调控辣椒素生物合成的主要转录因子筛选及功能验证
发布时间：2021-10-25 12:43
辣椒素只有在辣椒属植物中才能合成,并且辣椒素应用广泛。通过对辣椒素的不断研究,辣椒素的生物合成途径已基本阐明,但是对辣椒素合成途径的调控机制却鲜有报道。本研究根据辣椒基因组数据及生物信息学方法筛选5个辣椒转录因子（AP2/ERF和WRKY）,利用VIGS、q RT-PCR、酵母单杂交等技术对它们进行功能鉴定,期望找出具有不同辣度的品种间在这些转录因子上的差异,为挖掘“涮涮辣”高辣椒素基因奠定基础。得到的研究结果如下:（1）PCR初步检测得到了29株转CaAT3过表达的T0代转基因番茄。转化体的进一步鉴定正在进行。（2）不同辣度的辣椒品种的启动子序列比对结果如下:辣椒素合成途径中结构基因AT3的启动子中,‘59’（中辣品种）和‘WL’（微辣品种）只存在1个碱基的差异,‘740’（辣椒素含量最高的品种）和‘59’有较大差异;对‘59’,‘170’,‘740’,‘XN’（中辣品种）的p AMT启动子序列比较分析,发现‘59’和‘170’（甜椒品种,无辣椒素）只有1个碱基的差异,‘59’和‘XN’有3个碱基的差异,‘170’和‘XN’有2个碱基差异,而‘740’与其他3个品种的辣椒存在较大差异...
【文章来源】：华南农业大学广东省
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
辣椒素合成途径及关键酶基因的表达分析
生种‘Chiltepin’ (C. annuum var. glabriusculum, also termed C. annuum vare)的基因组测序结果，经生物信息学分析，初步筛选出可能参与辣椒素合成的 家族的 5 个基因，依次命名为 CaWRKY1、CaWRKY2、CaWRKY3、CaWRKY4RKY5（图 3）。
3 a.RNA-seq 分析 WRKY 基因家族在‘Zunla-1’、‘Chiltepin’ ‘HYL’、 ‘JZ32’、和’G16’ (pungenteppers);’SP163’, ‘T803’, ‘11c320’, ‘ZJ9’和 ‘11c255’ (nonpungent peppers)中的不同组织和不同时的表达量（数据来源（Qin et al., 2014））；b. WRKY 转录因子系统发生树，红色表示根据 RNA-seq析后初步筛选出的在胎座中特异上调表达的转录因子。.2 ‘740’自交系辣椒的 ERF 和 WRKY 转录因子家族的表达分析对‘740’自交系辣椒中转录因子 ERF 家族和 WRKY 家族的各 5 个基因进行表达分，由图 4 可知，CcERF1、CcERF2、CcERF5 在辣椒胎座中的表达量均高于果肉，
【参考文献】：
期刊论文
[1]辣椒全基因组WRKY转录因子的分析[J]. 刁卫平,王述彬,刘金兵,潘宝贵,郭广君,戈伟. 园艺学报. 2015(11)
[2]茄子AP2/ERF转录因子的鉴定及胁迫条件下的表达分析[J]. 邵欣欣,李涛,李植良,宇丽,黎振兴,徐小万. 植物生理学报. 2015(11)
[3]SA和MeJA处理对‘鬼椒王’果实胎座辣椒素类物质含量的影响[J]. 张子昕,黄祖梅,成善汉,赵枢纽. 热带作物学报. 2015(10)
[4]拟南芥中WRKY家族基因功能的研究进展[J]. 钱金鑫,齐学军,解莉楠,张旸. 安徽农业科学. 2014(05)
[5]黄灯笼椒辣椒素合成途径pal基因克隆及表达分析（英文）[J]. 刘艳梅,杨帆,段军涛,刘羽,王晶莹,郭庆勋. Agricultural Science & Technology. 2013(12)
[6]不同氮水平对辣椒果实中辣椒素及其代谢物质的影响[J]. 陈俊琴,何莉莉,王淑杰. 沈阳农业大学学报. 2013(05)
[7]辣椒Pun1位点对辣椒素酯类物质合成的控制[J]. Koeun Han,Hee-Jin Jeong,Joohee Sung,Young Soo Keum,Myeong-Cheoul Cho,Jeong-Han Kim,Jin-Kyung Kwon,Byung-Dong Kim,Byoung-Cheorl Kang,孔秋生. 辣椒杂志. 2013(01)
[8]水分对线辣椒生长、产量及品质的影响[J]. 庞永慧,郑群,张旺锋,李格,庞胜群. 长江蔬菜. 2012(20)
[9]水稻WRKY基因家族功能研究进展[J]. 鄂志国,王磊. 核农学报. 2012(05)
[10]辣椒素受体（TRPV1）的生物学作用及其作为药物靶点的研究进展[J]. 李魁君,李春刚,刘兴君. 沈阳药科大学学报. 2011(11)
博士论文
[1]辣椒WRKY转录因子CaWRKY6和CaWRKY30基因的克隆、表达及功能分析[D]. 郑井元.中南大学 2012
硕士论文
[1]辣椒素合成酶（CS）基因启动子的克隆及功能分析[D]. 刘羽.吉林大学 2014
[2]辣椒一个新的WRKY转录因子的克隆及其功能初步分析[D]. 肖翔.福建农林大学 2011
[3]辣椒素合成酶基因（CS）及其启动子的克隆与序列分析[D]. 马刚.吉林大学 2009
[4]脱落酸与镉处理对辣椒果实中辣椒素的调控研究[D]. 李维.湖南农业大学 2009
[5]辣椒WRKY转录因子基因CaRKNIF1的克隆及表达分析[D]. 李淑敏.中国农业科学院 2008
本文编号：3457427
【文章来源】：华南农业大学广东省
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
辣椒素合成途径及关键酶基因的表达分析
生种‘Chiltepin’ (C. annuum var. glabriusculum, also termed C. annuum vare)的基因组测序结果，经生物信息学分析，初步筛选出可能参与辣椒素合成的 家族的 5 个基因，依次命名为 CaWRKY1、CaWRKY2、CaWRKY3、CaWRKY4RKY5（图 3）。
3 a.RNA-seq 分析 WRKY 基因家族在‘Zunla-1’、‘Chiltepin’ ‘HYL’、 ‘JZ32’、和’G16’ (pungenteppers);’SP163’, ‘T803’, ‘11c320’, ‘ZJ9’和 ‘11c255’ (nonpungent peppers)中的不同组织和不同时的表达量（数据来源（Qin et al., 2014））；b. WRKY 转录因子系统发生树，红色表示根据 RNA-seq析后初步筛选出的在胎座中特异上调表达的转录因子。.2 ‘740’自交系辣椒的 ERF 和 WRKY 转录因子家族的表达分析对‘740’自交系辣椒中转录因子 ERF 家族和 WRKY 家族的各 5 个基因进行表达分，由图 4 可知，CcERF1、CcERF2、CcERF5 在辣椒胎座中的表达量均高于果肉，
【参考文献】：
期刊论文
[1]辣椒全基因组WRKY转录因子的分析[J]. 刁卫平,王述彬,刘金兵,潘宝贵,郭广君,戈伟. 园艺学报. 2015(11)
[2]茄子AP2/ERF转录因子的鉴定及胁迫条件下的表达分析[J]. 邵欣欣,李涛,李植良,宇丽,黎振兴,徐小万. 植物生理学报. 2015(11)
[3]SA和MeJA处理对‘鬼椒王’果实胎座辣椒素类物质含量的影响[J]. 张子昕,黄祖梅,成善汉,赵枢纽. 热带作物学报. 2015(10)
[4]拟南芥中WRKY家族基因功能的研究进展[J]. 钱金鑫,齐学军,解莉楠,张旸. 安徽农业科学. 2014(05)
[5]黄灯笼椒辣椒素合成途径pal基因克隆及表达分析（英文）[J]. 刘艳梅,杨帆,段军涛,刘羽,王晶莹,郭庆勋. Agricultural Science & Technology. 2013(12)
[6]不同氮水平对辣椒果实中辣椒素及其代谢物质的影响[J]. 陈俊琴,何莉莉,王淑杰. 沈阳农业大学学报. 2013(05)
[7]辣椒Pun1位点对辣椒素酯类物质合成的控制[J]. Koeun Han,Hee-Jin Jeong,Joohee Sung,Young Soo Keum,Myeong-Cheoul Cho,Jeong-Han Kim,Jin-Kyung Kwon,Byung-Dong Kim,Byoung-Cheorl Kang,孔秋生. 辣椒杂志. 2013(01)
[8]水分对线辣椒生长、产量及品质的影响[J]. 庞永慧,郑群,张旺锋,李格,庞胜群. 长江蔬菜. 2012(20)
[9]水稻WRKY基因家族功能研究进展[J]. 鄂志国,王磊. 核农学报. 2012(05)
[10]辣椒素受体（TRPV1）的生物学作用及其作为药物靶点的研究进展[J]. 李魁君,李春刚,刘兴君. 沈阳药科大学学报. 2011(11)
博士论文
[1]辣椒WRKY转录因子CaWRKY6和CaWRKY30基因的克隆、表达及功能分析[D]. 郑井元.中南大学 2012
硕士论文
[1]辣椒素合成酶（CS）基因启动子的克隆及功能分析[D]. 刘羽.吉林大学 2014
[2]辣椒一个新的WRKY转录因子的克隆及其功能初步分析[D]. 肖翔.福建农林大学 2011
[3]辣椒素合成酶基因（CS）及其启动子的克隆与序列分析[D]. 马刚.吉林大学 2009
[4]脱落酸与镉处理对辣椒果实中辣椒素的调控研究[D]. 李维.湖南农业大学 2009
[5]辣椒WRKY转录因子基因CaRKNIF1的克隆及表达分析[D]. 李淑敏.中国农业科学院 2008
本文编号：3457427
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