琼花不孕花和可孕花转录组分析及发育过程形态结构观察
发布时间:2022-01-01 10:00
琼花花型奇特,通常由外围八朵不孕花和中间大量可孕花组成,不孕花形态比可孕花大近百倍,然而形成这两种显著差异花型的发育调控机制却不清楚。我们利用新一代高通量测序平台结合生物信息学的方法,从mRNA转录水平上对琼花不孕花、可孕花进行转录组学比较分析,获得了这两种花器官发育高度差异表达的基因。同时利用细胞生物学、解剖结构方法研究了这两种花型发育过程中的形态结构变化。主要结果如下:(1)从外部形态、器官组织解剖和细胞超微结构三方面,比较了不孕花和和可孕花发育过程中形态结构变化特征,找到了两种花型在组织学和细胞学水平的差异。(2)分别成功提取琼花不孕花和可孕花total RNA,用Illumina High-seqTM 2500测序平台对琼花进行转录组测序,共获得了278,909,605个raw reads,去除低质量序列、接头序列、含N比例大于5%的序列,获得了267,723,356个clean reads,测序质量高。Trinity拼接最终获得132,788个平均长度为740bp的转录本,每条基因中最长的转录本作为unigene,共获得105,683个unigeneo(3)将unigenes...
【文章来源】:扬州大学江苏省
【文章页数】:76 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
花器官发育ABC模型(Ma,2000)
.3.3?ABCDE?模型??A、B、CH类基因是花器官重要的重要调控基因,但是将它们过量表达并没有使叶片??变成其他花器官twi,这预示着由营养器官向花器官转变过程中还有其他花特征基因的参??。PelazW发现类似基因JGZ2、和^说9与花器官特异性表达有关,立个基因??任何一个或两个发生突变时,对花器官的形成并没有明显的影响.而当这王个基因同时??生突变时,就只能形成花專,呈现出B、C类基因双巧变时的表型。远表明^GZ2、??基因(后被重新命名为祐尸2、化尸j基因)与之前的A、B、C类基因不??,因此,将这H个基因称为E类基因。E类基因主要参与粤片、花瓣、雄蕊、必皮和胚??的形成和发育,控制花分生组织的形成fW。随后,在非洲菊(Ger6era/2_y6rWa)中发现??雄蕊发育所必须的G/?C公/基因tW,同时,在水稻中发现了浆片和雄蕊正常发育所必须??基卸叩它们都是属于同一类基因,都为E类基因。由此,ABC模型进一步??ABCDE型(或AE)1-4。??
聚体模型??述模型无法在蛋白层次更好地解释花器官发育的调控过程,结合MADS,ThdssentW首度提出了花器官发育"四聚体模型"(图1-5),该模型认编码的蛋白相互作用构成四聚体,调控花器官的发育。在花器官发育的AB了心>2基因外均属于MADS-box家族基因,MADS-box是真核生物中重,在植物中参与花器官的发育twi,开花时间的调节twi,在根、茎、叶、果起着重要的作用。通过凝胶阻滞、酵母双杂交实验表明,控制花器官发蛋白能够形成同源或异源二聚体,二聚体继而形成H元或四元蛋白复合官形成tni。四聚体模型显示在不考虑胚珠的情况下,四轮花器官的发育是基因的蛋白质产物所形成的四聚体决定的。通过对模式植物拟南芥的研APl-APl-?-?(?为未知蛋白)决定第一轮花器官粤片的形成;乂P7、---二
【参考文献】:
期刊论文
[1]花器官大小调控机制的研究进展[J]. 张栩佳,胡灵芝,陈哲皓,李颖,王利琳. 植物生理学报. 2014(06)
[2]植物细胞核雄性不育基因研究进展[J]. 杨莉芳,刁现民. 植物遗传资源学报. 2013(06)
[3]ELE restrains empty glumes from developing into lemmas[J]. Lilan Hong a, 1, Qian Qian b, 1, Keming Zhu c, 1, Ding Tang a, Zejun Huang a, Ling Gao a, Ming Li a, Minghong Gu c, Zhukuan Cheng a, a State Key Laboratory of Plant Genomics and National Center for Plant Gene Research, Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China b State Key Laboratory of Rice Biology, China National Rice Research Institute, Hangzhou 310006, China c Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology of Jiangsu Province/Key Laboratory of Plant Functional Genomics of Ministry of Education, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China. 遗传学报. 2010(02)
[4]利用野生青狗尾草的细胞质培育谷子质核互作雄性不育材料[J]. 智慧,王永强,李伟,王永芳,李海权,陆平,刁现民. 植物遗传资源学报. 2007(03)
[5]植物雌配子体发育的分子调控研究进展[J]. 包仁艳,姜春宁,郑彩霞,丁坤善. 北京林业大学学报. 2005(04)
[6]植物雌性不育的研究进展[J]. 胡青,高述民,李凤兰. 北京林业大学学报. 2004(01)
本文编号:3562141
【文章来源】:扬州大学江苏省
【文章页数】:76 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
花器官发育ABC模型(Ma,2000)
.3.3?ABCDE?模型??A、B、CH类基因是花器官重要的重要调控基因,但是将它们过量表达并没有使叶片??变成其他花器官twi,这预示着由营养器官向花器官转变过程中还有其他花特征基因的参??。PelazW发现类似基因JGZ2、和^说9与花器官特异性表达有关,立个基因??任何一个或两个发生突变时,对花器官的形成并没有明显的影响.而当这王个基因同时??生突变时,就只能形成花專,呈现出B、C类基因双巧变时的表型。远表明^GZ2、??基因(后被重新命名为祐尸2、化尸j基因)与之前的A、B、C类基因不??,因此,将这H个基因称为E类基因。E类基因主要参与粤片、花瓣、雄蕊、必皮和胚??的形成和发育,控制花分生组织的形成fW。随后,在非洲菊(Ger6era/2_y6rWa)中发现??雄蕊发育所必须的G/?C公/基因tW,同时,在水稻中发现了浆片和雄蕊正常发育所必须??基卸叩它们都是属于同一类基因,都为E类基因。由此,ABC模型进一步??ABCDE型(或AE)1-4。??
聚体模型??述模型无法在蛋白层次更好地解释花器官发育的调控过程,结合MADS,ThdssentW首度提出了花器官发育"四聚体模型"(图1-5),该模型认编码的蛋白相互作用构成四聚体,调控花器官的发育。在花器官发育的AB了心>2基因外均属于MADS-box家族基因,MADS-box是真核生物中重,在植物中参与花器官的发育twi,开花时间的调节twi,在根、茎、叶、果起着重要的作用。通过凝胶阻滞、酵母双杂交实验表明,控制花器官发蛋白能够形成同源或异源二聚体,二聚体继而形成H元或四元蛋白复合官形成tni。四聚体模型显示在不考虑胚珠的情况下,四轮花器官的发育是基因的蛋白质产物所形成的四聚体决定的。通过对模式植物拟南芥的研APl-APl-?-?(?为未知蛋白)决定第一轮花器官粤片的形成;乂P7、---二
【参考文献】:
期刊论文
[1]花器官大小调控机制的研究进展[J]. 张栩佳,胡灵芝,陈哲皓,李颖,王利琳. 植物生理学报. 2014(06)
[2]植物细胞核雄性不育基因研究进展[J]. 杨莉芳,刁现民. 植物遗传资源学报. 2013(06)
[3]ELE restrains empty glumes from developing into lemmas[J]. Lilan Hong a, 1, Qian Qian b, 1, Keming Zhu c, 1, Ding Tang a, Zejun Huang a, Ling Gao a, Ming Li a, Minghong Gu c, Zhukuan Cheng a, a State Key Laboratory of Plant Genomics and National Center for Plant Gene Research, Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China b State Key Laboratory of Rice Biology, China National Rice Research Institute, Hangzhou 310006, China c Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology of Jiangsu Province/Key Laboratory of Plant Functional Genomics of Ministry of Education, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China. 遗传学报. 2010(02)
[4]利用野生青狗尾草的细胞质培育谷子质核互作雄性不育材料[J]. 智慧,王永强,李伟,王永芳,李海权,陆平,刁现民. 植物遗传资源学报. 2007(03)
[5]植物雌配子体发育的分子调控研究进展[J]. 包仁艳,姜春宁,郑彩霞,丁坤善. 北京林业大学学报. 2005(04)
[6]植物雌性不育的研究进展[J]. 胡青,高述民,李凤兰. 北京林业大学学报. 2004(01)
本文编号:3562141
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