基于SNP和SSR分子标记的番茄种质资源遗传多样性分析

发布时间：2022-11-05 11:05

　　为分析不同番茄种质的遗传多样性,利用120个SNP和29个SSR标记对210份番茄自交系进行基因分型。结果表明,SSR具有较高的多态性,而SNP检测到更高的基因多样性。在预先划分的3个亚群中,樱桃番茄遗传变异最高,常规番茄品种次之,现代番茄品系最低,说明早期育成的番茄品种仍具有较为丰富的遗传多样性。群体结构分析发现,SNP可将3个亚群区分开,同时常规番茄进一步分为粉果番茄和红果番茄2个小亚群。SSR的分析结果与SNP和预先的分类并不一致,未能将常规番茄和现代品系完全区分开。遗传距离分析显示,SNP具有更高的分辨率,可以区分所有供试材料,有6对材料组合未被SSR数据区分开。总的来说,在栽培番茄遗传多样性分析中,SNP标记具有更高的效率。 

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【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 遗传多样性
    1.2 群体结构
    1.3 PCoA
    1.4 遗传相关性分析
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 试验材料
    3.2 分子标记
    3.3 基因型分析
    3.4 数据分析
作者贡献


【参考文献】：
期刊论文
[1]中国加工番茄资源遗传多样性分析[J]. 刘希艳,郑峥,邓学斌,冯晶晶,白金瑞,宋燕,刘磊,李君明.  园艺学报. 2016(03)



本文编号：3702489