新疆野核桃遗传连锁图谱的构建
发布时间：2021-10-08 01:02
新疆野生核桃（Juglans regia）即为我国栽培核桃的直系祖先,它是属于胡桃科、胡桃属植物。在我国主要分布于新疆伊犁巩留野核桃沟内,是我国极为珍稀的野生自然资源。但其在构建遗传连锁图谱及利用分子标记辅助育种方面,明显滞后于其他野生果树树种,目前,国内尚未有关于其图谱构建的报道。对选取的F1野核桃资源开展表型性状,分子标记遗传多样性及关联分析检测和评价,并采用DNA标记构建野核桃分子连锁图,将为新疆野核桃今后展开相关农艺性状的基因精细定位、QTL以及MAS选择育种等奠定科学基础。本研究以野核桃沟的野核桃母本与父本及其杂交的F1代为作图群体,利用SSR和SRAP对适宜于野核桃反应体系优化筛选,性状调查关联度分析,以及标记的分离遗传分析等方面进行了研究,制作出了目前首张新疆野核桃分子连锁图。并且对其株高、茎粗以及最大叶长等相关性状分析研究。具体研究结果如下:1.本研究选取两棵长势较好且表型性状差异较大的野核桃树（父本:平底圆核桃,母本:椭圆核桃）进行人工授粉杂交,得到368株F1代个体,并在苗期测定了F1代的8个相关数量性状。2.对SSR和SRAP标记进行筛选,从115对SSR标记中筛...
【文章来源】：新疆农业大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
提取的新疆野核桃样品DNA电泳检测结果
图 2-1 提取的新疆野核桃样品 DNA 电泳检测结果Figure 2-1 Electrophic results of genomic DNA of Juglans regia2.2.2 分子标记的多态性分析SSR 为共显性的单座位基因标记，能够很好地反映出基因的杂合性，本试验选用了115 对 SSR 引物，经过 PCR 扩增、电泳分析，所用引物部分能在新疆野核桃基因组中扩增出稳定的条带，其中 46 对 SSR 引物在作图群体的双亲间表现为多态，并且条带清晰，重复性好，便于统计，多态率为 40%。选用这 46 对引物用于群体扩增。对 F1 单株进行 SSR-PCR 扩增，共产生 70 个多态性标记位点，平均每对引物产生 1.52 个多态性标记位点，如图 2-2。
图 2-3 SSR 引物 WCD102 在部分群体单株的扩增结果Figure 2-3 the amplification patterns of WCD102 in some individualsM：Marker；P1：平底圆核桃；P2：椭圆核桃；1，2，3……：群体单株M：Marker；P1：Flat round walnut；P2：The elliptical walnut；1，2，3…：some individuals对 100 对 SRAP 引物进行筛选，筛选出 17 对表现差异且重复性好并稳定遗传的引物用于图谱的构建。对 F1 单株进行 SRAP-PCR 扩增，17 对引物共产生 39 个多态性标记，平均每对引物产生 2.29 个多态性标记。在双亲及 4 个随机单株间进行筛选，如图2-4。图 2-4 部分 SRAP 引物筛选结果
【参考文献】：
期刊论文
[1]利用SSR、SRAP和ISSR分子标记构建首张丹参遗传连锁图谱[J]. 宗成堃,宋振巧,陈海梅,刘昶,王建华,郭林林,刘甜,潘玉玲. 药学学报. 2015(03)
[2]利用基因芯片技术进行小麦遗传图谱构建及粒重QTL分析[J]. 陈广凤,李青芳,张晗,师翠兰,孙彩铃,邓志英,刘凯,谷植群,田纪春. 中国农业科学. 2014(24)
[3]野生毛花猕猴桃果实表型性状及SSR遗传多样性分析[J]. 汤佳乐,黄春辉,吴寒,郎彬彬,曲雪艳,徐小彪. 园艺学报. 2014(06)
[4]甜菜遗传连锁图谱初步构建[J]. 王茂芊,李博,王华忠. 作物学报. 2014(02)
[5]新疆野核桃蛋白质分离纯化及理化性质研究[J]. 常雪花,李忠. 食品工业. 2013(09)
[6]中国普通野生稻遗传多样性研究进展[J]. 杨庆文,黄娟. 作物学报. 2013(04)
[7]新疆野核桃油脂肪酸组成分析[J]. 刘华英,刘俊霞,包东东,张锐利. 中国油脂. 2012(09)
[8]新疆野核桃不同小叶数复叶构件生物量可塑性及分配规律[J]. 张维,任艳利,赵玉,亥依如拉木,杨允菲,李建东. 东北林业大学学报. 2012(07)
[9]用最小距离逐步取样法构建野核桃核心种质[J]. 袁海涛,董玉芝,王肇延. 浙江农业科学. 2012(07)
[10]新疆巩留野核桃林调查及其分析[J]. 董玉芝,朱小虎,陈虹,梁风丽,叶尔江,王肇延. 植物遗传资源学报. 2012(03)
博士论文
[1]陆地棉×黄褐棉种间全基因组SSR高密度遗传图谱的构建[D]. Ilyas Muhammad KASHIF.中国农业科学院 2014
[2]陆地棉×毛棉种间高密度遗传图谱的构建[D]. Khan,Muhammad Kashif Riaz.中国农业科学院 2013
[3]梅花遗传连锁图谱构建和表型性状QTLs分析[D]. 孙丽丹.北京林业大学 2013
[4]鸭茅分子遗传连锁图谱构建及开花基因定位[D]. 谢文刚.四川农业大学 2013
[5]大白菜分子遗传图谱构建及重要农艺性状QTL分析[D]. 章云.沈阳农业大学 2012
[6]高密度小麦遗传连锁图谱构建及产量相关性状QTL定位[D]. 崔法.山东农业大学 2011
[7]毛白杨与毛新杨转录组图谱构建及若干性状的遗传学联合分析[D]. 李博.北京林业大学 2009
[8]梨（Pyrus L.）遗传连锁图谱构建及其农艺性状的基因定位研究[D]. 孙文英.河北农业大学 2008
[9]几种分子标记技术的建立及其在部分柿属植物亲缘关系研究中的应用[D]. 郭大龙.华中农业大学 2006
[10]棉花分子标记遗传连锁图构建和产量、纤维品质相关性状定位[D]. 林忠旭.华中农业大学 2005
硕士论文
[1]西瓜遗传连锁图谱的构建及果实相关性状QTL分析[D]. 程瑶.东北农业大学 2015
[2]向日葵SRAP分子标记遗传连锁图谱的构建[D]. 于志贤.内蒙古农业大学 2014
[3]梨分子遗传图谱的构建及其部分果实性状的定位分析[D]. 王文魁.新疆农业大学 2014
[4]陆地棉高密度遗传图谱构建及衣分QTL定位[D]. 刘芳.西南大学 2014
[5]玉米遗传图谱构建及重要农艺性状QTL定位[D]. 孙婷婷.延边大学 2013
[6]猕猴桃遗传多样性的SRAP分析及GPX和cAPX基因片段的克隆[D]. 王卫.福建师范大学 2013
[7]利用SSR分子标记辅助选育转Bt基因抗虫棉[D]. 许新.华中农业大学 2013
[8]茶树SSR分子标记开发及遗传连锁图谱构建[D]. 谭礼强.四川农业大学 2013
[9]绵毛柳遗传图谱构建及生物能源性状的QTLs定位[D]. 贾会霞.中国林业科学研究院 2013
[10]小麦“糯麦1号×藁城8901”RIL群体遗传图谱构建和主要农艺及品质性状的QTL定位[D]. 郑菲菲.山东农业大学 2012
本文编号：3423124
【文章来源】：新疆农业大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
提取的新疆野核桃样品DNA电泳检测结果
图 2-1 提取的新疆野核桃样品 DNA 电泳检测结果Figure 2-1 Electrophic results of genomic DNA of Juglans regia2.2.2 分子标记的多态性分析SSR 为共显性的单座位基因标记，能够很好地反映出基因的杂合性，本试验选用了115 对 SSR 引物，经过 PCR 扩增、电泳分析，所用引物部分能在新疆野核桃基因组中扩增出稳定的条带，其中 46 对 SSR 引物在作图群体的双亲间表现为多态，并且条带清晰，重复性好，便于统计，多态率为 40%。选用这 46 对引物用于群体扩增。对 F1 单株进行 SSR-PCR 扩增，共产生 70 个多态性标记位点，平均每对引物产生 1.52 个多态性标记位点，如图 2-2。
图 2-3 SSR 引物 WCD102 在部分群体单株的扩增结果Figure 2-3 the amplification patterns of WCD102 in some individualsM：Marker；P1：平底圆核桃；P2：椭圆核桃；1，2，3……：群体单株M：Marker；P1：Flat round walnut；P2：The elliptical walnut；1，2，3…：some individuals对 100 对 SRAP 引物进行筛选，筛选出 17 对表现差异且重复性好并稳定遗传的引物用于图谱的构建。对 F1 单株进行 SRAP-PCR 扩增，17 对引物共产生 39 个多态性标记，平均每对引物产生 2.29 个多态性标记。在双亲及 4 个随机单株间进行筛选，如图2-4。图 2-4 部分 SRAP 引物筛选结果
【参考文献】：
期刊论文
[1]利用SSR、SRAP和ISSR分子标记构建首张丹参遗传连锁图谱[J]. 宗成堃,宋振巧,陈海梅,刘昶,王建华,郭林林,刘甜,潘玉玲. 药学学报. 2015(03)
[2]利用基因芯片技术进行小麦遗传图谱构建及粒重QTL分析[J]. 陈广凤,李青芳,张晗,师翠兰,孙彩铃,邓志英,刘凯,谷植群,田纪春. 中国农业科学. 2014(24)
[3]野生毛花猕猴桃果实表型性状及SSR遗传多样性分析[J]. 汤佳乐,黄春辉,吴寒,郎彬彬,曲雪艳,徐小彪. 园艺学报. 2014(06)
[4]甜菜遗传连锁图谱初步构建[J]. 王茂芊,李博,王华忠. 作物学报. 2014(02)
[5]新疆野核桃蛋白质分离纯化及理化性质研究[J]. 常雪花,李忠. 食品工业. 2013(09)
[6]中国普通野生稻遗传多样性研究进展[J]. 杨庆文,黄娟. 作物学报. 2013(04)
[7]新疆野核桃油脂肪酸组成分析[J]. 刘华英,刘俊霞,包东东,张锐利. 中国油脂. 2012(09)
[8]新疆野核桃不同小叶数复叶构件生物量可塑性及分配规律[J]. 张维,任艳利,赵玉,亥依如拉木,杨允菲,李建东. 东北林业大学学报. 2012(07)
[9]用最小距离逐步取样法构建野核桃核心种质[J]. 袁海涛,董玉芝,王肇延. 浙江农业科学. 2012(07)
[10]新疆巩留野核桃林调查及其分析[J]. 董玉芝,朱小虎,陈虹,梁风丽,叶尔江,王肇延. 植物遗传资源学报. 2012(03)
博士论文
[1]陆地棉×黄褐棉种间全基因组SSR高密度遗传图谱的构建[D]. Ilyas Muhammad KASHIF.中国农业科学院 2014
[2]陆地棉×毛棉种间高密度遗传图谱的构建[D]. Khan,Muhammad Kashif Riaz.中国农业科学院 2013
[3]梅花遗传连锁图谱构建和表型性状QTLs分析[D]. 孙丽丹.北京林业大学 2013
[4]鸭茅分子遗传连锁图谱构建及开花基因定位[D]. 谢文刚.四川农业大学 2013
[5]大白菜分子遗传图谱构建及重要农艺性状QTL分析[D]. 章云.沈阳农业大学 2012
[6]高密度小麦遗传连锁图谱构建及产量相关性状QTL定位[D]. 崔法.山东农业大学 2011
[7]毛白杨与毛新杨转录组图谱构建及若干性状的遗传学联合分析[D]. 李博.北京林业大学 2009
[8]梨（Pyrus L.）遗传连锁图谱构建及其农艺性状的基因定位研究[D]. 孙文英.河北农业大学 2008
[9]几种分子标记技术的建立及其在部分柿属植物亲缘关系研究中的应用[D]. 郭大龙.华中农业大学 2006
[10]棉花分子标记遗传连锁图构建和产量、纤维品质相关性状定位[D]. 林忠旭.华中农业大学 2005
硕士论文
[1]西瓜遗传连锁图谱的构建及果实相关性状QTL分析[D]. 程瑶.东北农业大学 2015
[2]向日葵SRAP分子标记遗传连锁图谱的构建[D]. 于志贤.内蒙古农业大学 2014
[3]梨分子遗传图谱的构建及其部分果实性状的定位分析[D]. 王文魁.新疆农业大学 2014
[4]陆地棉高密度遗传图谱构建及衣分QTL定位[D]. 刘芳.西南大学 2014
[5]玉米遗传图谱构建及重要农艺性状QTL定位[D]. 孙婷婷.延边大学 2013
[6]猕猴桃遗传多样性的SRAP分析及GPX和cAPX基因片段的克隆[D]. 王卫.福建师范大学 2013
[7]利用SSR分子标记辅助选育转Bt基因抗虫棉[D]. 许新.华中农业大学 2013
[8]茶树SSR分子标记开发及遗传连锁图谱构建[D]. 谭礼强.四川农业大学 2013
[9]绵毛柳遗传图谱构建及生物能源性状的QTLs定位[D]. 贾会霞.中国林业科学研究院 2013
[10]小麦“糯麦1号×藁城8901”RIL群体遗传图谱构建和主要农艺及品质性状的QTL定位[D]. 郑菲菲.山东农业大学 2012
本文编号：3423124
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