海南岛菠萝蜜种质资源遗传多样性分析

发布时间：2023-04-05 14:12

　　菠萝蜜在我国已经有上千年的种植历史,其中以海南岛最多。海南岛全岛零散分布着大量遗传多样性丰富的实生种质资源,其中蕴含着丰富的优良性状资源,具有很高的开发利用价值。迄今为止,尚没有系统的对海南岛菠萝蜜种质资源亲缘关系的研究报导。本研究对全海南岛菠萝蜜进行随机采样,选用SRAP和SCoT两个分子标记,通过叶片总DNA提取、PCR反应体系优化,对156份海南岛菠萝蜜种质、8个国外种质、3个榴莲蜜种质和1个面包果种质的基因组遗传相似性进行研究,为今后定向培育以及新品种的选育、种质开发利用提供基础资料,研究结果如下:(1)通过比较研究,使用含有4% β-巯基乙醇和12.5 mmol/L硼砂的2% CTAB提取缓冲液,两次抽提后用1/2体积无水乙醇和与上清等体积的4 mol/L LiCl沉淀去除大部分RNA,能够提取到较高质量的基因组DNA。(2)利用L25(56)正交设计实验优化得到菠萝蜜SCoT-PCR反应体系(20μL):Mg2+ 2mmol/L、dNTPs0.2mmol/L、Taq DNA 聚合酶 1U、引物 0.375mol/L、模板DNA10ng,最适退火温度48.2℃。(3)应用筛选...

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【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
1 引言
    1.1 菠萝蜜研究概述
        1.1.1 菠萝蜜概述
        1.1.2 菠萝蜜繁殖方式研究
        1.1.3 我国菠萝蜜种质资源调查研究
    1.2 遗传多样性研究概述
        1.2.1 遗传多样性
        1.2.2 遗传多样性检测方法
        1.2.3 SRAP
        1.2.4 SCoT
    1.3 菠萝蜜遗传多样性研究
    1.4 本研究的目的和意义
2 材料与方法
    2.1 菠萝蜜种质样本采集
    2.2 实验方法
        2.2.1 菠萝蜜基因组DNA提取
        2.2.2 基因组DNA纯度和得率检测
        2.2.3 扩增反应体系优化
        2.2.4 退火温度的确定
        2.2.5 引物的筛选
        2.2.6 扩增产物的检测
        2.2.7 数据统计与分析
3 结果与分析
    3.1 不同方法提取的菠萝蜜基因组DNA质量比较
    3.2 SCoT-PCR扩增反应体系优化结果
    3.3 退火温度的优化结果
    3.4 引物筛选结果
        3.4.1 SRAP引物组合筛选结果
        3.4.2 SCoT引物筛选结果
    3.5 SRAP分子标记扩增结果
        3.5.1 SRAP引物扩增结果
        3.5.2 基于SRAP分子标记的菠萝蜜遗传多样性
    3.6 SCoT分子标记扩增结果
        3.6.1 SCoT引物扩增结果
        3.6.2 基于SCoT分子标记的菠萝蜜遗传多样性
    3.7 种质间亲缘关系综合分析
4 讨论
    4.1 菠萝蜜基因组DNA提取方法探讨
    4.2 SCoT-PCR反应体系优化与扩增产物检测
    4.3 不同分子标记对菠萝蜜遗传多样性比较分析
    4.4 海南岛菠萝蜜种质资源遗传多样性
5 结论
参考文献
作者简介
致谢



本文编号：3783553