新疆枸杞和枣种质资源遗传多样性分析
发布时间：2021-10-16 03:40
枸杞（Lycium bararum L.）为茄科（Solanaceae）枸杞属（lycium L.）,是一种药食同源植物,具有重要的药用价值和经济价值。新疆作为我国枸杞主产区之一,蕴藏着丰富的种质资源,由于长期的自然选择和人工选育使得枸杞基因型高度杂合,遗传背景十分复杂,从分子生物学角度对其种质资源遗传变异的研究往往滞后于育种实践,这些均给其种质资源的有效利用、鉴定、品种选育中的亲本选配带来困难,从而影响了遗传育种效率的提高。因此,开展新疆枸杞种质资源遗传多样性研究,有利于其种质资源评价、新品种选育和合理利用。本试验以新疆枸杞种质资源圃栽培品种（系）和野生种共30份样品为试材,采用SRAP和SCoT标记对30份枸杞种质资源进行遗传多样性分析,并构建其DNA指纹图谱。枣（Ziziphus jujuba Mill.）植物分类学上属于鼠李科（Rhamnaceae）枣属（Ziziphus Mill.）植物,是原产于中国的特有果树,既具有经济效益又是生态经济林树种。新疆由于独特的地理位置和得天独厚的气候条件使其拥有较为丰富的品种资源,其南部已成为中国枣的主要栽培地区之一。本试验在前人相关研究的基...
【文章来源】：新疆农业大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】：77 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
部分枸杞样品基因组DNA提取结果
新疆枸杞和枣种质资源遗传多样性分析进行统计分析，位点统计结果(表 3-1)。12 对 SRAP 多态性引物共检测出 DNA 位点 310个，具有多态性位点 264 个，每对引物检测的位点数为 14-34 个不等，平均为 25.83 个，多态位点数为 11-34 个不等，平均为 22 个，不同引物组合扩增多态性百分率存在较大差异,从 59.26-100%不等，平均为 84.61%，其中，me2-em6 和 me2-em1 引物组合多态性百分率最高，均达到 100%，me4-em2 引物组合多态性百分率最低，为 59.26%，12 对引物检测位点的多态信息含量(PIC)值变化范围在 0.76-0.93 之间，平均为 0.83，说明大部分引物组合扩增多态性较丰富，SRAP 标记适合于新疆枸杞种质资源遗传多样性研究，具有较高的多态性检测力。
基于 30 份枸杞样品间的遗传相似系数，用 UPGMA 法对 30 份枸杞样品进行聚获得亲缘关系聚类图(图 3-3)，在遗传相似性系数为 0.70 时，可将供试材料分，第Ⅰ大类包括野红果枸杞、野黑果枸杞、野生雪青色果和野生黄果枸杞 4 个这说明 4 个野生种间遗传差异小，亲缘关系近，其中，野生雪青色果和野生黄间的亲缘关系最近，在相似系数为 0.76 时，第Ⅱ大类又可细分为ⅴ个亚类，首枸杞一个品种作为ⅰ个亚类，第ⅱ亚类是‘宁杞 1 号’和‘宁杞 5 号’2 个品起，第ⅲ亚类是‘蒙杞 1 号’和‘白刺枸杞’2 个品种被分为一类，第ⅳ亚类杞 3 号’、‘精杞 5 号’、0901、1016、1017 和‘宁杞 7 号’，其中，‘精杞 3 号杞 5 号’，1016 和 1017 分别表现出遗传变异程度低，遗传背景相近的亲缘关类包括剩余的 15 个品种，其中，‘精杞 1 号’和‘精杞 4 号’，‘精杞 8 号’和 101宁菜 1 号’，1018 和 1021 有较近的亲缘关系，1101、1102 和 1103 被分为一它们遗传基础狭窄，遗传变异小，父本或母本相同。
【参考文献】：
期刊论文
[1]柴达木地区野生黑果枸杞种群遗传多样性的AFLP分析[J]. 王锦楠,陈进福,陈武生,周新洋,许东,李际红,亓晓. 植物生态学报. 2015(10)
[2]利用SSR技术对十七份枸杞材料进行遗传多样性分析及标准指纹图谱构建[J]. 邵千顺,高磊,南雄雄,徐美隆,李永华,王锦秀. 北方园艺. 2015(12)
[3]制干辣椒SCoT-PCR体系优化及引物筛选[J]. 李宁,杨涛,杨生保,唐亚萍,王柏柯,王强,帕提古丽,余庆辉. 南方农业学报. 2015(04)
[4]新疆杏品种（系）遗传多样性分析及DNA指纹图谱库构建[J]. 刘娟,廖康,曼苏尔·那斯尔,孙琪,刘欢,贾杨. 中国农业科学. 2015(04)
[5]SCoT分子标记在植物研究中的应用进展[J]. 龙治坚,范理璋,徐刚,胡尚连,韩国辉. 植物遗传资源学报. 2015(02)
[6]DNA分子标记在林木遗传育种中的应用[J]. 张金然. 北京农业. 2014(33)
[7]贵州桃种质资源遗传多样性的SCoT分析[J]. 陈红,杨鑫,安华明. 西北植物学报. 2014(08)
[8]葡萄种质资源SRAP-PCR反应体系的建立及优化[J]. 苑炜,朱瑜,代培红,夏培蓓,罗淑萍. 新疆农业科学. 2014(07)
[9]我国枸杞主产区生产现状调研及建议[J]. 徐常青,刘赛,徐荣,陈君,乔海莉,金红宇,林晨,郭昆,程惠珍. 中国中药杂志. 2014(11)
[10]陕北枣品种群遗传结构的SSR分析[J]. 殷晓,张春梅,李新岗,黄建,王长柱,练春兰. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2014(06)
博士论文
[1]芒果SCoT分子标记与逆境和重要开花时间相关基因研究[D]. 罗聪.广西大学 2012
[2]基于EST-SSR、Genomic-SSR和SCoT标记的柑橘连锁图谱构建及杂种和多倍体遗传分析[D]. 韩国辉.西南大学 2012
硕士论文
[1]梨分子遗传图谱的构建及其部分果实性状的定位分析[D]. 王文魁.新疆农业大学 2014
[2]濒危植物山白树遗传多样性分析[D]. 何燕妮.西北农林科技大学 2014
[3]枸杞品种（系）分子鉴定及亲缘关系分析[D]. 尹跃.福建农林大学 2013
[4]安徽及周边地区枣种质资源遗传多样性及系统关系研究[D]. 孙雯雯.安徽农业大学 2011
[5]芸豆AFLP分子标记体系的建立及其适宜重庆低海拔地区种植的品种筛选[D]. 孙富年.西南大学 2008
[6]扁桃种质资源RAPD和ISSR分析[D]. 孙晋科.新疆农业大学 2008
[7]广西龙眼遗传多样性及亲缘关系的AFLP分析[D]. 李江舟.广西大学 2007
[8]中国甘蓝型油菜品种遗传多样性、演化规律分析及指纹图谱构建[D]. 文雁成.中国农业科学院 2006
[9]中国枣资源研究与利用[D]. 高京草.西北农林科技大学 2005
[10]中国地方稻种初级核心种质的SSR遗传多样性分析及核心种质的构建[D]. 张冬玲.新疆农业大学 2004
本文编号：3439074
【文章来源】：新疆农业大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】：77 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
部分枸杞样品基因组DNA提取结果
新疆枸杞和枣种质资源遗传多样性分析进行统计分析，位点统计结果(表 3-1)。12 对 SRAP 多态性引物共检测出 DNA 位点 310个，具有多态性位点 264 个，每对引物检测的位点数为 14-34 个不等，平均为 25.83 个，多态位点数为 11-34 个不等，平均为 22 个，不同引物组合扩增多态性百分率存在较大差异,从 59.26-100%不等，平均为 84.61%，其中，me2-em6 和 me2-em1 引物组合多态性百分率最高，均达到 100%，me4-em2 引物组合多态性百分率最低，为 59.26%，12 对引物检测位点的多态信息含量(PIC)值变化范围在 0.76-0.93 之间，平均为 0.83，说明大部分引物组合扩增多态性较丰富，SRAP 标记适合于新疆枸杞种质资源遗传多样性研究，具有较高的多态性检测力。
基于 30 份枸杞样品间的遗传相似系数，用 UPGMA 法对 30 份枸杞样品进行聚获得亲缘关系聚类图(图 3-3)，在遗传相似性系数为 0.70 时，可将供试材料分，第Ⅰ大类包括野红果枸杞、野黑果枸杞、野生雪青色果和野生黄果枸杞 4 个这说明 4 个野生种间遗传差异小，亲缘关系近，其中，野生雪青色果和野生黄间的亲缘关系最近，在相似系数为 0.76 时，第Ⅱ大类又可细分为ⅴ个亚类，首枸杞一个品种作为ⅰ个亚类，第ⅱ亚类是‘宁杞 1 号’和‘宁杞 5 号’2 个品起，第ⅲ亚类是‘蒙杞 1 号’和‘白刺枸杞’2 个品种被分为一类，第ⅳ亚类杞 3 号’、‘精杞 5 号’、0901、1016、1017 和‘宁杞 7 号’，其中，‘精杞 3 号杞 5 号’，1016 和 1017 分别表现出遗传变异程度低，遗传背景相近的亲缘关类包括剩余的 15 个品种，其中，‘精杞 1 号’和‘精杞 4 号’，‘精杞 8 号’和 101宁菜 1 号’，1018 和 1021 有较近的亲缘关系，1101、1102 和 1103 被分为一它们遗传基础狭窄，遗传变异小，父本或母本相同。
【参考文献】：
期刊论文
[1]柴达木地区野生黑果枸杞种群遗传多样性的AFLP分析[J]. 王锦楠,陈进福,陈武生,周新洋,许东,李际红,亓晓. 植物生态学报. 2015(10)
[2]利用SSR技术对十七份枸杞材料进行遗传多样性分析及标准指纹图谱构建[J]. 邵千顺,高磊,南雄雄,徐美隆,李永华,王锦秀. 北方园艺. 2015(12)
[3]制干辣椒SCoT-PCR体系优化及引物筛选[J]. 李宁,杨涛,杨生保,唐亚萍,王柏柯,王强,帕提古丽,余庆辉. 南方农业学报. 2015(04)
[4]新疆杏品种（系）遗传多样性分析及DNA指纹图谱库构建[J]. 刘娟,廖康,曼苏尔·那斯尔,孙琪,刘欢,贾杨. 中国农业科学. 2015(04)
[5]SCoT分子标记在植物研究中的应用进展[J]. 龙治坚,范理璋,徐刚,胡尚连,韩国辉. 植物遗传资源学报. 2015(02)
[6]DNA分子标记在林木遗传育种中的应用[J]. 张金然. 北京农业. 2014(33)
[7]贵州桃种质资源遗传多样性的SCoT分析[J]. 陈红,杨鑫,安华明. 西北植物学报. 2014(08)
[8]葡萄种质资源SRAP-PCR反应体系的建立及优化[J]. 苑炜,朱瑜,代培红,夏培蓓,罗淑萍. 新疆农业科学. 2014(07)
[9]我国枸杞主产区生产现状调研及建议[J]. 徐常青,刘赛,徐荣,陈君,乔海莉,金红宇,林晨,郭昆,程惠珍. 中国中药杂志. 2014(11)
[10]陕北枣品种群遗传结构的SSR分析[J]. 殷晓,张春梅,李新岗,黄建,王长柱,练春兰. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2014(06)
博士论文
[1]芒果SCoT分子标记与逆境和重要开花时间相关基因研究[D]. 罗聪.广西大学 2012
[2]基于EST-SSR、Genomic-SSR和SCoT标记的柑橘连锁图谱构建及杂种和多倍体遗传分析[D]. 韩国辉.西南大学 2012
硕士论文
[1]梨分子遗传图谱的构建及其部分果实性状的定位分析[D]. 王文魁.新疆农业大学 2014
[2]濒危植物山白树遗传多样性分析[D]. 何燕妮.西北农林科技大学 2014
[3]枸杞品种（系）分子鉴定及亲缘关系分析[D]. 尹跃.福建农林大学 2013
[4]安徽及周边地区枣种质资源遗传多样性及系统关系研究[D]. 孙雯雯.安徽农业大学 2011
[5]芸豆AFLP分子标记体系的建立及其适宜重庆低海拔地区种植的品种筛选[D]. 孙富年.西南大学 2008
[6]扁桃种质资源RAPD和ISSR分析[D]. 孙晋科.新疆农业大学 2008
[7]广西龙眼遗传多样性及亲缘关系的AFLP分析[D]. 李江舟.广西大学 2007
[8]中国甘蓝型油菜品种遗传多样性、演化规律分析及指纹图谱构建[D]. 文雁成.中国农业科学院 2006
[9]中国枣资源研究与利用[D]. 高京草.西北农林科技大学 2005
[10]中国地方稻种初级核心种质的SSR遗传多样性分析及核心种质的构建[D]. 张冬玲.新疆农业大学 2004
本文编号：3439074
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