苹果全基因组PIN和SMXL成员鉴定、系统进化及在腋芽萌发中的表达分析
发布时间：2023-10-14 08:52
苹果(Malus×domestica Borkh.)作为重要的经济果树,提高产量是关键目标。植物分枝是影响植物地上株型和产量的关键因素,多分枝的理想株型的理论研究显得尤为重要。在模式植物水稻和拟南芥中PIN蛋白和SMXL蛋白对家族鉴定和表达分析以及功能已经取得了系统深入的研究,研究表明PIN和SMXL蛋白在参与调控植物分枝起着极为重要的作用,然而MdPIN和MdSMXL调控苹果腋芽萌发的研究尚未报道。本研究以苹果全基因组为模板,鉴定苹果PIN和SMXL家族成员,分析进化关系、基因结构、保守结构域、启动子作用元件和同线性分析,明确苹果PIN和SMXL家族基因在不同基因型和不同组织的表达特性以及不同激素处理后相关基因的表达模式。初步探索苹果PIN和SMXL家族基因的结构特性和调控苹果腋芽萌发的机制。主要的研究结果如下:1.苹果PIN家族成员鉴定、进化及在腋芽萌发中的表达特性;(1)苹果PIN家族成员鉴定。从苹果金冠基因组中鉴定得到18个生长素输出载体蛋白PIN-formed(PIN),根据它们所在染色体的位置顺序依次被命名。(2)苹果PIN家族成员结构及其进化特性。苹果PIN基因结构呈现多...
【文章页数】：62 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
abstract
第一章 文献综述
1.1 植物分枝发育的调控机制研究进展
1.1.1 植物分枝发育过程研究
1.1.2 植物激素调控分枝发育的机制研究
1.1.3 转录因子调控分枝发育的机制研究
1.1.4 外界因子调控分枝发育的机制研究
1.1.5 多种调控途径对植物分枝发育的协同调控作用模式
1.2 PIN家族基因的研究进展
1.2.1 PIN家族基因的结构分析
1.2.2 PIN家族基因的功能分析
1.3 SMXL 家族基因的研究进展
1.3.1 SMXL家族基因的结构分析
1.3.2 SMXL家族基因的功能分析
1.4 研究的目的和意义
第二章 苹果全基因组PIN成员鉴定及MdPIN15的克隆和在腋芽萌发中的表达分析
2.1 材料与处理
2.1.1 材料
2.1.2 处理
2.2 方法
2.2.1 采样
2.2.2 MdPIN的鉴定与系统进化分析
2.2.3 外显子与内含子结构和保守基序分析
2.2.4 基因表达分析和启动子顺式作用元件分析
2.2.5 引物设计和PCR反应体系
2.2.6 基因表达特性分析
2.3 结果与分析
2.3.1 苹果全基因组PIN基因的鉴定
2.3.2 苹果全基因组PIN基因结构与等位进化分析
2.3.3 MdPIN基因家族启动子元件分析
2.3.4 MdPIN基因家族在不同器官中表达分析
2.3.5 MdPIN15的克隆
2.3.6 MdPIN15在‘长富2号’苹果不同器官中的表达分析
2.3.7 不同处理对腋芽的萌发率和长度的影响
2.3.8 MdPIN15在腋芽萌发中的表达分析
第三章 苹果全基因组SMXL家族鉴定、系统进化与腋芽萌发中表达分析
3.1 材料与处理
3.1.1 材料
3.1.2 处理
3.2 方法
3.2.1 采样
3.2.2 MdSMXL的鉴定
3.2.3 系统进化分析、染色体定位和基因结构
3.2.4 理化特性、蛋白结构和启动子作用元件分析
3.2.5 串联复制、同线性分析和基因表达分析
3.2.6 引物设计
3.3 结果与分析
3.3.1 苹果全基因组MdSMXL基因的鉴定
3.3.2 系统进化分析和基因结构
3.3.3 MdSMXL蛋白结构分析和保守结构域分布
3.3.4 苹果SMXL基因的同线性分析
3.3.5 苹果SMXL基因的组织特异性分析
3.3.6 苹果SMXL基因的启动子分析
3.3.7 苹果SMXL基因的表达分析
第四章 讨论
4.1 苹果PIN家族基因的结构和响应激素调控苹果分枝发育
4.2 苹果SMXL家族基因的结构和响应激素调控苹果分枝发育
4.3 苹果PIN和SMXL家族基因协调参与调控苹果分枝发育
第五章 结论
参考文献
致谢
作者简介
本文编号：3853996
【文章页数】：62 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
abstract
第一章 文献综述
1.1 植物分枝发育的调控机制研究进展
1.1.1 植物分枝发育过程研究
1.1.2 植物激素调控分枝发育的机制研究
1.1.3 转录因子调控分枝发育的机制研究
1.1.4 外界因子调控分枝发育的机制研究
1.1.5 多种调控途径对植物分枝发育的协同调控作用模式
1.2 PIN家族基因的研究进展
1.2.1 PIN家族基因的结构分析
1.2.2 PIN家族基因的功能分析
1.3 SMXL 家族基因的研究进展
1.3.1 SMXL家族基因的结构分析
1.3.2 SMXL家族基因的功能分析
1.4 研究的目的和意义
第二章 苹果全基因组PIN成员鉴定及MdPIN15的克隆和在腋芽萌发中的表达分析
2.1 材料与处理
2.1.1 材料
2.1.2 处理
2.2 方法
2.2.1 采样
2.2.2 MdPIN的鉴定与系统进化分析
2.2.3 外显子与内含子结构和保守基序分析
2.2.4 基因表达分析和启动子顺式作用元件分析
2.2.5 引物设计和PCR反应体系
2.2.6 基因表达特性分析
2.3 结果与分析
2.3.1 苹果全基因组PIN基因的鉴定
2.3.2 苹果全基因组PIN基因结构与等位进化分析
2.3.3 MdPIN基因家族启动子元件分析
2.3.4 MdPIN基因家族在不同器官中表达分析
2.3.5 MdPIN15的克隆
2.3.6 MdPIN15在‘长富2号’苹果不同器官中的表达分析
2.3.7 不同处理对腋芽的萌发率和长度的影响
2.3.8 MdPIN15在腋芽萌发中的表达分析
第三章 苹果全基因组SMXL家族鉴定、系统进化与腋芽萌发中表达分析
3.1 材料与处理
3.1.1 材料
3.1.2 处理
3.2 方法
3.2.1 采样
3.2.2 MdSMXL的鉴定
3.2.3 系统进化分析、染色体定位和基因结构
3.2.4 理化特性、蛋白结构和启动子作用元件分析
3.2.5 串联复制、同线性分析和基因表达分析
3.2.6 引物设计
3.3 结果与分析
3.3.1 苹果全基因组MdSMXL基因的鉴定
3.3.2 系统进化分析和基因结构
3.3.3 MdSMXL蛋白结构分析和保守结构域分布
3.3.4 苹果SMXL基因的同线性分析
3.3.5 苹果SMXL基因的组织特异性分析
3.3.6 苹果SMXL基因的启动子分析
3.3.7 苹果SMXL基因的表达分析
第四章 讨论
4.1 苹果PIN家族基因的结构和响应激素调控苹果分枝发育
4.2 苹果SMXL家族基因的结构和响应激素调控苹果分枝发育
4.3 苹果PIN和SMXL家族基因协调参与调控苹果分枝发育
第五章 结论
参考文献
致谢
作者简介
本文编号：3853996
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