引物
2.3.2 TYLCV绝对定量标准曲线
2.3.3 春季和秋季不同基因型番茄材料中TYLCV的拷贝情况
2.4 讨论
第三章 番茄Ty基因对TYLCV表达的影响
3.1 试验材料
3.1.1 试验样品
3.1.2 主要试剂及仪器设备
3.2 试验方法
3.2.1 试验材料的处理
3.2.2 RNA的提取及cDNA第一条链的合成
3.2.3 引物的设计及PCR检测
3.2.4 荧光定量PCR反应体系及条件
3.2.5 标准曲线的绘制及转录物的定量与分析
3.3 结果与分析
3.3.1 TYLCV的6个基因特异引物的设计
3.3.2 TYLCV各基因的绝对定量标准曲线
3.3.3 不同基因型番茄材料中TYLCV各基因的表达情况
3.4 讨论
第四章 番茄Ty基因对TYLCV移动的影响
4.1 试验材料
4.2 试验方法
4.3 试验结果与分析
4.3.1 TYLCV在番茄材料中的移动情况
4.3.2 供试番茄材料的发病情况
4.4 讨论
第五章 TYLCV侵染番茄的转录组分析
5.1 试验材料及试剂
5.2 材料处理
5.3 转录组的测序与分析
5.3.1 Illunima测序
5.3.2 基因组参考序列比对
5.3.3 基因表达量的注释
5.3.4 基因差异表达分析
5.3.5 GO功能注释及功能分析
5.3.6 KEGG pathway分析
5.4 试验结果
5.4.1 测序产量统计、序列质量评价
5.4.2 差异表达基因的筛选
5.4.3 差异基因的GO富集分析
5.4.4 KEGG代谢通路分析
5.4.5 光合作用途径中差异表达的基因
5.4.6 Ty-1/Ty-3 候选基因的表达情况
5.5 讨论
全文结论
参考文献
附录
致谢
作者简历
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物中依赖RNA的RNA聚合酶6（RDR6）研究进展[J]. 吴冰月,陈华涛,许晓明,崔瑾,陈新. 华北农学报. 2013(S1)
[2]番茄黄化曲叶病毒的实时荧光定量PCR检测[J]. 林铭,胡鸿,杜永臣,高建昌,王孝宣,国艳梅. 中国蔬菜. 2013(02)
[3]番茄黄化曲叶病毒侵染对番茄叶片光合及荧光特性的影响[J]. 于力,阎君,郭世荣,黑银秀,许爽,朱为民. 上海农业学报. 2012(03)
[4]番茄黄化曲叶病研究进展[J]. 张爱红,刘帅,邸垫平,孙茜,苗洪芹. 河北农业科学. 2010(08)
[5]我国番茄黄化曲叶病发生规律和研究进展[J]. 李小靖,叶志彪. 长江蔬菜. 2010(02)
[6]番茄黄化曲叶病及其抗病育种研究进展[J]. 余文贵,赵统敏,杨玛丽,赵丽萍. 江苏农业学报. 2009(04)
[7]B型烟粉虱的入侵机理与控制基础——国家重点基础研究发展计划“农林危险生物入侵机理与控制基础研究”进展[J]. 万方浩,张桂芬,刘树生,罗晨,褚栋,张友军,臧连生,纠敏,吕志创,崔旭红,张丽萍,张帆,张青文,刘万学,梁沛,雷仲仁,张永军. 中国科学（C辑:生命科学）. 2009(02)
[8]侵染广西烟草的中国番茄黄化曲叶病毒及其伴随的卫星DNA分子的基因组特征[J]. 徐幼平,周雪平. 微生物学报. 2006(03)
[9]侵染云南白肋烟的中国番茄黄化曲叶病毒及伴随卫星DNA分子的基因组特征[J]. 李桂新,范三微,李正和,谢艳,周雪平. 农业生物技术学报. 2003(05)
[10]黄瓜花叶病毒对烟草叶片和叶绿体光合活性的影响[J]. 王春梅,施定基,朱水芳,田波,魏宁生. 植物学报. 2000(04)
博士论文
[1]侵染我国番茄双生病毒种类鉴定及致病性分析[D]. 张辉.浙江大学 2009
[2]烟粉虱、二种植物双生病毒（TYLCCNV、TbCSV）和寄主植物三者之间的互作[D]. 纠敏.浙江大学 2006
硕士论文
[1]不同番茄抗病基因型和温度对TYLCV复制的影响[D]. 林铭.中国农业科学院 2013
本文编号：3391512
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：81 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
英文缩略表
第一章 引言
1.1 TYLCD的分布
1.2 TYLCD的影响因素及发病症状
1.3 TYLCD的传毒介体和传毒特性
1.4 TYLCV的研究
1.4.1 TYLCD病原
1.4.2 TYLCV病毒基因组结构
1.4.3 病毒的侵染
1.4.4 病毒的复制
1.4.5 病毒的转录
1.4.6 病毒的移动
1.5 病毒的致病机理
1.6 番茄抗Ty基因简介
1.7 番茄与TYLCV的互作
1.8 试验设计
第二章 番茄Ty基因对TYLCV复制的影响
2.1 试验材料
2.1.1 试验样品
2.1.2 主要试剂及仪器设备
2.2 试验方法
2.2.1 pBinPLUS-SH2-1.4A的培养及提取
2.2.2 番茄苗的培养
2.2.3 接种病毒
2.2.4 DNA的提取
2.2.5 引物的设计及PCR检测
2.2.6 荧光定量PCR反应体系及条件
2.2.7 绝对定量标准曲线的制备
2.2.8 荧光定量PCR分析
2.3 结果与分析
2.3.1 TYLCV的特异引物
2.3.2 TYLCV绝对定量标准曲线
2.3.3 春季和秋季不同基因型番茄材料中TYLCV的拷贝情况
2.4 讨论
第三章 番茄Ty基因对TYLCV表达的影响
3.1 试验材料
3.1.1 试验样品
3.1.2 主要试剂及仪器设备
3.2 试验方法
3.2.1 试验材料的处理
3.2.2 RNA的提取及cDNA第一条链的合成
3.2.3 引物的设计及PCR检测
3.2.4 荧光定量PCR反应体系及条件
3.2.5 标准曲线的绘制及转录物的定量与分析
3.3 结果与分析
3.3.1 TYLCV的6个基因特异引物的设计
3.3.2 TYLCV各基因的绝对定量标准曲线
3.3.3 不同基因型番茄材料中TYLCV各基因的表达情况
3.4 讨论
第四章 番茄Ty基因对TYLCV移动的影响
4.1 试验材料
4.2 试验方法
4.3 试验结果与分析
4.3.1 TYLCV在番茄材料中的移动情况
4.3.2 供试番茄材料的发病情况
4.4 讨论
第五章 TYLCV侵染番茄的转录组分析
5.1 试验材料及试剂
5.2 材料处理
5.3 转录组的测序与分析
5.3.1 Illunima测序
5.3.2 基因组参考序列比对
5.3.3 基因表达量的注释
5.3.4 基因差异表达分析
5.3.5 GO功能注释及功能分析
5.3.6 KEGG pathway分析
5.4 试验结果
5.4.1 测序产量统计、序列质量评价
5.4.2 差异表达基因的筛选
5.4.3 差异基因的GO富集分析
5.4.4 KEGG代谢通路分析
5.4.5 光合作用途径中差异表达的基因
5.4.6 Ty-1/Ty-3 候选基因的表达情况
5.5 讨论
全文结论
参考文献
附录
致谢
作者简历
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物中依赖RNA的RNA聚合酶6（RDR6）研究进展[J]. 吴冰月,陈华涛,许晓明,崔瑾,陈新. 华北农学报. 2013(S1)
[2]番茄黄化曲叶病毒的实时荧光定量PCR检测[J]. 林铭,胡鸿,杜永臣,高建昌,王孝宣,国艳梅. 中国蔬菜. 2013(02)
[3]番茄黄化曲叶病毒侵染对番茄叶片光合及荧光特性的影响[J]. 于力,阎君,郭世荣,黑银秀,许爽,朱为民. 上海农业学报. 2012(03)
[4]番茄黄化曲叶病研究进展[J]. 张爱红,刘帅,邸垫平,孙茜,苗洪芹. 河北农业科学. 2010(08)
[5]我国番茄黄化曲叶病发生规律和研究进展[J]. 李小靖,叶志彪. 长江蔬菜. 2010(02)
[6]番茄黄化曲叶病及其抗病育种研究进展[J]. 余文贵,赵统敏,杨玛丽,赵丽萍. 江苏农业学报. 2009(04)
[7]B型烟粉虱的入侵机理与控制基础——国家重点基础研究发展计划“农林危险生物入侵机理与控制基础研究”进展[J]. 万方浩,张桂芬,刘树生,罗晨,褚栋,张友军,臧连生,纠敏,吕志创,崔旭红,张丽萍,张帆,张青文,刘万学,梁沛,雷仲仁,张永军. 中国科学（C辑:生命科学）. 2009(02)
[8]侵染广西烟草的中国番茄黄化曲叶病毒及其伴随的卫星DNA分子的基因组特征[J]. 徐幼平,周雪平. 微生物学报. 2006(03)
[9]侵染云南白肋烟的中国番茄黄化曲叶病毒及伴随卫星DNA分子的基因组特征[J]. 李桂新,范三微,李正和,谢艳,周雪平. 农业生物技术学报. 2003(05)
[10]黄瓜花叶病毒对烟草叶片和叶绿体光合活性的影响[J]. 王春梅,施定基,朱水芳,田波,魏宁生. 植物学报. 2000(04)
博士论文
[1]侵染我国番茄双生病毒种类鉴定及致病性分析[D]. 张辉.浙江大学 2009
[2]烟粉虱、二种植物双生病毒（TYLCCNV、TbCSV）和寄主植物三者之间的互作[D]. 纠敏.浙江大学 2006
硕士论文
[1]不同番茄抗病基因型和温度对TYLCV复制的影响[D]. 林铭.中国农业科学院 2013
本文编号：3391512
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