菜豆种子遗传变异的InDel分子标记分析

发布时间：2022-01-06 04:36

　　【目的】InDel（insertion/deletion,插人/缺失）在基因组上数量多、分布广。InDel标记是近年来发展的一种新型共显性分子标记,以PCR技术为基础,检测方便、经济有效,且准确性高、稳定性好。因此,InDel标记已经广泛应用于动植物的基因型鉴定、遗传多样性分析、基因定位以及功能标记开发等。但是,目前菜豆资源遗传变异的InDel分子标记研究尚知之甚少。【方法】利用已报道的菜豆InDel序列,合成InDel引物,通过普通PCR扩增,检测25份菜豆种质资源的InDel多态性位点,分析遗传多样性参数,进行UPGMA聚类分析,结合菜豆籽粒农艺性状评价,研究菜豆种子遗传变异特点。【结果】25份菜豆的种子表型差异明显,包括单粒长度、单粒宽度、单粒厚度、百粒质量等。种皮的颜色大致可划分为纯色和花色两个系列。纯色主要包括为黄色（7份）、黑色（5份）、白色（4份）和红色（1份）;种皮花色的类型包括红色带黄斑（4份）、黄色带红斑（2份）、红色带白斑（1份）和黄色带白斑（1份）。12对InDel多态性引物在25份菜豆中,共探测到26个InDel位点,平均位点数是2.17个。引物的平均有效等位... 

【文章来源】：江西农业大学学报. 2020,42(02)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

25份菜豆种子表型

利用12对InDel多态性引物对25份菜豆种质资源进行了检测（图2），共探测到26个InDel位点（表4），平均位点数是2.17个。引物的平均有效等位位点数为1.78个，多态信息含量PIC平均值是0.33，期望杂合度（He）平均值为0.42，观察杂合度（Ho）平均值为0.52，群体的遗传多样性指数I为0.63。2.3 菜豆种质资源的聚类分析

此外，在遗传相似系数为0.95时，有两份菜豆材料虽然种皮颜色不同（SJ0180为白色和SJ0209为黄色带白斑），但是本研究中的InDel标记无法区分两者，可能是由于两者的亲缘关系较近，InDel标记数量不够而造成的。3 讨论

【参考文献】：
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本文编号：3571745