中国东北元蘑种质资源评价及其三萜合成途径相关基因研究
发布时间:2023-08-17 19:49
元蘑(Sarcomyxa edulis)隶属于担子菌门Basidiomycota,小菇科Mycenaceae,美味扇菇属Sarcomyxa,是我国东北特色的低温型食药用菌。目前已有人工栽培,该菌味道鲜美,营养丰富,具有多种药用价值和广阔的研究、开发和利用前景,是我国重要的食药用菌资源。然而随着生态环境恶化,其野生资源不断减少,因而对其种质资源的保存、利用和遗传多样性研究工作亟需加强。目前国内对元蘑的研究主要集中于栽培和化学成分提取等方面的基础研究,在元蘑组学及相关性状,如苦味特征等方面的研究尚未见报道。本研究对元蘑野生和栽培种质资源进行收集、鉴定及评价。基于元蘑全基因组de novo测序结果,从表型与基因型两方面,利用SSR多态性分子标记和全基因组重测序SNP分子标记对26株在表型、品质、风味、抗病性等方面具有明显差异的种质资源进行遗传多样性和群体结构分析,结合各类型种质的地理分布和栽培特性进行多样性综合评价,旨在对元蘑现有种质资源进行客观评价,并对优良品种选育和种质创新提供资源和参考。通过种质资源收集和评价,本研究发现元蘑各种质具有不同程度的苦味差异,这直接影响蘑菇品质和商品价值。为...
【文章页数】:204 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
abstract
第一章 前言
1.1 国内外元蘑种质资源研究现状
1.2 食用菌栽培病害研究
1.3 基因组学研究
1.4 遗传多样性研究
1.5 转录组学研究
1.6 苦味物质研究
1.7 本研究的目的和意义
第二章 元蘑种质资源收集及鉴定
2.1 材料和方法
2.2 结果与分析
2.3 小结与讨论
第三章 元蘑种质资源评价
3.1 材料和方法
3.2 结果与分析
3.3 小结与讨论
第四章 元蘑基因组分析及其分子进化研究
4.1 材料和方法
4.2 结果与分析
4.3 小结与讨论
第五章 元蘑种质资源遗传多样性分析
5.1 材料和方法
5.2 结果与分析
5.3 小结与讨论
第六章 元蘑苦味物质三萜合成途径相关基因研究
6.1 材料与方法
6.2 结果与分析
6.3 小结与讨论
第七章 结论与展望
7.1 结论
7.2 创新点
7.3 展望
参考文献
附录
附表1-1 已完成基因组测序的食药用菌物种名录
附图2.1 野生元蘑生境图片
附表2-1 栽培数据整理
附表3-1 元蘑菌株抗病性评价列表
附表4-1 选择的已发表基因组
附表4-2 元蘑CYPs基因家族
附表4-3 不同真菌中CAZymes家族基因的分布
附表4-4 参与元蘑次生代谢的假定基因和基因簇
附表4-5 元蘑多糖生物合成的假定基因
附表5-1 多样性分析选择菌株
附表5-2 各菌株的SNP检测及注释结果
附表5-3 各菌株的InDel检测及注释结果
附表5-4 各菌株的SV检测及注释结果
附表5-5 各菌株的CNV检测及注释结果
附表6-1三萜合成中与P450 修饰相关基因列表
作者简介
致谢
本文编号:3842473
【文章页数】:204 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
abstract
第一章 前言
1.1 国内外元蘑种质资源研究现状
1.2 食用菌栽培病害研究
1.3 基因组学研究
1.4 遗传多样性研究
1.5 转录组学研究
1.6 苦味物质研究
1.7 本研究的目的和意义
第二章 元蘑种质资源收集及鉴定
2.1 材料和方法
2.2 结果与分析
2.3 小结与讨论
第三章 元蘑种质资源评价
3.1 材料和方法
3.2 结果与分析
3.3 小结与讨论
第四章 元蘑基因组分析及其分子进化研究
4.1 材料和方法
4.2 结果与分析
4.3 小结与讨论
第五章 元蘑种质资源遗传多样性分析
5.1 材料和方法
5.2 结果与分析
5.3 小结与讨论
第六章 元蘑苦味物质三萜合成途径相关基因研究
6.1 材料与方法
6.2 结果与分析
6.3 小结与讨论
第七章 结论与展望
7.1 结论
7.2 创新点
7.3 展望
参考文献
附录
附表1-1 已完成基因组测序的食药用菌物种名录
附图2.1 野生元蘑生境图片
附表2-1 栽培数据整理
附表3-1 元蘑菌株抗病性评价列表
附表4-1 选择的已发表基因组
附表4-2 元蘑CYPs基因家族
附表4-3 不同真菌中CAZymes家族基因的分布
附表4-4 参与元蘑次生代谢的假定基因和基因簇
附表4-5 元蘑多糖生物合成的假定基因
附表5-1 多样性分析选择菌株
附表5-2 各菌株的SNP检测及注释结果
附表5-3 各菌株的InDel检测及注释结果
附表5-4 各菌株的SV检测及注释结果
附表5-5 各菌株的CNV检测及注释结果
附表6-1三萜合成中与P450 修饰相关基因列表
作者简介
致谢
本文编号:3842473
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