薄叶金花茶及其近缘种遗传多样性和遗传结构研究
发布时间：2022-01-23 01:06
薄叶金花茶、小花金花茶和小瓣金花茶是分布于我国广西西南部的三种金花茶植物,它们的分布区接近且极其狭窄。因它们具有一定的观赏价值,部分野生植株被当地居民移植,另外,土地的开发和利用导致这三种金花茶的生境被破坏。因此,它们的野生种群大小快速降低,并呈片断化分布。薄叶金花茶和小花金花茶已被《中国高等植物受威胁物种名录》列为濒危物种。本研究利用母系遗传的叶绿体小单拷贝区（SSC）的一个片段、两个双亲遗传的单拷贝核基因（PAL和waxy）以及微卫星标记,对三种金花茶的DNA单倍型的组成和分布进行研究,对遗传多样性水平和种群遗传结构进行分析,结果如下:1)三种金花茶PAL基因序列比对结果总长653bp,包括8个简约信息位点和4个单核苷酸多态性位点,没有插入或缺失。7个种群共检测得到11个单倍型。waxy基因序列比对结果总长684bp,包括15个简约信息位点和2个单核苷酸多态性位点,2个插入或缺失。7个种群共检测得到8个单倍型。cpDNA片段比对总长5192bp,包括5个核酸置换位点。7个种群检测得到4个单倍型。PAL基因单倍型网络图中,单倍型H11有6个种群共享,分布最广,频率最大,并位于网络图的...
【文章来源】：广西师范大学广西壮族自治区
【文章页数】：62 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
三种金花茶7个种群采样地理分布图
图 3.1 三种金花茶单倍型网状进化图。I 为 PAL 基因单倍型图；Ⅱ为 waxy 基因单倍型图；Ⅲ为 cpDNA片段单倍型图Fig. 3.1 I Network of haplotypes based on the PAL gene; Ⅱ Network of haplotypes based on the waxygene; Ⅲ Network of haplotypes based on the cpDNA sequences3.2 微卫星数据遗传多样性11 个位点在三种金花茶 184 个个体共检测到等位基因 92 个，平均每个位点 8.364 个（表3.6）。7 个种群 11 个位点共 77 次 Hardy-weinberg 平衡检验，检测结果共有 9 次偏离平衡（P < 0.05），经 sequential Bonferroni 校正后，只有位点 TER8 在种群 NB3 偏离平衡（表3.7）。Micro-checkerh 检测出三个无效等位基因，分别是种群 BH2（TER3）、NB3（TER8）和 PT1（TER18）。两两位点间不存在连锁平衡现象，表明两两位点之间遗传是相对独立的。所有数据可用于后续分析。11 各位点中，每个位点的等位基因数（NT）在 5（FLA30 和 TER3）-12（FLA20 和
0.3850** 0.2197** ─ 1.4899 0.7284 0.5800.2903** 0.1656** 0.1437** ─ 1.3012 0.7910.3190** 0.2472** 0.2555** 0.1612** ─ 0.5860.3830** 0.3077** 0.3012** 0.2401** 0.2987** ─ 0.4533** 0.4281** 0.3959** 0.3627** 0.3999** 0.3514.01UCTURE 和 PCoA 分析三种金花茶遗传结构的结果基本一致。STRU，7 个种群 184 个个体最佳遗传学分组 K＝2（图 3.2），此时薄叶金花金花茶的 3 个种群大部分个体分为一组，小瓣金花茶 2 个种群的大部 3.3）。PCoA 分析结果（图 3.4），7 个种群所有个体分为两组，即薄小花金花茶的 3 个种群分为一组，小瓣金花茶 2 个种群分为一组，但分为 2 个亚组，即两个种群明显分开，且种群 PT1 更接近小花金花茶的据将取样种群分为两组，而 DNA 测序数据无法分组，存在不一致的子标记有不同的进化速率。Mantel test 结果表明（图 3.5），7 个种群间呈弱的正相关性但不显著（R2=0.0847, p=0.23）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国高等植物受威胁物种名录[J]. 覃海宁,杨永,董仕勇,何强,贾渝,赵莉娜,于胜祥,刘慧圆,刘博,严岳鸿,向建英,夏念和,彭华,李振宇,张志翔,何兴金,尹林克,林余霖,刘全儒,侯元同,刘演,刘启新,曹伟,李建强,陈世龙,金效华,高天刚,陈文俐,马海英,耿玉英,金孝锋,常朝阳,蒋宏,蔡蕾,臧春鑫,武建勇,叶建飞,赖阳均,刘冰,林秦文,薛纳新. 生物多样性. 2017(07)
[2]喀斯特耐阴灌木淡黄金花茶的精细空间遗传结构与基因流[J]. 彭国清,唐绍清. 生态学报. 2017(21)
[3]利用RPB2基因序列甄别浙江红山茶及其近缘种[J]. 温强,朱恒,叶金山,徐立安,徐林初,江香梅. 分子植物育种. 2015(11)
[4]中国实施2020年全球生物多样性目标的进展[J]. 徐海根,丁晖,欧阳志云,张文国,崔鹏,徐卫华,刘立,吴军,卢晓强,曹铭昌,陈炼,乐志芳,吴翼,雷军成. 生态学报. 2016(13)
[5]金花茶体外抗肿瘤活性及物质基础的初步研究[J]. 韦锦斌,农彩丽,苏志恒,陈永欣,吕淑娟,潘宇政. 中国实验方剂学杂志. 2014(10)
[6]SSR分子标记及其在植物遗传育种中的应用[J]. 李珊珊,孙春玉,蒋世翠,王康宇,王义,张美萍. 吉林蔬菜. 2014(05)
[7]金花茶叶的降血糖作用及急性毒性研究[J]. 夏星,黄嘉骏,王志萍,王勤,潘为高. 时珍国医国药. 2013(05)
[8]山茶属植物ITS的多态性——一个广泛逃离一致性进化的实例[J]. 徐颖,徐晶,高继银,张文驹. 植物学报. 2011(02)
[9]广西金花茶开发探讨[J]. 苏孔武. 广西农学报. 2010(04)
[10]传粉昆虫对我国中南地区油茶结实和结籽的作用[J]. 邓园艺,喻勋林,罗毅波. 生态学报. 2010(16)
博士论文
[1]中国三个主要榛种居群遗传多样性及榛属植物种间亲缘关系研究[D]. 宗建伟.中国林业科学研究院 2016
[2]山茶科及紫茎属的系统发育和生物地理研究[D]. 李密密.浙江大学 2011
硕士论文
[1]淡黄金花茶种群遗传结构研究[D]. 卢永彬.广西师范大学 2015
本文编号：3603277
【文章来源】：广西师范大学广西壮族自治区
【文章页数】：62 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
三种金花茶7个种群采样地理分布图
图 3.1 三种金花茶单倍型网状进化图。I 为 PAL 基因单倍型图；Ⅱ为 waxy 基因单倍型图；Ⅲ为 cpDNA片段单倍型图Fig. 3.1 I Network of haplotypes based on the PAL gene; Ⅱ Network of haplotypes based on the waxygene; Ⅲ Network of haplotypes based on the cpDNA sequences3.2 微卫星数据遗传多样性11 个位点在三种金花茶 184 个个体共检测到等位基因 92 个，平均每个位点 8.364 个（表3.6）。7 个种群 11 个位点共 77 次 Hardy-weinberg 平衡检验，检测结果共有 9 次偏离平衡（P < 0.05），经 sequential Bonferroni 校正后，只有位点 TER8 在种群 NB3 偏离平衡（表3.7）。Micro-checkerh 检测出三个无效等位基因，分别是种群 BH2（TER3）、NB3（TER8）和 PT1（TER18）。两两位点间不存在连锁平衡现象，表明两两位点之间遗传是相对独立的。所有数据可用于后续分析。11 各位点中，每个位点的等位基因数（NT）在 5（FLA30 和 TER3）-12（FLA20 和
0.3850** 0.2197** ─ 1.4899 0.7284 0.5800.2903** 0.1656** 0.1437** ─ 1.3012 0.7910.3190** 0.2472** 0.2555** 0.1612** ─ 0.5860.3830** 0.3077** 0.3012** 0.2401** 0.2987** ─ 0.4533** 0.4281** 0.3959** 0.3627** 0.3999** 0.3514.01UCTURE 和 PCoA 分析三种金花茶遗传结构的结果基本一致。STRU，7 个种群 184 个个体最佳遗传学分组 K＝2（图 3.2），此时薄叶金花金花茶的 3 个种群大部分个体分为一组，小瓣金花茶 2 个种群的大部 3.3）。PCoA 分析结果（图 3.4），7 个种群所有个体分为两组，即薄小花金花茶的 3 个种群分为一组，小瓣金花茶 2 个种群分为一组，但分为 2 个亚组，即两个种群明显分开，且种群 PT1 更接近小花金花茶的据将取样种群分为两组，而 DNA 测序数据无法分组，存在不一致的子标记有不同的进化速率。Mantel test 结果表明（图 3.5），7 个种群间呈弱的正相关性但不显著（R2=0.0847, p=0.23）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国高等植物受威胁物种名录[J]. 覃海宁,杨永,董仕勇,何强,贾渝,赵莉娜,于胜祥,刘慧圆,刘博,严岳鸿,向建英,夏念和,彭华,李振宇,张志翔,何兴金,尹林克,林余霖,刘全儒,侯元同,刘演,刘启新,曹伟,李建强,陈世龙,金效华,高天刚,陈文俐,马海英,耿玉英,金孝锋,常朝阳,蒋宏,蔡蕾,臧春鑫,武建勇,叶建飞,赖阳均,刘冰,林秦文,薛纳新. 生物多样性. 2017(07)
[2]喀斯特耐阴灌木淡黄金花茶的精细空间遗传结构与基因流[J]. 彭国清,唐绍清. 生态学报. 2017(21)
[3]利用RPB2基因序列甄别浙江红山茶及其近缘种[J]. 温强,朱恒,叶金山,徐立安,徐林初,江香梅. 分子植物育种. 2015(11)
[4]中国实施2020年全球生物多样性目标的进展[J]. 徐海根,丁晖,欧阳志云,张文国,崔鹏,徐卫华,刘立,吴军,卢晓强,曹铭昌,陈炼,乐志芳,吴翼,雷军成. 生态学报. 2016(13)
[5]金花茶体外抗肿瘤活性及物质基础的初步研究[J]. 韦锦斌,农彩丽,苏志恒,陈永欣,吕淑娟,潘宇政. 中国实验方剂学杂志. 2014(10)
[6]SSR分子标记及其在植物遗传育种中的应用[J]. 李珊珊,孙春玉,蒋世翠,王康宇,王义,张美萍. 吉林蔬菜. 2014(05)
[7]金花茶叶的降血糖作用及急性毒性研究[J]. 夏星,黄嘉骏,王志萍,王勤,潘为高. 时珍国医国药. 2013(05)
[8]山茶属植物ITS的多态性——一个广泛逃离一致性进化的实例[J]. 徐颖,徐晶,高继银,张文驹. 植物学报. 2011(02)
[9]广西金花茶开发探讨[J]. 苏孔武. 广西农学报. 2010(04)
[10]传粉昆虫对我国中南地区油茶结实和结籽的作用[J]. 邓园艺,喻勋林,罗毅波. 生态学报. 2010(16)
博士论文
[1]中国三个主要榛种居群遗传多样性及榛属植物种间亲缘关系研究[D]. 宗建伟.中国林业科学研究院 2016
[2]山茶科及紫茎属的系统发育和生物地理研究[D]. 李密密.浙江大学 2011
硕士论文
[1]淡黄金花茶种群遗传结构研究[D]. 卢永彬.广西师范大学 2015
本文编号：3603277
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