基于rDNA-ITS序列的甘肃甘南野生羊肚菌遗传多样性分析
发布时间:2022-01-17 15:43
通过对采自甘肃甘南藏区的16株野生羊肚菌菌株进行分子生物学分析,对rDNA基因内转录间隔区(ITS)片段进行PCR扩增并测序,测序结果在GenBank中进行BLAST比对,鉴定得知,16株供试羊肚菌共归纳为5种,分别为黑脉羊肚菌(Morchella angusticeps)、羊肚菌(Morchella esculenta)、高羊肚菌(Morchella elata)、粗腿羊肚菌(Morchella crapssipes)和尖顶羊肚菌(Morchella conica)。根据采用最大简约法(MP)和邻接法(NJ)构建的分子进化树得知,2种分子进化树拓扑结构相似,并且Bootstrap验证显示,系统发育树各分支都有很高的支持率,说明其系统关系有很高的可信度。结果可为该地区羊肚菌(Morchella spp.)的系统分类提供较为准确的分子性状依据。
【文章来源】:江苏农业科学. 2020,48(17)
【文章页数】:4 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 供试菌株
1.2 主要试剂
1.3 总DNA提取
1.4 PCR扩增
1.4.1 PCR扩增反应体系
1.4.2 PCR扩增程序
1.5 ITS片段测序
2 结果与分析
2.1 PCR扩增结果
2.2 ITS序列测序及BLAST比对分析
2.3 基于ITS序列系统树的构建
3 结论
【参考文献】:
期刊论文
[1]滇西北地区羊肚菌的分子鉴定及ITS序列分析[J]. 刘文丛,刘颖,郭相,刘弟,马明,李宗菊,马绍宾. 江苏农业科学. 2012(03)
[2]几种食用菌子实体总DNA提取方法的比较研究[J]. 白永宏,陈国梁,闫冬,张向前. 安徽农业科学. 2011(19)
[3]基于ITS序列分析对秦岭冷水沟羊肚菌的鉴定[J]. 戴璐,李峻志,李安利,祁鹏,丁仕刚. 中国食用菌. 2010(06)
[4]DNA C-值与被子植物入侵性关系的数据统计分析——以中国境内有分布的539种被子植物为例[J]. 郭水良,陈国奇,毛俐慧. 生态学报. 2008(08)
[5]云南羊肚菌rDNA的ITS序列与亲缘关系分析[J]. 沈洪,陈明杰,赵永昌,潘迎捷. 食用菌学报. 2007(02)
[6]羊肚菌研究综述[J]. 谢占玲,谢占青. 青海大学学报(自然科学版). 2007(02)
[7]核糖体rDNAITS序列在真菌学研究中的应用[J]. 匡治州,许杨. 生命的化学. 2004(02)
[8]甘南野生羊肚菌生态研究初报[J]. 罗植柚. 中国食用菌. 1986(01)
[9]甘南藏族自治州羊肚菌调查[J]. 顾龙云. 食用菌科技. 1984(01)
硕士论文
[1]羊肚菌培养条件优化及其多糖生物活性的研究[D]. 周丽伟.安徽大学 2007
本文编号:3594997
【文章来源】:江苏农业科学. 2020,48(17)
【文章页数】:4 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 供试菌株
1.2 主要试剂
1.3 总DNA提取
1.4 PCR扩增
1.4.1 PCR扩增反应体系
1.4.2 PCR扩增程序
1.5 ITS片段测序
2 结果与分析
2.1 PCR扩增结果
2.2 ITS序列测序及BLAST比对分析
2.3 基于ITS序列系统树的构建
3 结论
【参考文献】:
期刊论文
[1]滇西北地区羊肚菌的分子鉴定及ITS序列分析[J]. 刘文丛,刘颖,郭相,刘弟,马明,李宗菊,马绍宾. 江苏农业科学. 2012(03)
[2]几种食用菌子实体总DNA提取方法的比较研究[J]. 白永宏,陈国梁,闫冬,张向前. 安徽农业科学. 2011(19)
[3]基于ITS序列分析对秦岭冷水沟羊肚菌的鉴定[J]. 戴璐,李峻志,李安利,祁鹏,丁仕刚. 中国食用菌. 2010(06)
[4]DNA C-值与被子植物入侵性关系的数据统计分析——以中国境内有分布的539种被子植物为例[J]. 郭水良,陈国奇,毛俐慧. 生态学报. 2008(08)
[5]云南羊肚菌rDNA的ITS序列与亲缘关系分析[J]. 沈洪,陈明杰,赵永昌,潘迎捷. 食用菌学报. 2007(02)
[6]羊肚菌研究综述[J]. 谢占玲,谢占青. 青海大学学报(自然科学版). 2007(02)
[7]核糖体rDNAITS序列在真菌学研究中的应用[J]. 匡治州,许杨. 生命的化学. 2004(02)
[8]甘南野生羊肚菌生态研究初报[J]. 罗植柚. 中国食用菌. 1986(01)
[9]甘南藏族自治州羊肚菌调查[J]. 顾龙云. 食用菌科技. 1984(01)
硕士论文
[1]羊肚菌培养条件优化及其多糖生物活性的研究[D]. 周丽伟.安徽大学 2007
本文编号:3594997
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/yylw/3594997.html