芍药灰霉病抗性差异的转录组测序分析研究
发布时间:2023-08-25 23:19
芍药是中国的传统名花,因其极高的观赏价值而被广泛应用于植物造景和庭院绿化中,目前在世界50多个国家广为栽培。然而在生产实践中,芍药容易感染灰霉病,导致其叶片干枯坏死,茎部凹陷折倒,花瓣褐色腐烂,甚至整个植株死亡,严重影响植株的观赏效果和商业价值。因此,明晰芍药抗灰霉病的关键基因和miRNA及其分子调控机制,对芍药抗灰霉病品种的选育工作具有重要的理论价值。为此,本研究对扬州地区芍药灰霉病的病原进行了形态和分子鉴定,并对抗病品种‘紫凤羽’和感病品种‘大富贵’进行了数字基因表达谱和小RNA测序分析,鉴定了与抗病相关的代谢途径,挖掘了与抗病相关的差异表达基因和miRNA,主要结果如下:(1)采集芍药灰霉病病叶进行病原菌分离培养,待其产孢后镜检,初步鉴定为葡萄孢属(Botrytis);致病性及寄主范围的测定显示病原菌不仅侵染芍药,也能导致栀子、番茄、月季、山茶、青椒、黄瓜、白菜这7种寄主植物发病;rDNA-ITS序列分析表明其与Genbank中的灰葡萄孢同源性达到99%;以上结果鉴定扬州地区芍药灰霉病病原是灰葡萄孢(Botrytis cinerea Pers.)(2)采集抗病品种‘紫凤羽’和感病...
【文章页数】:87 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
缩略词表
第一章 文献综述
1 植物抗病机制研究进展
1.1 植物抗病类型
1.2 植物抗病相关基因
2 高通量测序技术在植物抗病研究中的应用
2.1 转录组测序
2.2 数字基因表达谱测序
2.3 小RNA测序
3 芍药病害研究进展
3.1 露地芍药病害
3.2 设施芍药病害
3.3 芍药病害研究中存在的问题
4 研究的目的和意义
第二章 芍药灰霉病病原鉴定
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果与分析
2.1 芍药灰霉病田间症状
2.2 病原菌形态特征
2.3 病原菌致病性
2.4 病原菌寄主范围
2.5 病原菌rDNA-ITS序列
2.6 芍药灰霉病病原鉴定结果
3 讨论
第三章 芍药灰霉病抗性差异的数字基因表达谱分析
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果与分析
2.1 测序数据比对及质量评估
2.2 差异表达基因的筛选与分析
2.3 差异表达基因的功能富集分析
2.4 候选抗病相关基因的表达模式分析
2.5 候选基因表达水平的qRT-PCR验证
3 讨论
第四章 芍药灰霉病抗性差异的小RNA测序分析
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果与分析
2.1 小RNA测序质量分析
2.2 保守miRNA的鉴定
2.3 新miRNA的鉴定
2.4 miRNA及其靶基因的差异表达分析
2.5 候选B.cinerea响应miRNA及其靶基因的分析
2.6 靶基因表达水平的qRT-PCR验证
3 讨论
参考文献
致谢
攻读学位期间发表的学术论文
本文编号:3843497
【文章页数】:87 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
缩略词表
第一章 文献综述
1 植物抗病机制研究进展
1.1 植物抗病类型
1.2 植物抗病相关基因
2 高通量测序技术在植物抗病研究中的应用
2.1 转录组测序
2.2 数字基因表达谱测序
2.3 小RNA测序
3 芍药病害研究进展
3.1 露地芍药病害
3.2 设施芍药病害
3.3 芍药病害研究中存在的问题
4 研究的目的和意义
第二章 芍药灰霉病病原鉴定
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果与分析
2.1 芍药灰霉病田间症状
2.2 病原菌形态特征
2.3 病原菌致病性
2.4 病原菌寄主范围
2.5 病原菌rDNA-ITS序列
2.6 芍药灰霉病病原鉴定结果
3 讨论
第三章 芍药灰霉病抗性差异的数字基因表达谱分析
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果与分析
2.1 测序数据比对及质量评估
2.2 差异表达基因的筛选与分析
2.3 差异表达基因的功能富集分析
2.4 候选抗病相关基因的表达模式分析
2.5 候选基因表达水平的qRT-PCR验证
3 讨论
第四章 芍药灰霉病抗性差异的小RNA测序分析
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
2 结果与分析
2.1 小RNA测序质量分析
2.2 保守miRNA的鉴定
2.3 新miRNA的鉴定
2.4 miRNA及其靶基因的差异表达分析
2.5 候选B.cinerea响应miRNA及其靶基因的分析
2.6 靶基因表达水平的qRT-PCR验证
3 讨论
参考文献
致谢
攻读学位期间发表的学术论文
本文编号:3843497
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