结球甘蓝萌发阶段RNA聚合酶Ⅲ转录的BoNR8长非编码RNA研究
发布时间：2022-01-17 05:00
非编码RNA大多由RNA聚合酶Ⅰ转录,它们没有开放阅读框及编码蛋白质的能力,以RNA分子形式广泛存在于生物体中,其中占人类全部转录产物的近98%,占拟南芥（Arabidopsis thaliana）全部转录产物的近71%,酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）中占近29%。这些非编码RNA通过与特定蛋白质结合或影响其他RNA活性来调控基因的表达,在染色质改变、转录调控过程中起重要作用。种子萌发是植物生长发育过程中重要的过渡阶段,它决定了植物萌发后应对外界环境的抵抗能力。目前在植物中发现了一些miRNAs参与种子萌发,如miRNA160（负调控ARF10（Auxin Response Factors 10）基因的表达,影响拟南芥种子萌发）;miRNA163（作用于PXMT1 mRNA促进拟南芥种子萌发和幼苗发育阶段根的生长）;miRNA402（盐胁迫条件下,促进拟南芥种子萌发和幼苗生长）等。遗憾的是,萌发相关的长非编码RNA还未见报道。结球甘蓝是十字花科（Brassicaceae）芸薹属（Brassica）植物,具有丰富的营养价值和经济价值。虽然对结球甘蓝全基因组进...
【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：81 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－１．?ＲＮＡ聚合＿?ＩＩＩ启动子类型及转录产物??Ｆｉｕｒｅ?１－１．?Ｐｒｏｍｏｔｅｒ?ｔｅｓ?ｏｆ?ＲＮＡｏｌｍｅｒａｓｅ?ＩＩＩ?１??
ＮＡ相比没有独立和明显的特征，不能使用单一的方法识别和预测长非编码??ＲＮＡ［２４，〇??（１?）转录干涉??二????ｒ？??＾￣￣ｒ￣??（２?）介导染色质重抅?＼瞧??和组蛋白修饰?４?小（８?）小分子ＲＮＡ前体??？＂Ｉ??／?＼??／＼?（５）调控蛋白质活性?（７）改变蛋白质细胞定位??＾１，??ｗｍｍｍｍａＯＢａｍｍｍｍ?？＝－?？?？??（３?）调控可变剪接?（４?）产生内源性ｓｉＲＮＡ?（?６?）?ＲＮＡ－蛋白质复合体??结构的组成成分??图１－２．长非编码ＲＮＡ作用机制丨２５１??｜２５１??Ｆｉｇ?１－２．?Ｍｅｃｈａｎｉｓｍ?ｏｆ?ｌｏｎｇ?ｎｏｎ－ｃｏｄｉｎｇ?ＲＮＡ?１??１．３植物中长非编码ＲＮＡ研究进展??植物中非编码ＲＮＡ研宄起步较晚，长非编码ＲＮＡ研宄更是少之又少。己经发现的??几个功能性长非编码ＲＮＡ，如拟南芥Ｊ／／八Ｓ７１２８＇２９１、苜蓿和扣｜３１１、番茄??７Ｐ５／／｜３Ｇ｜、水稻?ａｓ＇／Ｖ／１３２１?和?ａｙ￡Ｍ）／）卯１３３１、大豆?Ｇｗ￡Ａ／６）Ｚ＞／０［３４１?等均由?ＲＮＡ?聚合酶?ＩＩ??转录，而ＲＮＡ是拟南芥中发现的ＲＮＡ聚合酶ＩＩＩ?ＩＩＩ型启动子转录的新长非编码??ＲＮＡ〖１８１。??目前发现的功能性植物长非编码ＲＮＡ作用机制清楚的为数不多，只有以下七种??（表?１－１）。拟南芥中／４／／／Ｗ７?（Ｉｎｄｕｃｅｄ?Ｂｙ?Ｐｈｏｓｐｈａｔｅ?Ｓｔａｒｖａｔｉｏｎ?１）通过模仿的祀??基因Ｐ／／Ｇ２抑制了?Ｗ／７？３９９活性，维持磷酸盐饥饿条件下拟南芥根的正常生长，２９］；??ｒ〇ＱＬ４／Ａ?（ｃｏｌｄ?ｉｎｄｕｃｅｄ?ａｎｔｉｓｅｎｓｅ
２结球甘蓝中ＲＮＡ聚合酶丨丨丨转录的Ｂ０ＮＲ８?ＲＮＡ的发现??稳定的二级结构，可以在结球甘蓝中稳定存在。??ｙ??ａｃａｕＣｃＷ＾ｃａｃ??ＣＡ?ｕｃｕＡＡｕｃｑ，ｕ＾??Ｏ增?１??ｉ?／??ｃｃ＾ｃＣＡＡＵａａｕ＊ａｕＣ＊Ａ??ｉｆ?ｃ?ｄＧ＝－８３．１６?ｋｃａｌ／ｍｏｌ??冷ＵｕＣ??ｃｃｃ??图２－２．?／ＷＶ／＾?ＲＮＡ二级结构的预测??Ｆｉｇｕｒｅ?２－２．?Ｔｈｅ?ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ?ｏｆ?ＢｏＮＲＳ?ＲＮＡ?ｓｅｃｏｎｄａｒｙ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ．??２．３．３烟草无细胞系统中ＲＮＡ转录特性分析??根据ＲＮＡ聚合酶ＩＩ和ＲＮＡ聚合酶ＩＩＩ对ａ－鹅膏胆碱敏感度不同，我们在烟草无细??胞转录系统加入０．５?ｎｇ?／ｎｉｌ的ａ－鹅诗胆碱分析了?ＲＮＡ转录特性，聚合酶ＩＩ转录??的ｉ；２?ｓｎＲＮＡ及聚合酶丨丨丨转录的ＲＮＡ作为对照被使川。图２－３表明，加入ａ－鹅??膏胆破后，＂２?ｓｎＲＮＡ的转录受到影响（加入ａ－鹅膏胆碱后泳道２Ａ：ｆ／２?ｓｎＲＮＡ转录物??产生），而沁似和ＲＮＡ转朵没有受到影响，表明ＲＮＡ与狀ＲＮＡ?—??样，是依赖于ＲＮＡ聚合＿１］丨转录的非编码ＲＮＡ。??－１５－??
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物长链非编码RNA研究进展[J]. 黄小庆,李丹丹,吴娟. 遗传. 2015(04)
[2]长非编码RNA研究进展[J]. 陈晓敏,张栋栋,骆健俊,陈润生. 生物化学与生物物理进展. 2014(10)
[3]水杨酸诱导植物抗病性机制的研究进展[J]. 高琪昕,胡新喜,王欢妍,曹可,索欢,何长征. 中国马铃薯. 2014(04)
[4]长非编码RNA生物特征研究与分析[J]. 郭杏莉,高琳,刘永轩,党合萱,王羽,杨晓飞,罗海涛. 科学通报. 2013(27)
[5]植物种子休眠与萌发调控机制研究进展[J]. 程鹏,王平,孙吉康,费明亮,杨辉. 中南林业科技大学学报. 2013(05)
[6]Cu2+对拟南芥根的局部毒性及诱导DNA损伤和细胞死亡[J]. 魏志琴,陈志勇,秦蓉,王宇涛,李韶山. 植物学报. 2013(03)
[7]ABA与植物耐盐信号转导途径的研究进展[J]. 毕影东,刘清醒,郭长虹,郭东林. 中国农学通报. 2013(09)
[8]甘蓝非编码RNA基因BoNR1的克隆与表达分析[J]. 宋江华,汪承刚,王素,单国雷,朱世东. 核农学报. 2011(04)
[9]种子休眠与萌发过程的生理调控机理[J]. 潘琳,徐程扬. 种子. 2010(06)
[10]ABA与植物的耐盐性[J]. 刘琳,曾幼玲,张富春. 植物生理学通讯. 2009(02)
本文编号：3594087
【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
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【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１－１．?ＲＮＡ聚合＿?ＩＩＩ启动子类型及转录产物??Ｆｉｕｒｅ?１－１．?Ｐｒｏｍｏｔｅｒ?ｔｅｓ?ｏｆ?ＲＮＡｏｌｍｅｒａｓｅ?ＩＩＩ?１??
ＮＡ相比没有独立和明显的特征，不能使用单一的方法识别和预测长非编码??ＲＮＡ［２４，〇??（１?）转录干涉??二????ｒ？??＾￣￣ｒ￣??（２?）介导染色质重抅?＼瞧??和组蛋白修饰?４?小（８?）小分子ＲＮＡ前体??？＂Ｉ??／?＼??／＼?（５）调控蛋白质活性?（７）改变蛋白质细胞定位??＾１，??ｗｍｍｍｍａＯＢａｍｍｍｍ?？＝－?？?？??（３?）调控可变剪接?（４?）产生内源性ｓｉＲＮＡ?（?６?）?ＲＮＡ－蛋白质复合体??结构的组成成分??图１－２．长非编码ＲＮＡ作用机制丨２５１??｜２５１??Ｆｉｇ?１－２．?Ｍｅｃｈａｎｉｓｍ?ｏｆ?ｌｏｎｇ?ｎｏｎ－ｃｏｄｉｎｇ?ＲＮＡ?１??１．３植物中长非编码ＲＮＡ研究进展??植物中非编码ＲＮＡ研宄起步较晚，长非编码ＲＮＡ研宄更是少之又少。己经发现的??几个功能性长非编码ＲＮＡ，如拟南芥Ｊ／／八Ｓ７１２８＇２９１、苜蓿和扣｜３１１、番茄??７Ｐ５／／｜３Ｇ｜、水稻?ａｓ＇／Ｖ／１３２１?和?ａｙ￡Ｍ）／）卯１３３１、大豆?Ｇｗ￡Ａ／６）Ｚ＞／０［３４１?等均由?ＲＮＡ?聚合酶?ＩＩ??转录，而ＲＮＡ是拟南芥中发现的ＲＮＡ聚合酶ＩＩＩ?ＩＩＩ型启动子转录的新长非编码??ＲＮＡ〖１８１。??目前发现的功能性植物长非编码ＲＮＡ作用机制清楚的为数不多，只有以下七种??（表?１－１）。拟南芥中／４／／／Ｗ７?（Ｉｎｄｕｃｅｄ?Ｂｙ?Ｐｈｏｓｐｈａｔｅ?Ｓｔａｒｖａｔｉｏｎ?１）通过模仿的祀??基因Ｐ／／Ｇ２抑制了?Ｗ／７？３９９活性，维持磷酸盐饥饿条件下拟南芥根的正常生长，２９］；??ｒ〇ＱＬ４／Ａ?（ｃｏｌｄ?ｉｎｄｕｃｅｄ?ａｎｔｉｓｅｎｓｅ
２结球甘蓝中ＲＮＡ聚合酶丨丨丨转录的Ｂ０ＮＲ８?ＲＮＡ的发现??稳定的二级结构，可以在结球甘蓝中稳定存在。??ｙ??ａｃａｕＣｃＷ＾ｃａｃ??ＣＡ?ｕｃｕＡＡｕｃｑ，ｕ＾??Ｏ增?１??ｉ?／??ｃｃ＾ｃＣＡＡＵａａｕ＊ａｕＣ＊Ａ??ｉｆ?ｃ?ｄＧ＝－８３．１６?ｋｃａｌ／ｍｏｌ??冷ＵｕＣ??ｃｃｃ??图２－２．?／ＷＶ／＾?ＲＮＡ二级结构的预测??Ｆｉｇｕｒｅ?２－２．?Ｔｈｅ?ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ?ｏｆ?ＢｏＮＲＳ?ＲＮＡ?ｓｅｃｏｎｄａｒｙ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ．??２．３．３烟草无细胞系统中ＲＮＡ转录特性分析??根据ＲＮＡ聚合酶ＩＩ和ＲＮＡ聚合酶ＩＩＩ对ａ－鹅膏胆碱敏感度不同，我们在烟草无细??胞转录系统加入０．５?ｎｇ?／ｎｉｌ的ａ－鹅诗胆碱分析了?ＲＮＡ转录特性，聚合酶ＩＩ转录??的ｉ；２?ｓｎＲＮＡ及聚合酶丨丨丨转录的ＲＮＡ作为对照被使川。图２－３表明，加入ａ－鹅??膏胆破后，＂２?ｓｎＲＮＡ的转录受到影响（加入ａ－鹅膏胆碱后泳道２Ａ：ｆ／２?ｓｎＲＮＡ转录物??产生），而沁似和ＲＮＡ转朵没有受到影响，表明ＲＮＡ与狀ＲＮＡ?—??样，是依赖于ＲＮＡ聚合＿１］丨转录的非编码ＲＮＡ。??－１５－??
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物长链非编码RNA研究进展[J]. 黄小庆,李丹丹,吴娟. 遗传. 2015(04)
[2]长非编码RNA研究进展[J]. 陈晓敏,张栋栋,骆健俊,陈润生. 生物化学与生物物理进展. 2014(10)
[3]水杨酸诱导植物抗病性机制的研究进展[J]. 高琪昕,胡新喜,王欢妍,曹可,索欢,何长征. 中国马铃薯. 2014(04)
[4]长非编码RNA生物特征研究与分析[J]. 郭杏莉,高琳,刘永轩,党合萱,王羽,杨晓飞,罗海涛. 科学通报. 2013(27)
[5]植物种子休眠与萌发调控机制研究进展[J]. 程鹏,王平,孙吉康,费明亮,杨辉. 中南林业科技大学学报. 2013(05)
[6]Cu2+对拟南芥根的局部毒性及诱导DNA损伤和细胞死亡[J]. 魏志琴,陈志勇,秦蓉,王宇涛,李韶山. 植物学报. 2013(03)
[7]ABA与植物耐盐信号转导途径的研究进展[J]. 毕影东,刘清醒,郭长虹,郭东林. 中国农学通报. 2013(09)
[8]甘蓝非编码RNA基因BoNR1的克隆与表达分析[J]. 宋江华,汪承刚,王素,单国雷,朱世东. 核农学报. 2011(04)
[9]种子休眠与萌发过程的生理调控机理[J]. 潘琳,徐程扬. 种子. 2010(06)
[10]ABA与植物的耐盐性[J]. 刘琳,曾幼玲,张富春. 植物生理学通讯. 2009(02)
本文编号：3594087
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