葡萄ABCG基因亚家族半分子成员克隆及表达分析
发布时间：2021-10-11 15:31
葡萄假单性结实型无核品种正常受精的胚珠发生败育解体,其过程类似于细胞程序性死亡（Programmed Cell Death,PCD）。前期研究已表明VvABCG20可能在葡萄胚珠败育过程中发挥重要作用。本研究从葡萄基因组中筛选ABCG亚家族半分子成员并进行生物信息学分析,从‘黑比诺’葡萄中克隆ABCG基因亚家族的半分子成员。利用实时荧光定量PCR（quantitative real-time PCR,qRT-PCR）和半定量PCR（semi-quantitative real-time PCR,sqRT-PCR）技术对葡萄ABCG基因亚家族的半分子成员进行组织表达特异性分析和在‘无核白’与‘黑比诺’葡萄胚珠发育过程中的表达分析,初步明确葡萄ABCG基因亚家族半分子成员与葡萄胚珠发育的关系。同时构建在拟南芥中与VvABCG20直系同源基因AtABCG20的RNAi干扰载体以初步探究VvABCG20在胚珠发育过程中的功能。主要获得以下研究结果:1、以拟南芥中ABCG亚家族半分子成员为模板,在葡萄基因组中进行比对并经过筛选后得到30个ABCG基因亚家族半分子成员;对这30个成员进行生物信息学...
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：52 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 葡萄无核机理研究进展
1.2 ABC基因家族研究进展
1.3 植物中ABC基因家族研究进展
1.4 植物中ABCG基因家族研究进展
1.5 研究目的和意义
第二章 葡萄ABCG亚家族半分子成员的鉴定、克隆与生物信息学分析
2.1 材料与方法
2.1.1 材料
2.1.2 葡萄VvABCG基因家族半分子成员的分离与鉴定
2.1.3 葡萄VvABCG基因亚家族半分子成员开放阅读框扩增
2.1.4 葡萄VvABCG基因亚家族半分子成员生物信息学分析
2.1.5 半定量PCR表达分析和定量PCR表达分析
2.1.6. AtABCG20植物RNAi干扰载体构建
2.1.7 农杆菌感受态制备及电击转化
2.2 结果与分析
2.2.1 葡萄ABCG亚家族半分子成员的分离与鉴定
2.2.2 葡萄ABCG亚家族半分子成员的染色体定位与同线性分析
2.2.3 葡萄ABCG亚家族半分子成员外显子/内含子结构分析及系统发育树分析
2.2.4 葡萄ABCG亚家族半分子成员多序列比对
2.2.5 葡萄ABCG亚家族半分子成员的表达分析
2.2.6 AtABCG20植物RNAi干扰载体构建及转化农杆菌
2.3 讨论
2.3.1 葡萄ABCG亚家族半分子成员的扩增
2.3.2 ABCG亚家族半分子成员转运底物多样性
2.3.3 ABCG亚家族半分子成员在葡萄和拟南芥中的进化
2.3.4 VvABCG6和VvABCG20的功能预测
2.3.5 VvABCG26的功能预测
2.3.6 VvABCG14的功能预测
2.3.7 VvABCG15.1、VvABCG15.2、VvABCG15.3、VvABCG15.4 和VvABCG7的功能预测
第三章 结论
参考文献
致谢
作者简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]Plant pleiotropic drug resistance transporters:Transport mechanism, gene expression,and function[J]. Mohammed Nuruzzaman,Ru Zhang,Hong-Zhe Cao,Zhi-Yong Luo. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(08)
[2]ABC转运蛋白与巴西橡胶树产胶代谢[J]. 聂智毅,黎瑜,曾日中. 热带农业科学. 2013(12)
[3]植物ATP结合盒（ABC）转运蛋白研究进展[J]. 邵若玄,沈忆珂,周文彬,方佳,郑炳松. 浙江农林大学学报. 2013(05)
[4]全基因组与串联复制后白菜基因的保留[J]. 方璐,程锋,武剑,王晓武. 生物技术通报. 2012(11)
[5]植物ABC转运蛋白研究综述[J]. 赵胡,李裕红. 海峡科学. 2012(02)
[6]WBC27,an Adenosine Tri-phosphate-binding Cassette Protein,Controls Pollen Wall Formation and Patterning in Arabidopsis[J]. Xiao-Ying Dou1,Ke-Zhen Yang1,Yi Zhang2,Wei Wang1,Xiao-Lei Liu1,Li-Qun Chen1,Xue-Qin Zhang1 and De Ye1 1State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry,College of Biological Sciences,China Agricultural University,Beijing 100193,China 2Key Laboratory of Biotechnology and Crop Quality Improvement,Ministry of Agriculture,Southwest University,Chongqing 400716,China. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(01)
[7]假单性结实无核葡萄胚败育时期的研究[J]. 孙博,曹后男,何伟,巩艳明,宗长玲. 延边大学农学学报. 2009(03)
[8]酵母细胞中ABC转运蛋白的分类和功能[J]. 王继红,李西川,蒋伶活. 细胞生物学杂志. 2009(04)
[9]假单性结实无核葡萄胚败育机理研究[J]. 王跃进,江淑平,刘小宁,张剑侠. 西北植物学报. 2007(10)
[10]无核葡萄与中国野生葡萄杂种胚发育和败育的细胞学研究[J]. 王飞,王跃进,周会玲,万怡震,杨进孝. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2005(03)
本文编号：3430786
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：52 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 葡萄无核机理研究进展
1.2 ABC基因家族研究进展
1.3 植物中ABC基因家族研究进展
1.4 植物中ABCG基因家族研究进展
1.5 研究目的和意义
第二章 葡萄ABCG亚家族半分子成员的鉴定、克隆与生物信息学分析
2.1 材料与方法
2.1.1 材料
2.1.2 葡萄VvABCG基因家族半分子成员的分离与鉴定
2.1.3 葡萄VvABCG基因亚家族半分子成员开放阅读框扩增
2.1.4 葡萄VvABCG基因亚家族半分子成员生物信息学分析
2.1.5 半定量PCR表达分析和定量PCR表达分析
2.1.6. AtABCG20植物RNAi干扰载体构建
2.1.7 农杆菌感受态制备及电击转化
2.2 结果与分析
2.2.1 葡萄ABCG亚家族半分子成员的分离与鉴定
2.2.2 葡萄ABCG亚家族半分子成员的染色体定位与同线性分析
2.2.3 葡萄ABCG亚家族半分子成员外显子/内含子结构分析及系统发育树分析
2.2.4 葡萄ABCG亚家族半分子成员多序列比对
2.2.5 葡萄ABCG亚家族半分子成员的表达分析
2.2.6 AtABCG20植物RNAi干扰载体构建及转化农杆菌
2.3 讨论
2.3.1 葡萄ABCG亚家族半分子成员的扩增
2.3.2 ABCG亚家族半分子成员转运底物多样性
2.3.3 ABCG亚家族半分子成员在葡萄和拟南芥中的进化
2.3.4 VvABCG6和VvABCG20的功能预测
2.3.5 VvABCG26的功能预测
2.3.6 VvABCG14的功能预测
2.3.7 VvABCG15.1、VvABCG15.2、VvABCG15.3、VvABCG15.4 和VvABCG7的功能预测
第三章 结论
参考文献
致谢
作者简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]Plant pleiotropic drug resistance transporters:Transport mechanism, gene expression,and function[J]. Mohammed Nuruzzaman,Ru Zhang,Hong-Zhe Cao,Zhi-Yong Luo. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(08)
[2]ABC转运蛋白与巴西橡胶树产胶代谢[J]. 聂智毅,黎瑜,曾日中. 热带农业科学. 2013(12)
[3]植物ATP结合盒（ABC）转运蛋白研究进展[J]. 邵若玄,沈忆珂,周文彬,方佳,郑炳松. 浙江农林大学学报. 2013(05)
[4]全基因组与串联复制后白菜基因的保留[J]. 方璐,程锋,武剑,王晓武. 生物技术通报. 2012(11)
[5]植物ABC转运蛋白研究综述[J]. 赵胡,李裕红. 海峡科学. 2012(02)
[6]WBC27,an Adenosine Tri-phosphate-binding Cassette Protein,Controls Pollen Wall Formation and Patterning in Arabidopsis[J]. Xiao-Ying Dou1,Ke-Zhen Yang1,Yi Zhang2,Wei Wang1,Xiao-Lei Liu1,Li-Qun Chen1,Xue-Qin Zhang1 and De Ye1 1State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry,College of Biological Sciences,China Agricultural University,Beijing 100193,China 2Key Laboratory of Biotechnology and Crop Quality Improvement,Ministry of Agriculture,Southwest University,Chongqing 400716,China. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(01)
[7]假单性结实无核葡萄胚败育时期的研究[J]. 孙博,曹后男,何伟,巩艳明,宗长玲. 延边大学农学学报. 2009(03)
[8]酵母细胞中ABC转运蛋白的分类和功能[J]. 王继红,李西川,蒋伶活. 细胞生物学杂志. 2009(04)
[9]假单性结实无核葡萄胚败育机理研究[J]. 王跃进,江淑平,刘小宁,张剑侠. 西北植物学报. 2007(10)
[10]无核葡萄与中国野生葡萄杂种胚发育和败育的细胞学研究[J]. 王飞,王跃进,周会玲,万怡震,杨进孝. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2005(03)
本文编号：3430786
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