基于SSR标记的北美地区美洲黄莲居群遗传多样性及结构的分析

发布时间：2023-11-05 11:44

　　美洲黄莲(Nelumbo lutea)也称为黄莲,属于莲科(Nyphaeaceae)中的莲属(Nelumbo)。这个物种在北美的分布范围包括美国的中部、东部以及最北部的五大湖地区。美洲黄莲生长在河流,湖泊,沼泽或池塘的静水域,巨大而美丽的花朵涌现在水面之上。美洲黄莲是美国土著部落的重要食物资源,也是全球受欢迎的观赏植物。然而,它的栖息地却受到自然和人类活动的破坏。有关美洲黄莲这个物种的遗传多样性知之甚少。本次实验采集了美国的19个美洲黄莲居群,共326个个体,基于所筛选的12对SSR引物,研究分析了该物种的遗传多样性及结构,研究结果可为进一步利用及保护美洲黄莲种质资源提供理论依据和实践参考,同时,提供分子学数据用于美洲黄莲居群间的变异与分化研究。主要研究结果如下:1.美洲黄莲物种水平上的遗传多样性:326个美洲黄莲个体基于12对SSR位点共扩增得到141个不同的等位基因,每个位点产生的等位基因数(N_T)在11?33之间,平均每个位点产生22.83个等位基因。12对SSR标记的有效等位基因数(N_e)平均值为2.401。观测杂合度(H_0...

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摘要
ABSTRACT
第一章 前言
    1.1 美洲黄莲介绍
        1.1.1 美洲黄莲形态特征及地理分布
        1.1.2 美洲黄莲分类及种间关系
        1.1.3 美洲黄莲繁殖方式及资源现状
        1.1.4 美洲黄莲的栽培史及用途
    1.2 基于分子标记的植物遗传多样性与居群遗传结构
        1.2.1 遗传多样性及遗传结构基本概念
        1.2.2 影响遗传多样性与遗传结构的因素
        1.2.3 分子标记基本概念
        1.2.4 SSR分子标记
        1.2.5 微卫星突变机制与突变率
    1.3 美洲黄莲研究现状
        1.3.1 分子标记研究
        1.3.2 基因组测序
        1.3.3 遗传图谱构建
    1.4 研究目的及意义
第二章 材料和方法
    2.1 实验材料
    2.2 试剂与仪器
        2.2.1 实验试剂
        2.2.2 实验仪器
    2.3 实验方法
        2.3.1 总DNA提取方法
        2.3.2 SSR标记和PCR扩增
        2.3.3 数据分析
第三章 结果分析
    3.1 DNA质量检测
    3.2 引物筛选与PCR扩增
    3.3 美洲黄莲居群的遗传多样性
        3.3.1 SSR位点的哈迪-温伯格平衡检测
        3.3.2 SSR位点的多态性检测
        3.3.3 19个美洲黄莲居群的遗传多样性
    3.4 美洲黄莲居群的遗传分化与遗传结构
        3.4.1 美洲黄莲居群的遗传分化
        3.4.2 美洲黄莲居群的遗传结构
        3.4.3 聚类分析
        3.4.4 Structure软件分析
第四章 讨论
参考文献
致谢



本文编号：3860965