中国特有植物短丝木犀的群体遗传结构研究

发布时间：2022-08-12 22:06

　　短丝木犀（Osmanthus serrulatus Rehd.）又名宝兴桂花,是木犀科（Oleaceae）少见的春季开花种类之一,为我国特有种,通常分布于海拔1800-2400 m的常绿阔叶林中。由于短丝木犀种子存在隔年萌发现象,自然野生种群更新缓慢,加之人为破坏严重,野生群体遭受严重威胁,目前仅在四川的东拉山、峨眉山、西岭雪山等中高海拔山地有零星片状分布,其中东拉山群体是迄今为止世界上发现的面积最大的野生桂花群体。目前对短丝木犀的研究较少,掌握短丝木犀的遗传多样性信息是了解其濒危原因、制定有效保护措施及良种选育的最基本前提。本文在广泛的野外调查基础上,收集了13个短丝木犀群体共330个个体,利用18对SSR引物对短丝木犀的遗传结构和遗传多样性进行了分析,为短丝木犀不同群体的遗传变异与分化提供分子证据,并为实现该物种的有效保护以及合理开发奠定基础。主要结论如下:从转录组测序获得的2435对短丝木犀引物中随机抽取了100对,筛选出了15对多态性强且稳定性好的引物（目的片段长度在110bp-280bp）,用于群体遗传结构和遗传多样性分析,占随机引物总数的15%。结合15对筛选出的引物及3对... 

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【学位级别】：硕士

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致谢
摘要
abstract
第一章 绪论
    1.1 DNA分子标记
        1.1.1 常用分子标记
        1.1.2 SSR分子标记
    1.2 基于分子标记的群体遗传结构分析
        1.2.1 基本概念及意义
        1.2.2 群体遗传结构的影响因素
        1.2.3 群体遗传结构与保护策略的制定
    1.3 木犀属植物的研究进展
        1.3.1 木犀属其他植物研究进展
        1.3.2 短丝木犀研究进展
    1.4 研究目的及意义
第二章 研究材料与方法
    2.1 实验材料
        2.1.1 SSR引物
        2.1.2 供试材料
    2.2 研究方法
        2.2.1 总DNA提取及检测
        2.2.2 SSR-PCR反应体系优化及引物筛选
        2.2.3 SSR-PCR扩增产物检测
    2.3 数据处理及统计分析
        2.3.1 原始数据处理
        2.3.2 遗传结构分析
        2.3.3 遗传聚类分析
第三章 结果与分析
    3.1 短丝木犀的DNA提取及检测
        3.1.1 1%琼脂糖凝胶电泳检测比较
        3.1.2 紫外分光光度计的检测比较
    3.2 短丝木犀SSR引物筛选及PCR扩增
        3.2.1 正交实验的直观分析
        3.2.2 最佳优化体系筛选短丝木犀引物
        3.2.3 两种引物筛选方法的对比分析
        3.2.4 引物的多态性分析
    3.3 短丝木犀群体的遗传结构分析
        3.3.1 哈迪-温伯格平衡检测
        3.3.2 SSR标记在短丝木犀物种水平的遗传多样性
        3.3.3 短丝木犀群体水平的遗传多样性
        3.3.4 短丝木犀群体间的遗传分化与基因交流
        3.3.5 瓶颈效应分析
    3.4 短丝木犀群体的遗传距离与聚类分析
        3.4.1 遗传距离与地理距离相关性分析
        3.4.2 聚类分析
        3.4.3 Strcture分析
        3.4.4 主成分分析(PCoA)
    3.5 短丝木犀种质资源保护
        3.5.1 短丝木犀的受危因素
        3.5.2 短丝木犀的保护策略
第四章 结论与展望
    4.1 短丝木犀基因组DNA的提取
    4.2 SSR反应体系的优化及引物的筛选
        4.2.1 影响反应体系的因素
        4.2.2 传统筛选与引物快速筛选的对比
    4.3 短丝木犀群体的遗传结构分析
    4.4 短丝木犀群体的遗传距离与聚类分析
    4.5 短丝木犀资源的保护与利用
攻读学位期间发表的学术论文
参考文献



本文编号：3676675