桃种间SSR、ITS鉴定及叶绿体基因组比较分析

发布时间：2025-02-09 10:48

　　我国是桃的原产地,种质资源丰富。随着越来越多的桃近缘种资源融入到桃的育种计划和大量外来品种的不断涌入,如何快速、准确地鉴定桃种质资源成为一个亟待解决的问题。同时,随着新基因的不断发掘,桃的遗传转化也需要桃基因组数据作为基础。本研究主要包括三个部分:以国家桃种质资源圃代表性种质为基础,对现有桃SSR标记进行筛选,筛选出适用于桃种间鉴定的SSR引物组,并验证这一引物组对未知种质的鉴定效果以及对杂种基因型分析的适用性;采用克隆测序,分析桃五个种代表性种质的序列特点和种间差异,并对ITS序列作为桃DNA条形码的潜在可能性进行分析;对桃6个代表性种质叶绿体基因组测序,对比分析6个种基因组特点和差异。主要研究结果如下:1.桃种间SSR鉴定及杂种基因型分析(1)以3个国家桃种质资源圃20份代表性种质为试验材料,通过对覆盖桃8个连锁群的78个SSR标记进行筛选,筛选出18个SSR位点,这些位点可以用于高效区分光核桃、甘肃桃、山桃、新疆桃和毛桃5个种。(2)基于荧光标记引物PCR和毛细管电泳分离技术,建立了桃5个种在18个SSR位点的等位基因数据库。(3)通过对8份未知桃种质材料的种间鉴定和‘毛桃×山桃’...

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【学位级别】：博士

【部分图文】：

图1.1微卫星的开发、分布、功能及应用（Kaliaetal.，2011）

因此，由2-3个核苷酸基元组成的微卫星应用较为广泛，在植物中（AT）n较中（AC）n比较常见（Powelletal.,1996）。SSR位点两侧一般是相对保守的单拷贝于设计特异引物用于PCR扩增检测其遗传变异。微卫星标记具有共显性、多态性、重演性强、近缘种间保....

图1.218S-26SrDNA的基本结构（王建波等，1999）

中国农业科学院博士学位论文第一章引言结合s6pdh、trnSG和SSR标记揭示了李属植物在驯化历程中的进化历史，为研究李属植物近期进化提供了参考。虽然桃的SSR引物开发的较早、应用广泛（陈昌文等,2011;李雄伟等,2013;俞明亮等,2004;Lamber....

图1.3叶绿体基因组结构及应用（Rogalskietal.,2015）

图1.3叶绿体基因组结构及应用（Rogalskietal.,2015）Figure1.3Thestructureandapplicationsofchloroplastgenome1.5.3叶绿体基因组序列多样性在真核细胞进化过程中，叶绿体和线粒体一样....

图2.120份样品的3个SSR引物扩增产物聚丙烯酰胺凝胶电泳图

图2.120份样品的3个SSR引物扩增产物聚丙烯酰胺凝胶电泳图A:CPSCT026;B:UDP98-025;C:CPPCT30;M:DNA分子量参考标准；CK:以ddH2O代替DNA模板的空白对照；1-20：隶属桃5个种的20份种质....

本文编号：4032106