菠菜热激转录因子Hsf家族全基因组分析及SoHsfA1基因功能分析

发布时间：2024-05-20 02:29

　　菠菜(Spinacia oleracea L.)是我国重要的绿叶蔬菜之一,耐寒性强,但不耐高温,温度高于25℃时,植株出现长势弱、产量低、品质差、硝酸盐积累等问题。热激转录因子(Heart shock transcription factors,Hsfs)是热激反应的主要调节因子,参与调控热激损伤下的保护蛋白—热激蛋白(Heat shock proteins,Hsps)的表达。因此,研究热激转录因子基因家族对研究菠菜热胁迫响应机制至关重要。以菠菜转录组和基因组的测序数据为基础,本研究分析并鉴定了菠菜Hsf家族的特性和功能,为全面分析菠菜热胁迫的响应机制奠定基础,为菠菜耐热分子育种的发展提供理论依据。本研究完成了菠菜全基因组热激转录因子基因家族的鉴定,并克隆了全部SoHsfs的CDS全长;根据其结构域的特征,将SoHsfs家族分为A、B、C三类;构建菠菜、拟南芥(Arabidopsis thaliana)和与菠菜同属苋科藜亚科的甜菜(Beta vulgaris)Hsfs系统发育树,预测分析了SoHsfs亚家族成员和功能;利用qRT-PCR方法分析了该家族耐热候选基因SoHsfA1高温胁迫...

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【部分图文】：

图1.1植物Hsf基本结构

上海师范大学硕士学位论文1.绪论HsfB（除HsfB5）的NLS包含高度保守的四肽阻遏基序（repressordomain，RD）—LFGV—[50-52]。在植物某些Hsf的C端区域中还存在一个富含亮氨酸的疏水NES区域。正是NLS和NES的协同作....

图1.2HSF-HSP-HSBP1热胁迫协同响应机制[97]

3.植物Hsf基因家族响应热胁迫的调控机制植物Hsf在参与热胁迫信号转导以及耐热性的产生过程中的作用概括体现在以下几个方面[36]：（1）植物耐热基因调控网络中最有特点的是调控编码热激蛋白的热激转录因子，可与热激蛋白上游的顺式作用元件结合，从而启动下游热激蛋白和相关基因....

图2.2菠菜Hsf热激转录因子家族DBD保守结构域多序列比对分析

分析结果显示，该结构域由94-102个氨基酸组成，包含3个α螺旋和4个β折叠（图2.2），且除SoHsf12外，其他成员中编码该结构域的部分氨基酸残基完全一致，这种进化中高度保守可能是使Hsf能够识别并与热激蛋白Hsp（Heartshockprot....

图2.3菠菜Hsf热激转录因子家族OD保守结构域多序列比对分析

分析表明，并非全部的菠菜Hsf中都具有NES结构域，、SoHsf2、SoHsf3、SoHsf4、SoHsf8、SoHsf10、SoHsf11、SoHsf14其中SoHsf1的NES区紧邻HR-A/B区的羧基末端，而其它SoHsfs的HR-A/B结构域羧....

本文编号：3978822