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洋葱鳞茎类黄酮类化合物含量及其转录组分析

发布时间:2024-03-30 03:41
  本研究以三种不同颜色的洋葱品种‘W1201’(红皮)、‘W470’(黄皮)、‘628’(白皮)的鳞茎为材料,比较了三者之间黄酮、花青素含量及其抗氧化活性之间的差异,并对黄酮、花青素含量与抗氧化活性之间的相关性进行了分析。此外,以洋葱品种‘W470’新鲜幼嫩的根、鳞茎、叶片为试验材料,比较了 4种不同RNA提取方法提取洋葱不同组织总RNA的效果,旨在探讨洋葱不同组织的总RNA提取的最优方法。采用IlluminaHiSeqTM2000平台对上述三种颜色洋葱鳞茎组织进行测序并将测序结果进行生物信息学分析,对其差异表达基因进行挖掘、探讨了类黄酮生物合成途径差异表达基因的表达情况。进而,基于转录组测序所得数据开发SSR、SNP标记,以期在后续的研究中利用SSR、SNP标记开展洋葱种质资源遗传多样性评价以及分子标记辅助育种的研究。取得的各项研究结果如下:1.‘W1201’、‘W470’、‘628’的花青素含量分别为 29.99±1.19,9.64±1.30和 0.75±0.40mg·100g-1 黄酮含量分别为 111.10±5.98,36.64±3.59 和 0mg·100g-1。紫皮和黄皮洋葱...

【文章页数】:73 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

图2-1本研究中三种不同颜色的洋葱

图2-1本研究中三种不同颜色的洋葱

1.1试验材料与化学试剂??本研究于2015年5月中旬在南京农业大学江浦园艺站选取了‘W470’(黄皮)、??‘628’?(白皮)、‘W1201’?(紫皮)三种不同颜色的洋葱的洋葱材料(图2-1)。??所有化学试剂均为分析纯。??图2-1本研究中三种不同颜色的洋葱。从左至右依次为....


图2-3三种不同颜色洋葱的TPC和抗氧化活性(mg-100g_1FW)??Fig.?2-3?TPC?and?antioxidant?capacities?(DPPH,?ABTS+?and?FRAP)?of?each?sample?(mean±SE,?n=3)??

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图3-2不同方法提取的洋葱总RNA的RT-PCR检测??Fig.?3-2?RT-PCR?of?total?onion?RNA?extracted?with?different?methods??

图3-2不同方法提取的洋葱总RNA的RT-PCR检测??Fig.?3-2?RT-PCR?of?total?onion?RNA?extracted?with?different?methods??

和的总RNA经反转录后,进行RT-PCR试验,以验证所提RNA能否满足后续试??验。从PCR产物电泳结果表明,两种提取方法对于洋葱的不同组织提取的RNA能??够满足后续分子试验对样品品质的需求(图3-2)。??TaKaRa?叶?pBiozol?法鳞莲?pBiozol?法根??観議....


图4-2?NR分类图??Fi.?4-2?Fiure?of?NR?classification??

图4-2?NR分类图??Fi.?4-2?Fiure?of?NR?classification??

对这些Unigene进行E-value,Identity和物种分布统计。研究结果显示,在注释到??的Unigene?E值分布中,Unigenes序列的E值小于lfm(1时,同源性最高为15.8%,??其他序列的同源性为84.2%?(图4-2A)。在Unigene序列相似度分布中有....



本文编号:3941756

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