朝天椒种质遗传多样性的分析
发布时间：2021-10-29 07:37
朝天椒（Capsicum Frutescens L.）的果实营养十分丰富,果实内含有丰富的辣椒素、维生素C、蛋白质、糖类等营养物质,是我国重要的蔬菜作物。本研究以不同种源地朝天椒资源共161份种质为试材,对其进行表型性状的多样性分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析,并结合SSR分子标记技术对朝天椒进行亲缘关系鉴定与遗传多样性分析,充分利用现存的育种亲本和种质资源,对其种群内与种群间的鉴别、来源不同的种质间的亲缘关系的鉴定、优良品种的筛选等具有重要的理论意义。研究结果如下:1、对161份朝天椒种质的种色、子叶形状、株型、叶片边缘、花冠颜色、果面棱沟等36个质量性状,种子径长、子叶长、株高、叶片长、花冠径长、单果重等29个数量性状的变异情况进行分析,结果显示:36个质量性状在161份朝天椒种质中共检测到113个变异类型,平均每个性状的变异类型为3.14个,36个质量性状的遗传多样性指数在0.23～1.48之间,平均为0.79,其中以花柱颜色最高,叶型的遗传多样性指数最小;29个数量性状的变异系数的变化范围介于2.39%-39.39%之间,胎座宽的变异系数最大,可食率的变异系数最小,遗传多...
【文章来源】：贵州大学贵州省 211工程院校
【文章页数】：90 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 前言
1.1 前人研究进展
1.1.1 辣椒概况
1.1.2 遗传多样性概述
1.1.2.1 遗传多样性定义
1.1.2.2 遗传多样性的研究方法
1.1.2.2.1 形态学标记(Morphological markers)
1.1.2.2.2 细胞学标记(Cytological markers)
1.1.2.2.3 生化标记(Biochemical markers)
1.1.2.2.4 分子标记(Molecular markers)
1.1.3 辣椒遗传多样性研究进展
1.1.3.1 辣椒的形态学标记
1.1.3.2 辣椒的分子标记
1.1.3.2.1 简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR)
1.1.3.2.2 简单重复序列间扩增(Inter-simple Sequence Repeat,ISSR)
1.1.3.2.3 随机扩增片段长度多态性(Random Amplification Polymorphism,RAPD)
1.1.3.2.4 扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)
1.1.3.2.5 单核苷酸多态性(Singer Nuleotide Polymorphism,SNP)
1.1.3.2.6 表达序列标签(Express Sequence Tags,EST)
1.1.3.2.7 序列相关扩增多态性(Sequence Related Amplified Polymorphism,SRAP)
1.2 本研究内容及目的意义
1.2.1 研究的主要内容
1.2.1.1 基于形态学标记的遗传多样性分析
1.2.1.2 基于SSR标记的遗传多样性分析
1.2.2 研究的目的意义
2 材料与方法
2.1 试验材料
2.2 田间种植及调查取样
2.3 主要试验仪器及试剂
2.3.1 主要仪器
2.3.2 主要试剂及配制
2.4 试验流程与测定指标
2.4.1 朝天椒表型性状的调查与测定
2.4.1.1 质量性状观察
2.4.1.2 数量性状观测
2.4.2 朝天椒种质的SSR分子标记
2.4.2.1 基因组DNA的提取与检测
2.4.2.2 引物的选择和筛选
2.4.2.3 PCR反应体系与扩增程序
2.4.2.4 电泳与银染显色
2.5 数据统计分析
2.5.1 表型性状的遗传多样性参数及相关性分析、主成分分析和聚类分析
2.5.2 SSR标记数据分析
3 结果与分析
3.1 朝天椒种质资源表型性状的多样性分析
3.1.1 朝天椒种质间表型性状差异
3.1.1.1 质量性状的多样性
3.1.1.2 数量性状的差异性
3.1.2 不同类型朝天椒资源种群间的表型性状差异
3.1.2.1 不同朝天椒资源种群间数量性状的变异分析
3.1.2.2 不同朝天椒资源种群间的遗传多样性指数分析
3.1.2.2.1 质量性状
3.1.2.2.2 数量性状
3.1.3 表型性状的相关性分析
3.1.4 表型性状的主成分分析
3.1.4.1 质量性状的主成分分析
3.1.4.2 数量性状的主成分分析
3.1.5 聚类分析
3.2 SSR标记数据与分析
3.2.1 SSR扩增结果
3.2.1.1 SSR引物筛选
3.2.1.2 SSR多态性引物的扩增结果
3.2.2 SSR引物的遗传多样性分析
3.2.3 不同类型朝天椒资源群体间的遗传变异分析
3.2.4 朝天椒种质间的遗传相似性分析
3.2.5 朝天椒种质的SSR聚类分析
4 讨论
4.1 朝天椒种质资源形态学标记的遗传多样性分析
4.1.1 朝天椒种质间表型性状差异分析
4.1.2 朝天椒种群间表型性状差异分析
4.1.3 朝天椒种质表型性状的相关性分析
4.1.4 朝天椒种质表型性状的主成分分析
4.1.5 朝天椒种质表型性状的聚类分析
4.2 基于SSR分子标记对朝天椒种质资源遗传多样性的分析
4.2.1 SSR引物的遗传多态性分析
4.2.2 基于SSR分子标记对朝天椒种质的聚类分析
4.3 形态学标记与SSR分子标记聚类分析的比较
5 结论
致谢
主要参考文献
在读硕士期间发表的论文
缩写词Abbreviations
附表
附图
【参考文献】：
期刊论文
[1]观赏辣椒种质资源农艺性状遗传多样性关联分析[J]. 徐睿,张雅楠,林子翔,廖万甜,胡镥巍,祝彪,朱祝军. 浙江农业学报. 2018(11)
[2]100份朝天椒的农艺性状和SRAP标记遗传多样性分析[J]. 曾绍贵,朱邦彤,罗木旺,邱胤晖,罗英,林淑婷. 江苏农业学报. 2018(04)
[3]辣椒种质表型性状与SSR分子标记的遗传多样性分析[J]. 傅鸿妃,吕晓菡,陈建瑛,李国景. 核农学报. 2018(07)
[4]2017年度辣椒科学研究进展[J]. 郑井元,李雪峰,周书栋,马艳青. 中国蔬菜. 2018(05)
[5]169份辣椒种质资源的遗传多样性分析[J]. 李艳,赵红星,王勇,姜俊,孟祥锋,魏小春,李金玲. 河南农业科学. 2018(02)
[6]基于ISSR标记的酱用型灯笼椒种质资源遗传多样性分析[J]. 李雪峤,高芳华,伍壮生,王小娟,朱白婢. 分子植物育种. 2018(05)
[7]辣椒种质资源形态学性状相关性、主成分与聚类分析[J]. 赫卫,张慧,董延龙,王莹. 北方园艺. 2018(04)
[8]我国辣椒核心种质资源园艺性状多样性的分析和评价[J]. 赵红,曹亚从,张正海,张宝玺,白锐琴,赵园园,王立浩. 中国蔬菜. 2018(01)
[9]辣椒种质遗传多样性分析[J]. 李宁,王飞,尹延旭,姚明华,焦春海,邹雄,赵荣秋,高升华. 辣椒杂志. 2017(04)
[10]朝天椒优良种质资源筛选与评价[J]. 凃祥敏,王庆忠. 蔬菜. 2017(12)
博士论文
[1]基于SSR、SNP和形态学标记的甘薯种质资源遗传多样性研究[D]. 杨新笋.中国农业大学 2016
[2]丹参种质资源及其遗传多样性研究[D]. 彭亮.西北农林科技大学 2015
[3]基于微卫星和线粒体标记的梨小食心虫种群遗传多样性和遗传结构研究[D]. 郑燕.西北农林科技大学 2014
[4]鲢鳙相关形态性状数量性状定位分析[D]. 王军.中国海洋大学 2013
硕士论文
[1]基于植物学性状和SCoT标记的籽用西瓜遗传多样性分析及核心种质构建[D]. 杨静.内蒙古农业大学 2017
[2]应用SSR技术研究香蕉种质资源的遗传多样性[D]. 林丹銮.江西农业大学 2017
[3]基于SRAP、SSR标记的辣椒种质遗传多样性分析与核心种质构建[D]. 吴茵.江西农业大学 2017
[4]西南地区辣椒种质资源评价及遗传多样性分析[D]. 李莎.四川农业大学 2017
[5]酸枣种质资源遗传多样性分析及其核心种质的构建[D]. 孙亚强.塔里木大学 2016
[6]我国辣椒种质资源遗传多样性分析及核心种质构建的研究[D]. 顾晓振.中国农业科学院 2016
[7]黑龙江北部大豆育成品种产量及其相关性状的遗传变异和关联分析[D]. 曹景举.南京农业大学 2016
[8]黍稷种质资源遗传多样性分析[D]. 董俊丽.山西大学 2015
[9]菊花遗传多样性分析及CDDP指纹图谱构建[D]. 李田.山东农业大学 2014
[10]辣椒果实性状相关性分析及QTL定位[D]. 张佳琦.广东海洋大学 2014
本文编号：3464245
【文章来源】：贵州大学贵州省 211工程院校
【文章页数】：90 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 前言
1.1 前人研究进展
1.1.1 辣椒概况
1.1.2 遗传多样性概述
1.1.2.1 遗传多样性定义
1.1.2.2 遗传多样性的研究方法
1.1.2.2.1 形态学标记(Morphological markers)
1.1.2.2.2 细胞学标记(Cytological markers)
1.1.2.2.3 生化标记(Biochemical markers)
1.1.2.2.4 分子标记(Molecular markers)
1.1.3 辣椒遗传多样性研究进展
1.1.3.1 辣椒的形态学标记
1.1.3.2 辣椒的分子标记
1.1.3.2.1 简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR)
1.1.3.2.2 简单重复序列间扩增(Inter-simple Sequence Repeat,ISSR)
1.1.3.2.3 随机扩增片段长度多态性(Random Amplification Polymorphism,RAPD)
1.1.3.2.4 扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)
1.1.3.2.5 单核苷酸多态性(Singer Nuleotide Polymorphism,SNP)
1.1.3.2.6 表达序列标签(Express Sequence Tags,EST)
1.1.3.2.7 序列相关扩增多态性(Sequence Related Amplified Polymorphism,SRAP)
1.2 本研究内容及目的意义
1.2.1 研究的主要内容
1.2.1.1 基于形态学标记的遗传多样性分析
1.2.1.2 基于SSR标记的遗传多样性分析
1.2.2 研究的目的意义
2 材料与方法
2.1 试验材料
2.2 田间种植及调查取样
2.3 主要试验仪器及试剂
2.3.1 主要仪器
2.3.2 主要试剂及配制
2.4 试验流程与测定指标
2.4.1 朝天椒表型性状的调查与测定
2.4.1.1 质量性状观察
2.4.1.2 数量性状观测
2.4.2 朝天椒种质的SSR分子标记
2.4.2.1 基因组DNA的提取与检测
2.4.2.2 引物的选择和筛选
2.4.2.3 PCR反应体系与扩增程序
2.4.2.4 电泳与银染显色
2.5 数据统计分析
2.5.1 表型性状的遗传多样性参数及相关性分析、主成分分析和聚类分析
2.5.2 SSR标记数据分析
3 结果与分析
3.1 朝天椒种质资源表型性状的多样性分析
3.1.1 朝天椒种质间表型性状差异
3.1.1.1 质量性状的多样性
3.1.1.2 数量性状的差异性
3.1.2 不同类型朝天椒资源种群间的表型性状差异
3.1.2.1 不同朝天椒资源种群间数量性状的变异分析
3.1.2.2 不同朝天椒资源种群间的遗传多样性指数分析
3.1.2.2.1 质量性状
3.1.2.2.2 数量性状
3.1.3 表型性状的相关性分析
3.1.4 表型性状的主成分分析
3.1.4.1 质量性状的主成分分析
3.1.4.2 数量性状的主成分分析
3.1.5 聚类分析
3.2 SSR标记数据与分析
3.2.1 SSR扩增结果
3.2.1.1 SSR引物筛选
3.2.1.2 SSR多态性引物的扩增结果
3.2.2 SSR引物的遗传多样性分析
3.2.3 不同类型朝天椒资源群体间的遗传变异分析
3.2.4 朝天椒种质间的遗传相似性分析
3.2.5 朝天椒种质的SSR聚类分析
4 讨论
4.1 朝天椒种质资源形态学标记的遗传多样性分析
4.1.1 朝天椒种质间表型性状差异分析
4.1.2 朝天椒种群间表型性状差异分析
4.1.3 朝天椒种质表型性状的相关性分析
4.1.4 朝天椒种质表型性状的主成分分析
4.1.5 朝天椒种质表型性状的聚类分析
4.2 基于SSR分子标记对朝天椒种质资源遗传多样性的分析
4.2.1 SSR引物的遗传多态性分析
4.2.2 基于SSR分子标记对朝天椒种质的聚类分析
4.3 形态学标记与SSR分子标记聚类分析的比较
5 结论
致谢
主要参考文献
在读硕士期间发表的论文
缩写词Abbreviations
附表
附图
【参考文献】：
期刊论文
[1]观赏辣椒种质资源农艺性状遗传多样性关联分析[J]. 徐睿,张雅楠,林子翔,廖万甜,胡镥巍,祝彪,朱祝军. 浙江农业学报. 2018(11)
[2]100份朝天椒的农艺性状和SRAP标记遗传多样性分析[J]. 曾绍贵,朱邦彤,罗木旺,邱胤晖,罗英,林淑婷. 江苏农业学报. 2018(04)
[3]辣椒种质表型性状与SSR分子标记的遗传多样性分析[J]. 傅鸿妃,吕晓菡,陈建瑛,李国景. 核农学报. 2018(07)
[4]2017年度辣椒科学研究进展[J]. 郑井元,李雪峰,周书栋,马艳青. 中国蔬菜. 2018(05)
[5]169份辣椒种质资源的遗传多样性分析[J]. 李艳,赵红星,王勇,姜俊,孟祥锋,魏小春,李金玲. 河南农业科学. 2018(02)
[6]基于ISSR标记的酱用型灯笼椒种质资源遗传多样性分析[J]. 李雪峤,高芳华,伍壮生,王小娟,朱白婢. 分子植物育种. 2018(05)
[7]辣椒种质资源形态学性状相关性、主成分与聚类分析[J]. 赫卫,张慧,董延龙,王莹. 北方园艺. 2018(04)
[8]我国辣椒核心种质资源园艺性状多样性的分析和评价[J]. 赵红,曹亚从,张正海,张宝玺,白锐琴,赵园园,王立浩. 中国蔬菜. 2018(01)
[9]辣椒种质遗传多样性分析[J]. 李宁,王飞,尹延旭,姚明华,焦春海,邹雄,赵荣秋,高升华. 辣椒杂志. 2017(04)
[10]朝天椒优良种质资源筛选与评价[J]. 凃祥敏,王庆忠. 蔬菜. 2017(12)
博士论文
[1]基于SSR、SNP和形态学标记的甘薯种质资源遗传多样性研究[D]. 杨新笋.中国农业大学 2016
[2]丹参种质资源及其遗传多样性研究[D]. 彭亮.西北农林科技大学 2015
[3]基于微卫星和线粒体标记的梨小食心虫种群遗传多样性和遗传结构研究[D]. 郑燕.西北农林科技大学 2014
[4]鲢鳙相关形态性状数量性状定位分析[D]. 王军.中国海洋大学 2013
硕士论文
[1]基于植物学性状和SCoT标记的籽用西瓜遗传多样性分析及核心种质构建[D]. 杨静.内蒙古农业大学 2017
[2]应用SSR技术研究香蕉种质资源的遗传多样性[D]. 林丹銮.江西农业大学 2017
[3]基于SRAP、SSR标记的辣椒种质遗传多样性分析与核心种质构建[D]. 吴茵.江西农业大学 2017
[4]西南地区辣椒种质资源评价及遗传多样性分析[D]. 李莎.四川农业大学 2017
[5]酸枣种质资源遗传多样性分析及其核心种质的构建[D]. 孙亚强.塔里木大学 2016
[6]我国辣椒种质资源遗传多样性分析及核心种质构建的研究[D]. 顾晓振.中国农业科学院 2016
[7]黑龙江北部大豆育成品种产量及其相关性状的遗传变异和关联分析[D]. 曹景举.南京农业大学 2016
[8]黍稷种质资源遗传多样性分析[D]. 董俊丽.山西大学 2015
[9]菊花遗传多样性分析及CDDP指纹图谱构建[D]. 李田.山东农业大学 2014
[10]辣椒果实性状相关性分析及QTL定位[D]. 张佳琦.广东海洋大学 2014
本文编号：3464245
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