苹果WRKY基因家族的鉴定、表达分析及MdWRKY118基因的功能验证
发布时间:2021-09-11 12:08
WRKY蛋白是一类存在于高等植物中的转录因子,具有十分广泛的作用,直接或间接参与植物生长、发育等生理过程,并且在植物应答非生物胁迫和生物胁迫中扮演着重要角色。本研究通过对苹果WRKY基因家族的鉴定和分析,解析其成员间的进化关系,并分析了部分WRKY基因在外源激素处理和真菌侵染过程中的表达谱。此外,利用转基因技术进一步研究了MdWRKY118的功能。主要研究结果如下:1、通过生物信息学的研究方法,从苹果基因组中鉴定出119个MdWRKY基因,并对其进化关系、基因结构、保守基序、染色体分布、基因重复等进行了分析。结果显示119个MdWRKY基因根据其WRKY保守结构域的类型可分为3种类型(Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ),而Ⅱ类成员又可以进一步分为5个亚类(Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅱd和Ⅱe)。其中,24个WRKY基因属于Ⅰ类,包含2个WRKY结构域,其锌指结构为C2H2。81个Ⅱ类成员的锌指结构同样为C2H2,但是它们只含有一个WRKY结构域。而14个Ⅲ类成员同样只有一个WRKY结构域,不同的是其锌指结构为C2HC型。我们发现在同组或同子组中的WRKY基因具有类似的内含子/外显子结构,并且其保守基序的分布也具有较...
【文章来源】:南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:93 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2-1苹果与拟南芥基因的系统进化树??Figure?2-1?Phylogenetic?trees?of?IVRKVgenes?in?apple?and?Arubiclopsis??
2结果与分析??2.1苹果叶片RNA的分离??本研宄中采用CTAB法提取苹果叶片RNA,如图3-1,?RNA带型完整清晰,其??OD260/OD28Q在1.8?2.2之间,浓度均在600?ng/吣以上,且反转录的cDNA呈弥散的??条带,可以用于荧光定量PCR的分析。??1??图3-1苹果叶片RNA及合成的cDNA??Figure?3-1?RNA?extracted?from?apple?leaves?and?cDNA?synthesis?of?the?RNA??2.2苹果WRKY基因家族在斑点落叶病菌侵染下表达情况的分析??很多研宄表明WRKY转录因子在响应生物胁迫中扮演着重要角色(Dong?et?al,??2003;?Guo?etal,2014;?Wang?et?al,2014;?Jiang?et?al,?2014)。通过转录组测序(RNA-seq)??34??
图3-3?13个苹果咖灯基因响应斑点落叶病菌侵染的表达分析??Fig?
【参考文献】:
期刊论文
[1]拟南芥果胶甲酯化酶基因PME17在抵御丁香假单胞杆菌番茄致病变种DC3000株中的功能[J]. 张倩,鲍依群,谭小云. 植物生理学报. 2015(07)
[2]富士苹果MdWRKY40b基因克隆及其对白粉病的抗性分析[J]. 罗昌国,袁启凤,裴晓红,吴亚维,郑伟,章镇. 西北植物学报. 2013(12)
[3]苹果斑点落叶病抗病性种质评价及遗传分析[J]. 吕松,王忆,张新忠,李天红,韩振海. 中国农业大学学报. 2012(04)
[4]几种杀菌剂防治苹果斑点落叶病田间药效试验[J]. 时春喜,黄磊,惠浩浩,姜军侠,白伟. 西北农业学报. 2011(11)
[5]几种果实不同组织总RNA提取及质量分析[J]. 李志强,李莹,陶建敏,乔玉山,渠慎春,章镇. 果树学报. 2008(05)
[6]植物抗逆相关ERF转录因子研究综述[J]. 刘武,戴良英. 中国农学通报. 2007(04)
[7]生长季苹果斑点落叶病流行主导因素的确定[J]. 胡同乐,曹克强,王树桐,甄文超. 植物病理学报. 2005(04)
本文编号:3392973
【文章来源】:南京农业大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:93 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2-1苹果与拟南芥基因的系统进化树??Figure?2-1?Phylogenetic?trees?of?IVRKVgenes?in?apple?and?Arubiclopsis??
2结果与分析??2.1苹果叶片RNA的分离??本研宄中采用CTAB法提取苹果叶片RNA,如图3-1,?RNA带型完整清晰,其??OD260/OD28Q在1.8?2.2之间,浓度均在600?ng/吣以上,且反转录的cDNA呈弥散的??条带,可以用于荧光定量PCR的分析。??1??图3-1苹果叶片RNA及合成的cDNA??Figure?3-1?RNA?extracted?from?apple?leaves?and?cDNA?synthesis?of?the?RNA??2.2苹果WRKY基因家族在斑点落叶病菌侵染下表达情况的分析??很多研宄表明WRKY转录因子在响应生物胁迫中扮演着重要角色(Dong?et?al,??2003;?Guo?etal,2014;?Wang?et?al,2014;?Jiang?et?al,?2014)。通过转录组测序(RNA-seq)??34??
图3-3?13个苹果咖灯基因响应斑点落叶病菌侵染的表达分析??Fig?
【参考文献】:
期刊论文
[1]拟南芥果胶甲酯化酶基因PME17在抵御丁香假单胞杆菌番茄致病变种DC3000株中的功能[J]. 张倩,鲍依群,谭小云. 植物生理学报. 2015(07)
[2]富士苹果MdWRKY40b基因克隆及其对白粉病的抗性分析[J]. 罗昌国,袁启凤,裴晓红,吴亚维,郑伟,章镇. 西北植物学报. 2013(12)
[3]苹果斑点落叶病抗病性种质评价及遗传分析[J]. 吕松,王忆,张新忠,李天红,韩振海. 中国农业大学学报. 2012(04)
[4]几种杀菌剂防治苹果斑点落叶病田间药效试验[J]. 时春喜,黄磊,惠浩浩,姜军侠,白伟. 西北农业学报. 2011(11)
[5]几种果实不同组织总RNA提取及质量分析[J]. 李志强,李莹,陶建敏,乔玉山,渠慎春,章镇. 果树学报. 2008(05)
[6]植物抗逆相关ERF转录因子研究综述[J]. 刘武,戴良英. 中国农学通报. 2007(04)
[7]生长季苹果斑点落叶病流行主导因素的确定[J]. 胡同乐,曹克强,王树桐,甄文超. 植物病理学报. 2005(04)
本文编号:3392973
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