胡萝卜DcBMT基因的克隆及其在根发育过程中的表达

发布时间：2024-04-20 02:21

　　为培育具有药用保健作用的胡萝卜品种提供参考,以黑田五寸胡萝卜为材料,克隆胡萝卜DcBMT基因,并分析其进化和表达情况。结果表明:克隆得到的胡萝卜DcBMT基因,其ORF框长为1 080bp,可编码359个氨基酸,该蛋白酶分子质量为39.25kD,等电点pI为6.31,含有5个保守的Box结构和3个保守基序。胡萝卜和白芷的BMT氨基酸序列属同一分枝,而与其他伞形科植物存在一定距离。胡萝卜DcBMT基因在根发育3d和60d的表达量最高,在收获时(90d)表达量最低。DcBMT基因在胡萝卜肉质根发育过程中均有表达,胡萝卜肉质根中可能有佛手酚及佛手柑内脂合成及物质的积累。

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【部分图文】：

图1胡萝卜DcBMT基因的克隆

从图1看出，加cDNA模板的黑田五寸均克隆得到1条约1000bp的基因片段，测序获得的序列及其长度均一致，片段长度均为1080bp,ORF框长度均为1080bp。获得的该基因ORF框与公布的XM＿017394940.1和XM＿017397150.1基因序列ORF具有高度一致....

图2黑田五寸克隆的DcBMT基因与公布的DcBMT核苷酸序列比对

图1胡萝卜DcBMT基因的克隆2.2胡萝卜DcBMT基因编码的氨基酸序列

图3黑田五寸DcBMT基因推导的氨基酸序列与公布的胡萝卜和前胡BMT氨基酸比对

从图3看出，克隆到的胡萝卜DcBMT基因推导的氨基酸序列与2个公布的胡萝卜BMT氨基酸及前胡BMT氨基酸结构一致，均含有5个保守Box结构域，3个保守基序。ZHAO等[6]研究表明，前胡BMT5个保守Box结构域均参与SAM结合，1个Box(BoxⅣ）与底物结合，3个基序结构为催....

图4胡萝卜与其他物种BMT氨基酸的进化比较

从图4可知，所有伞形科物种均在同一个大分枝上，而非伞形科植物蓝星睡莲属于单独的分枝；胡萝卜DcBMT与白芷BMT进化最接近，为同一分枝；前胡和珊瑚菜、阿米芹与欧芹和芹菜处在同一分枝。白芷为中国传统药物之一，其对应的BMT蛋白具有催化佛手酚转化成佛手柑内酯功能[15]，前胡、珊瑚菜....

本文编号：3958728