细叶百合3个NAC转录因子的克隆及其对烟草的遗传转化
发布时间：2021-10-08 22:33
细叶百合（Liliumpumilum）主要分布于我国的北方地区地区,耐寒且耐干旱和盐碱,花瓣反卷鲜红色,鳞茎可食,是一种兼具食用、药用和观赏价值的植物,也是百合抗性育种的重要亲本。本研究从细叶百合转录组中筛选出21个NAC基因,并命名为LpNAC1-21（登录号:MF398192-MF398212）。然后对其进行结构域分析、系统进化分析、蛋白结构预测和功能预测,研究了细叶百合21个NAC基因在逆境胁迫下各组织器官中的表达模式。研究结果如下:1.通过生物信息学分析结果表明LpNAC基因都含有NAC转录因子特有的保守结构域,LpNAC蛋白氨基酸数在51-890之间,分子量5966.5-100080.4Da之间,LpNAC蛋白质二级结构主要以无规则卷曲构成,αα-螺旋、β-转角则散布于整个蛋白质中,跨膜结构域预测显示LpNAC19和LpNAC20具有单个跨膜结构域,系统发育树分析显示LpNAC蛋白与拟南芥NAC蛋白一起被分为七个不同的组（命名为NACa至NACg）。通过PlantTFDB进一步预测LpNAC基因在细叶百合中的功能,结果显示细叶百合NAC基因都具有转录调控的功能,还具有响应非生...
【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－２细叶百合ＮＡＣ蛋白三级结构预测??－
图２－３?和跨膜结构域分析??Ｆｉｇ．?２－３?Ｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅ?ｄｏｍａｉｎ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ＬｐＮＡＣ２０??２．２．２．５ＮＡ
ＬｐＮＡＣ２、ＬｐＮＡＣ５、ＬｐＮＡＣ８、ＬｐＮＡＣＩＯ、ＬｐＮＡＣ１２、ＬｐＮＡＣ１５、ＬｐＮＡＣ２〇ＭＬｐＮＡＣ２１??基因和在所有胁迫时间点都下调表达。最后一组、ｉｐｖＶｄＯ和??基因在３ｈ表达水平上调，其他时间点下调表达。在盐胁迫条件下（图３－２Ａ），??ＮＡＣ－ａ、ＮＡＣ－ｄ和ＮＡＣ－ｆ组基因的总表达水平为上调表达，ＮＡＣ－ｂ、ＮＡＣ－ｃ和ＮＡＣ－ｇ??组基因总表达水平为下调表达。ＮＡＣ－ｅ组的基因在胁迫１２ｈ后表达水平上调。根据其在??植物根部的表达模式（图３－１Ｂ），基因可以大致分为三组。第一组包括??ＬｐＮＡＣｌ、ＬｐＮＡＣ５、ＬｐＮＡＣ６、ＬｐＮＡＣ８、ＬｐＮＡＣ９、ＬｐＮＡＣ１３、ＬｐＮＡＣ１７?和?ＬｐＮＡＣ２０?基??因，其表达水平在ｌｈ时增加，并在６?ｈ、１２?ｈ或４８?ｈ时达到最高值。第二组包括??ＺｐＡ／＾４Ｃ２、■／和?在?ｌｈ?时表达水平上调，胁迫处理??３ｈ、６ｈ或１２ｈ后表达水平迅速下降。第三组包括其在６ｈ之前表达水平为下??调表达，并且在盐处理１２ｈ后迅速上调表达。第四组包括Ｚ／ＴＭ４Ｃ７、??ＺｐＡ＾ＣＭ、ＺｐＡ＾４Ｃ７９和ＺｐＡ＾Ｃ２Ｊ，在所有时间点表达水平均下??调。在盐胁迫条件下（图３－２Ｂ），ＮＡＣ－ｃ和ＮＡＣ－ｄ组基因的总表达水平为上调表达，而??ＮＡＣ－ｂ和ＮＡＣ－ｆ组基因总表达水平为下调表达。盐处理６ｈ后
【参考文献】：
期刊论文
[1]细叶百合低温解除休眠过程中鳞茎内糖分及相关酶的研究[J]. 刘芳,陈业雯,李丹丹,廉华,吴瑕,杨瑾,李雨琦,谢守峰,陈学武. 草业学报. 2016(05)
[2]Comprehensive analysis of NAC transcription factors in diploid Gossypium: sequence conservation and expression analysis uncover their roles during fiber development[J]. Haihong Shang,Zhongna Wang,Changsong Zou,Zhen Zhang,Weijie Li,Junwen Li,Yuzhen Shi,Wankui Gong,Tingting Chen,Aiying Liu,Juwu Gong,Qun Ge,Youlu Yuan. Science China（Life Sciences）. 2016(02)
[3]细叶百合冷藏过程中鳞茎保护酶活性与休眠解除的关系[J]. 刘芳,李丹丹,廉华,吴瑕,陈业雯,李雨琦,谢守峰,陈学武. 草业学报. 2015(12)
[4]细叶百合低温解除休眠过程中鳞茎细胞淀粉粒及花芽分化的变化[J]. 刘芳,田忠平,蔡英杰,张雨,周蕴薇. 草业学报. 2015(09)
[5]紫花苜蓿NAC类转录因子基因MsNAC2的克隆及其功能分析[J]. 申玉华,徐振军,唐立红,杨晓坡,黄文婕,武小斌,张文波. 中国农业科学. 2015(15)
[6]植物NAC转录因子功能研究新进展[J]. 陈娜,蒋晶,曹必好,雷建军,陈长明. 分子植物育种. 2015(06)
[7]紫花苜蓿NAC转录因子MsNAC1基因的克隆、生物信息学分析及非生物逆境胁迫下的表达分析[J]. 申玉华,徐振军,杨晓坡,相吉山,文静,黄文婕. 植物遗传资源学报. 2014(06)
[8]细叶百合鳞茎花芽分化过程观察[J]. 王家艳,刘芳,苏欣,卢政岩,周蕴薇. 草业科学. 2014(05)
[9]野生细叶百合开花生物学研究[J]. 马建琴,郭太君,陈少鹏,赵仁林. 北方园艺. 2013(23)
[10]植物NAC转录因子的种类、特征及功能[J]. 李伟,韩蕾,钱永强,孙振元. 应用与环境生物学报. 2011(04)
博士论文
[1]两种中国原产百合体细胞胚发生及miRNA调控网络初步解析[D]. 张静.沈阳农业大学 2017
硕士论文
[1]基于体细胞胚发生的两种中国原产百合多倍体创制[D]. 盖美竹.沈阳农业大学 2017
本文编号：3425095
【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２－２细叶百合ＮＡＣ蛋白三级结构预测??－
图２－３?和跨膜结构域分析??Ｆｉｇ．?２－３?Ｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅ?ｄｏｍａｉｎ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ＬｐＮＡＣ２０??２．２．２．５ＮＡ
ＬｐＮＡＣ２、ＬｐＮＡＣ５、ＬｐＮＡＣ８、ＬｐＮＡＣＩＯ、ＬｐＮＡＣ１２、ＬｐＮＡＣ１５、ＬｐＮＡＣ２〇ＭＬｐＮＡＣ２１??基因和在所有胁迫时间点都下调表达。最后一组、ｉｐｖＶｄＯ和??基因在３ｈ表达水平上调，其他时间点下调表达。在盐胁迫条件下（图３－２Ａ），??ＮＡＣ－ａ、ＮＡＣ－ｄ和ＮＡＣ－ｆ组基因的总表达水平为上调表达，ＮＡＣ－ｂ、ＮＡＣ－ｃ和ＮＡＣ－ｇ??组基因总表达水平为下调表达。ＮＡＣ－ｅ组的基因在胁迫１２ｈ后表达水平上调。根据其在??植物根部的表达模式（图３－１Ｂ），基因可以大致分为三组。第一组包括??ＬｐＮＡＣｌ、ＬｐＮＡＣ５、ＬｐＮＡＣ６、ＬｐＮＡＣ８、ＬｐＮＡＣ９、ＬｐＮＡＣ１３、ＬｐＮＡＣ１７?和?ＬｐＮＡＣ２０?基??因，其表达水平在ｌｈ时增加，并在６?ｈ、１２?ｈ或４８?ｈ时达到最高值。第二组包括??ＺｐＡ／＾４Ｃ２、■／和?在?ｌｈ?时表达水平上调，胁迫处理??３ｈ、６ｈ或１２ｈ后表达水平迅速下降。第三组包括其在６ｈ之前表达水平为下??调表达，并且在盐处理１２ｈ后迅速上调表达。第四组包括Ｚ／ＴＭ４Ｃ７、??ＺｐＡ＾ＣＭ、ＺｐＡ＾４Ｃ７９和ＺｐＡ＾Ｃ２Ｊ，在所有时间点表达水平均下??调。在盐胁迫条件下（图３－２Ｂ），ＮＡＣ－ｃ和ＮＡＣ－ｄ组基因的总表达水平为上调表达，而??ＮＡＣ－ｂ和ＮＡＣ－ｆ组基因总表达水平为下调表达。盐处理６ｈ后
【参考文献】：
期刊论文
[1]细叶百合低温解除休眠过程中鳞茎内糖分及相关酶的研究[J]. 刘芳,陈业雯,李丹丹,廉华,吴瑕,杨瑾,李雨琦,谢守峰,陈学武. 草业学报. 2016(05)
[2]Comprehensive analysis of NAC transcription factors in diploid Gossypium: sequence conservation and expression analysis uncover their roles during fiber development[J]. Haihong Shang,Zhongna Wang,Changsong Zou,Zhen Zhang,Weijie Li,Junwen Li,Yuzhen Shi,Wankui Gong,Tingting Chen,Aiying Liu,Juwu Gong,Qun Ge,Youlu Yuan. Science China（Life Sciences）. 2016(02)
[3]细叶百合冷藏过程中鳞茎保护酶活性与休眠解除的关系[J]. 刘芳,李丹丹,廉华,吴瑕,陈业雯,李雨琦,谢守峰,陈学武. 草业学报. 2015(12)
[4]细叶百合低温解除休眠过程中鳞茎细胞淀粉粒及花芽分化的变化[J]. 刘芳,田忠平,蔡英杰,张雨,周蕴薇. 草业学报. 2015(09)
[5]紫花苜蓿NAC类转录因子基因MsNAC2的克隆及其功能分析[J]. 申玉华,徐振军,唐立红,杨晓坡,黄文婕,武小斌,张文波. 中国农业科学. 2015(15)
[6]植物NAC转录因子功能研究新进展[J]. 陈娜,蒋晶,曹必好,雷建军,陈长明. 分子植物育种. 2015(06)
[7]紫花苜蓿NAC转录因子MsNAC1基因的克隆、生物信息学分析及非生物逆境胁迫下的表达分析[J]. 申玉华,徐振军,杨晓坡,相吉山,文静,黄文婕. 植物遗传资源学报. 2014(06)
[8]细叶百合鳞茎花芽分化过程观察[J]. 王家艳,刘芳,苏欣,卢政岩,周蕴薇. 草业科学. 2014(05)
[9]野生细叶百合开花生物学研究[J]. 马建琴,郭太君,陈少鹏,赵仁林. 北方园艺. 2013(23)
[10]植物NAC转录因子的种类、特征及功能[J]. 李伟,韩蕾,钱永强,孙振元. 应用与环境生物学报. 2011(04)
博士论文
[1]两种中国原产百合体细胞胚发生及miRNA调控网络初步解析[D]. 张静.沈阳农业大学 2017
硕士论文
[1]基于体细胞胚发生的两种中国原产百合多倍体创制[D]. 盖美竹.沈阳农业大学 2017
本文编号：3425095
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/yylw/3425095.html
