基于RNA-Seq技术分析菜心叶片衰老相关基因

发布时间：2021-11-14 08:28

　　菜心（Brassica rapa var.parachinensis）是我国重要的叶菜类蔬菜之一,具有较高的经济价值。菜心采收之后,其生命周期进入衰老阶段。在贮藏过程中由衰老引发的叶片黄化导致品质劣变和货架期缩短,是菜心采后生物学研究的核心问题之一。目前植物叶片衰老机制研究主要集中在拟南芥和水稻等模式植物上,而前人对菜心采后研究多集中在衰老生理过程的描述和采后实用处理技术领域,对菜心叶片衰老及其调控的分子机理缺乏系统了解。因此,借鉴模式植物的研究结果,加深对菜心采后叶片衰老及其调控机制的认识,将为生产上改进菜心采后贮藏保鲜技术措施提供新的重要理论依据。本研究利用RNA-Seq,对菜心叶片衰老过程中的基因表达变化情况进行分析,筛选与叶片衰老相关的差异表达基因。主要研究结果如下:1.提取贮藏在常温（25℃）PE（Polyethylene）气调包装里0 d、2 d和5 d的菜心叶片进行RNA-Seq测序,经读段拼接后共获得了75651个unigenes,为分析菜心采后叶片衰老表达谱提供了参考基因序列。2.分析了菜心采后叶片衰老表达谱,鉴定到了3604个差异表达基因。通过基因表达模式聚类分析,... 

【文章来源】：华南农业大学广东省

【文章页数】：70 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

菜心叶片总RNA琼脂糖凝胶电泳检测

图 2 菜心 Unigens 和 Transcipts 长度分布.1.3 注释结果评估为了对菜心转录组进行基因功能分析，使用 Blastx 程序，将 Unigenes 比对到

菜心NR注释中最优比对结果的物种分布

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
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本文编号：3494300