不结球白菜叶发育基因BrLOM2的克隆与功能分析

发布时间：2022-01-08 06:04

　　不结球白菜（Brassica rapa ssp.chinensis）,原产中国,是长江流域及其以南地区大量种植,分布最广,种类最多的芸薹属蔬菜作物之一。不结球白菜存在三个变种:普通不结球白菜,乌塌菜和菜薹,品种的多样性使得不结球白菜存在多种不同的叶形。叶的形态影响不结球白菜对环境的适应性及其商品价值,选择性状优良,提供满足市场需求的不结球白菜是生产实践过程重要的环节,但目前对不结球白菜叶发育机理的研究较少。本研究利用RNA-Seq技术分析了不结球白菜圆叶、裂叶近等基因系差异表达基因（DEGs）,发掘参与不结球白菜叶发育的候选基因;克隆了其中一个候选基因BrLOM2,分析了其时空表达特性及对激素的响应;通过转基因技术探索了BrLOM2基因在叶发育过程的功能。主要得到以下结果:1.应用RNA-Seq技术从mRNA水平发掘了圆叶不结球白菜、裂叶不结球白菜近等基因系的表达差异基因。圆叶、裂叶不结球白菜过滤掉低质量reads后分别获得54223970、54840708对高质量reads,唯一比对到参考基因组的reads比例为70.42%和70.19%,说明RNA-Seq结果及所选参考序列可靠。裂... 

【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：49 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

碱基组成情况和质量分布

90H相对190B差异表达基因数及差异倍数统计

差异基因的Pathway分析


本文编号：3576025