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南瓜CBL和CIPK基因家族的鉴定及表达模式分析

发布时间:2022-02-18 13:21
  Ca2+是植物中的第二信使,逆境胁迫会导致钙离子浓度的变化,钙感受器之一的类钙调磷酸酶B亚基蛋白(Calcineurin B-like protein,CBLs)能够感知这种变化,并且能够特异性结合位于下游的靶蛋白CBL互作蛋白激酶(CBL-interacting protein kinase,CIPKs),构成CBL-CIPK信号系统。它们将信号传递,进而激活下游一系列级联反应,从而调控植物对逆境胁迫的应答。南瓜(Cucurbita moschata)是异源四倍体,不同于葫芦科二倍体的黄瓜和甜瓜等物种。模式作物拟南芥、水稻等有关CBLs和CIPKs基因家族及基因功能等方面的研究较多。2017年,南瓜基因组发布,目前有关南瓜CBLs和CIPKs基因家族的研究较少。而本文通过南瓜全基因组CBLs和CIPKs基因家族的鉴定、分析其表达模式和围绕盐胁迫响应的基因进行研究,主要的研究结果如下:1.利用生物信息学分析方法在南瓜全基因组中鉴定到8个CmCBLs和30个CmCIPKs。CBLs和CIPKs基因家族在基因结构、保守模体和保守结构域分析中都十分保守。系统进化树分析显... 

【文章来源】:华中农业大学湖北省211工程院校教育部直属院校

【文章页数】:83 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

南瓜CBL和CIPK基因家族的鉴定及表达模式分析


CBL和CIPK蛋白的结构示意图(根据BatisticandKudla2008,Duetal2011修改)

南瓜CBL和CIPK基因家族的鉴定及表达模式分析


多物种CBLs基因家族的进化树

南瓜CBL和CIPK基因家族的鉴定及表达模式分析


南瓜、拟南芥、水稻和葡萄CIPKs基因家族进化树

【参考文献】:
期刊论文
[1]CIPK9: a calcium sensor-interacting protein kinase required for low-potassium tolerance in Arabidopsis[J]. Girdhar K Pandey,Yong Hwa Cheong,Beom-Gi Kim,John J Grant,Legong Li.  Cell Research. 2007(05)

博士论文
[1]水稻/玉米CIPK基因家族的比较和水稻锌指蛋白基因ZFP252功能研究[D]. 陈析丰.南京农业大学 2010
[2]逆境条件下胡杨CBL-CIPK信号途径转导的分子机制研究[D]. 张和臣.北京林业大学 2010



本文编号:3630912

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