基于nSSR和cpSSR标记的中国枣遗传多样性研究

发布时间：2021-12-10 11:38

　　枣（Ziziphus jujuba Mill.）是原产我国的重要果树。枣和酸枣（Z.jujuba var.spinosa）资源丰富,在长期的人工选择和自然选择过程中产生大量的遗传变异。本研究选取我国298份代表性种质（213份枣和85份酸枣类型）,用10对细胞核SSR（nSSR）和7对叶绿体SSR（cpSSR）标记,研究我国枣和酸枣的遗传多样性、遗传结构、单倍型网络结构和遗传演化关系。主要取得如下结论:（1）遗传多样性研究发现,酸枣群体的核、质遗传多样性大于枣群体。在核基因组水平上,酸枣的期望杂合度（He）和香农指数（I）分别为0.750和1.797,大于枣（He、I分别为0.736,1.604）;在叶绿体基因组水平上,酸枣的多样性（h）和香农指数（I）分别为0.462和0.809,大于枣（h、I分别为0.418,0.738）。Nei’s遗传距离、分子方差分析及群体特有等位变异证实,枣和酸枣群体间亲缘关系近,遗传分化程度低,群体间Nei’s遗传距离为0.191,核、质水平的遗传分化分别为10%和1%。（2）遗传结构的结果显示,当K=2时,枣被划分成2个类群,一类以酸枣为体,集中分布在黄... 

【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：61 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
    1.1 枣种质资源概述
        1.1.1 枣种质资源的组成和划分
        1.1.2 枣种质资源的研究意义
    1.2 枣遗传多样性研究中遗传标记的应用
        1.2.1 形态学标记
        1.2.2 细胞学标记
        1.2.3 蛋白质标记
        1.2.4 DNA分子标记
    1.3 枣的起源与演化研究进展
        1.3.1 枣起源研究进展
        1.3.2 酸枣与枣演化研究进展
    1.4 本研究的目的和意义
        1.4.1 研究目的和意义
        1.4.2 研究内容
        1.4.3 研究的技术路线
第二章 材料与方法
    2.1 试验材料
        2.1.1 待筛选引物及筛选所用材料
        2.1.2 枣遗传多样性研究材料
    2.2 主要仪器和试剂
        2.2.1 主要仪器
        2.2.2 主要试剂
        2.2.3 相关试剂配制方法
    2.3 试验方法
        2.3.1 引物合成及DNA提取
        2.3.2 琼脂糖凝胶电泳检测
        2.3.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测
        2.3.4 SSR数据统计与分析
第三章 结果与分析
    3.1 cpSSR引物的筛选
    3.2 枣和酸枣遗传多样性指数分析
    3.3 枣和酸枣的群体遗传结构分析
    3.4 枣和酸枣的单倍型分析
    3.5 枣和酸枣的聚类分析
第四章 结论与讨论
    4.1 遗传多样性分析
    4.2 遗传结构分析
    4.3 遗传关系分析
参考文献
附录
缩略词
致谢
作者简介


【参考文献】：
期刊论文
[1]枣基因组大小研究[J]. 沈慧,黄建,佟岩,李新岗.  西北林学院学报. 2016(03)
[2]主要果树果实品质遗传改良与提升实践[J]. 陈学森,郭文武,徐娟,丛佩华,王力荣,刘崇怀,李秀根,吴树敬,姚玉新,陈晓流.  中国农业科学. 2015(17)
[3]Genetic Diversity and Population Structure in Landraces and Improved Rice Varieties from India[J]. Shailesh D.KUMBHAR,Pawan L.KULWAL,Jagannath V.PATIL,Chandrakant D.SARAWATE,Anil P.GAIKWAD,Ashok S.JADHAV.  Rice Science. 2015(03)
[4]基于叶绿体DNA分析的辽宁省梨属种质遗传多样性研究[J]. 常耀军,曹玉芬,张金梅,田路明,董星光,张莹,齐丹,郑迎春.  园艺学报. 2014(07)
[5]陕北枣品种群遗传结构的SSR分析[J]. 殷晓,张春梅,李新岗,黄建,王长柱,练春兰.  西北农林科技大学学报(自然科学版). 2014(06)
[6]枣和酸枣基因组大小测定[J]. 吴丽萍,唐岩,李颖岳,尹丹妮,庞晓明.  北京林业大学学报. 2013(03)
[7]‘苹果枣’自然三倍体倍性的发现与鉴定[J]. 刘学生,陈龙,王金鑫,李莉,彭建营.  园艺学报. 2013(03)
[8]枣和酸枣亲缘关系的RAPD分析[J]. 李瑞环,李新岗,黄建,高文海.  果树学报. 2012(03)
[9]河南主栽枣品种遗传关系的ISSR分析[J]. 李继东,李海涛,冯建灿,毕会涛,赵旭升.  河南农业大学学报. 2012(01)
[10]枣属植物分类学存在的科学问题及展望[J]. 王延峰,杨宗保.  延安大学学报(自然科学版). 2011(04)

博士论文
[1]枣种质资源遗传多样性的分子评价及其核心种质的构建[D]. 白瑞霞.河北农业大学 2008
[2]中国栽培和野生大豆的遗传多样性、群体分化和演化及其育种性状QTL的关联分析[D]. 文自翔.南京农业大学 2008

硕士论文
[1]枣叶绿体基因组SSR开发及遗传多样性研究[D]. 杨晓婷.西北农林科技大学 2014
[2]酸枣SSR引物开发及遗传多样性研究[D]. 张春梅.西北农林科技大学 2013
[3]基于SSR标记的中国枣遗传多样性研究[D]. 殷晓.西北农林科技大学 2013
[4]枣、酸枣的细胞学研究[D]. 陈龙.河北农业大学 2010
[5]灵宝大枣遗传多样性的表型与ISSR分析[D]. 梁启伟.河南农业大学 2010
[6]大豆细胞质基因组单倍型及其相互间的演化关系[D]. 田晓俊.南昌大学 2007



本文编号：3532549