香蕉在枯萎病诱导下microRNA的差异表达研究

发布时间：2021-09-29 03:09

　　miRNA（microRNA）是一类非编码的单链小分子RNA,约18-25nt长度,主要对靶基因进行转录后调控。miRNA的表达比编码基因更加迅速,翻译过程不受影响,对目标基因的调控效率较高,在植物的生长发育、逆境胁迫、表观遗传等方面起着非常重要的作用。本实验联合采用高通量小RNA测序和降解组测序技术,以香蕉品种“巴西蕉”及尖孢镰刀菌古巴专化型4号小种为遗传材料,构建病原菌侵染四个阶段的小RNA库和降解组库,结合生物信息学分析,建立香蕉在病原菌诱导下不同时段的miRNA差异表达谱,获得香蕉病理反应相关的已知miRNA和新miRNA,并确定各miRNA所对应的靶基因,通过qRT-PCR进行验证,解析香蕉在枯萎病菌诱导下的miRNA及其靶基因的表达模式和调控机理,为香蕉枯萎病的分子病理机制提供新的遗传信息和理论揭示：1、通过小RNA高通量技术进行测序,建立了四个小RNA库：Banana CK、 Banana 4h、Banana 24h、Banana 6d。分别得到16013204、16551770、17733937和18429778条序列。将高质量reads去接头、去污染、去polyA后,... 

【文章来源】：海南大学海南省 211工程院校

【文章页数】：128 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

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植物小RNA侧序流程图

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本文编号：3413078