基于RNA-Seq技术对黄果柑平、凸蒂性状形成机理的初步探究

发布时间：2022-01-24 16:13

　　本试验以课题组前期调查的平蒂形（Flat Type, FT）和凸蒂形（Prominent Type,PT）黄果柑（Citrus cultivar cv. Huangguogan）为研究材料,为研究调控其果蒂性状的内在机理,试验首先通过常规的果实品质分析方法,分析比较了两种类型的黄果柑在成熟期时的果实品质差异情况,紧接着从ISSR分子标记手段研究两者是否在遗传物质上发生了改变,同时结合荧光定量PCR研究了调控细胞壁代谢的相关酶关键基因XET,分析了其生物学信息及在分别在平蒂形（FT）和凸蒂形（PT）黄果柑中的表达水平,分析它与该性状的关系。最后结合RNA-Seq转录组测序的手段分析了FT和PT在两个生长发育阶段差异基因的表达情况,研究结果表明：1.通过对比先锋乡和丰乐乡当地成熟期时平蒂形（FT）与凸蒂形（PT）黄果柑果实品质,发现从总糖含量和糖酸比上,FT比PT均有优势。设计的引物无法用ISSR-PCR分子标记方法将两者区分开来,可能两者并没有遗传物质上的差异。2.通过改良的CTAB法提取黄果柑果皮总RNA,然后反转录为cDNA,并设计XET基因扩增引物,克隆出黄果柑中的XET基因（Ci... 

【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校

【文章页数】：54 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１不同果蒂形黄果巧差异比较??Ｆｉｇ?１?ｃｏｍｐａｒｉｓｏ打?ｏｆ?ｔｗｏ?ｔｙｐｅ?ｈｕａｎｇｇｕｏｇａｎ?ｗｈｉｃｈ?ｈａｖｅ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅ?ｉｎ?ｓｔａｌｋ?ｏｆ?ｆｒｕｉｔ??

黄果相??蒂类型黄果巧ＩＳＳＲ分析电泳检测??Ｗ看出，选用的引物都扩增出了条带，并带数均不同，说明不同引物与ＤＮＡ模板的结合类型的黄果世中扩增出差异条带。??＿＿１．４５００?ｂｐ??一两—？？?５Ｍ?ｉ＞ｐ

图２黄果梢总ＤＮＡ电泳国??Ｆｉｇｕｒｅ?２?Ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｏｆ?Ｔｏ?化?１?ＲＮＡ??注：１，２，３：平蒂形黄果巧??４，５，６：凸蒂形黄果相??２．２．３不同果蒂类型黄果巧ＩＳＳＲ分析电泳检测??从图３可Ｗ看出，选用的引物都扩增出了条带，并且不同引物在黄果巧中扩的位点数和条带数均不同，说明不同引物与ＤＮＡ模板的结合位点是不同的。但是８??条引物均没有在两种类型的黄果世中扩增出差异条带。??

【参考文献】：
期刊论文
[1]‘砀山酥梨’及其褐色果皮芽变PbXET基因克隆与表达分析[J]. 程召阳,孙虹丽,衡伟,贾兵,刘莉,叶振风,朱立武.  西北植物学报. 2014(12)
[2]榨菜瘤状茎膨大相关基因orf451的克隆及其表达分析[J]. 罗天宽,刘斌,吴海涛,徐谦,裘波音,邹晓霞,李俊星,陈利萍.  农业生物技术学报. 2015(01)
[3]植物β-半乳糖苷酶[J]. 田爱梅,刘金龙,曹家树.  中国细胞生物学学报. 2014(05)
[4]ISSR标记技术在湖南柑橘主要品种亲缘关系研究中的应用[J]. 黄绿红,刘咏红,李高阳,张菊华.  湖南农业科学. 2012(17)
[5]白桦木聚糖内糖基转移酶XET基因序列及表达[J]. 张岩,王玉成,吴英杰,王超.  东北林业大学学报. 2011(10)
[6]植物细胞壁松弛因子[J]. 赵运军,李来庚.  植物生理学报. 2011(10)
[7]果实软化相关PG基因的进化分析和基因组定位[J]. 魏潇,刘威生,刘宁,章秋平,张玉萍,刘硕,刘有春.  园艺学报. 2011(09)
[8]石棉县黄果柑生物学特性调查与差异株系比较[J]. 汪志辉,刘世福,严巧巧,蒋凌萍.  北方园艺. 2011(14)
[9]中越金柑种质资源的ISSR分析[J]. 黄桂香,郭丽英,张树伟,何新华,周瑞阳,陈虎,杨春奖.  果树学报. 2011(04)
[10]非生物胁迫下植物细胞壁组分变化[J]. 裴惠娟,张满效,安黎哲.  生态学杂志. 2011(06)

硕士论文
[1]黄果柑的亲本及黄果柑与不知火的亲缘关系探究[D]. 王雪飞.四川农业大学 2013
[2]黄瓜苯丙烷类代谢关键酶活性及基因表达的研究[D]. 孟雪娇.哈尔滨师范大学 2011
[3]黄果柑不同株系比较与提高果实品质研究[D]. 冯秋平.四川农业大学 2010
[4]大丽菊花瓣衰老相关蛋白质组及XET基因的研究[D]. 阚雪芹.苏州大学 2010
[5]杂柑的遗传多样性与亲缘关系研究[D]. 张艳.四川农业大学 2008
[6]脐橙果皮发育与裂果发生的解剖学研究[D]. 李蕾.华中农业大学 2006



本文编号：3606888