基于转录组测序开发SSR标记解析苔草遗传多样性和种群结构

发布时间：2022-12-04 13:37

　　苔草为莎草科苔草属（Carex L.）多年生草本植物,具有自繁能力强、生长持续时间长等特点,在园林绿化、草牧业生产、生态修复等方面发挥着越来越重要的作用。为厘清苔草品种间的遗传多样性及其与地域的关系,鉴别其种类,本研究在对青绿苔草进行转录组测序的基础上,借助SSR标记技术对68份苔草资源的遗传多样性及群体结构分析,以期为苔草种类的鉴别、遗传育种等奠定基础。主要研究结果如下:（1）通过对青绿苔草（Carex breviculmis）样本进行转录组测序,共获得了总长度为 41,724,615bp 的 36,403 个 unigene,KOG 分类将 11,871 个 unigene 注释到 25 组,GO分类对11,629个unigene注释到3个大组,KEGG途径富集分析表明共有8440个unigene被注释到50个代谢途径,NR蛋白比对显示苔草与凤梨序列相似,其次为油棕和海枣。（2）开发了 8,776个简单序列重复（SSR）分子标记,筛选出多态性好的引物42对,并对68份苔草样品进行扩增,结果共扩增出180条条带,其中多态性条带180条,多态性比例100%,平均每个位点扩增4.3条条带... 

【文章页数】：69 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１．１苔草在中国的分布情况（数据来源于中国植物志）??Ｆｉｇｕｒｅ?１．１?Ｔｈｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｃａｒｅｘ?ｉｎ?Ｃｈｉｎａ?（Ｄａｔａ?ｆｒｏｍ?Ｆｌｏｒａ?ｏｆ?Ｃｈｉｎａ）??

图１．２技术路线图??Ｆｉｇｕｒｅ?１．２?Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ?Ｒｏａｄｍａｐ??

图２．１?Ｕｎｉｇｅｎｅ长度分布图??Ｆｉｕｒｅ?２．１?Ｕｎｉｅｎｅ?ｌｅｎｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ??

【参考文献】：
期刊论文
[1]草坪植物的新资源——苔草属植物[J]. 马万里,韩烈保,罗菊春.  草业科学. 2001(02)
[2]几种暖季型草坪草抗旱性的初步鉴定[J]. 郭爱桂,刘建秀,郭海林.  草业科学. 2002(08)
[3]草坪病害生物防治研究进展[J]. 刘明稀,易自力,赵运林,蒋建雄.  草业学报. 2004(06)
[4]苔草属复序苔草亚属植物果皮的扫描电镜观察[J]. 张树仁,戴伦凯,梁松筠.  广西植物. 2000(02)
[5]毛果苔草湿地营养元素的积累、分配及其生物循环特征[J]. 何池全,赵魁义.  生态学报. 2001(12)
[6]ISSR分子标记技术及其在植物遗传多样性分析中的应用[J]. 李海生.  生物学通报. 2004(02)
[7]白颖苔草片剂(颗粒剂)的研制[J]. 倪培忠,王俐,高元清.  时珍国医国药. 2004(04)
[8]ISSR分子标记及其在植物遗传学研究中的应用[J]. 王建波.  遗传. 2002(05)
[9]苔草属种质资源的研究与应用[J]. 王俊强,吕会刚,方唯,李敏.  北京园林. 2006(02)
[10]中国桑树选育品种ISSR指纹图谱的构建及遗传多样性分析（英文）[J]. 赵卫国,苗雪霞,臧波,张林,潘一乐,黄勇平.  遗传学报. 2006(09)

博士论文
[1]假俭草种质遗传多样性分析、遗传图谱构建及重要性状QTL定位[D]. 郑轶琦.南京农业大学 2009

硕士论文
[1]老芒麦EST-SSR分子标记开发与遗传多样性分析[D]. 周强.兰州大学 2016
[2]几种冷季型草坪草的耐荫性研究[D]. 尹淑霞.甘肃农业大学 2000
[3]山东苔草属植物叶表皮微形态的研究[D]. 丁雪珍.山东师范大学 2008



本文编号：3708365