喜树碱衍生物的抗肿瘤定量构效关系研究
发布时间：2022-08-07 17:56
定量构效关系是现代分析中的一种重要工具,主要是探究结构与性能之间的关系,在药物研发中尤为重要,利用定量构效关系可以得到药物分子的结构与生物活性之间的关系,从而去了解药物分子的作用,然后去指导药物分子的合成,让合成更有目的性,减少了资源的浪费并且缩减了药物分子的研发周期。癌症是世界五大绝症之一,长期困扰着人类。目前国际上癌症的治疗方法有很多,传统意义上的手术、放疗和化疗,现阶段的生物疗法,但是都对癌症的治疗有不足的的地方。喜树碱及其衍生物对治疗癌症具有明显的疗效,其对于癌细胞的杀伤抑制作用是在癌细胞分裂的S期,喜树碱与拓扑异构酶I相结合生成喜树碱-拓扑异构酶I-DNA三元复合物,促进可裂解复合物的稳定,阻碍DNA链闭合,导致DNA单链断裂,形成“路障”,抑制复制叉的进程,与正在进行的复制叉相遇则会造成不可逆的DNA双链断裂,最终引起细胞死亡。本论文中,通过查阅大量相关文献找到了两组具有抗肿瘤活性的喜树碱衍生物分子以及对应的活性数据。实验方法:第一步通过高斯软件（Gaussian 09）分别对两组分子进行优化,在密度泛函理论的基础上首先采用B3LYP/6-31g（d,p）进行初步优化,然后...
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 喜树碱综述
1.1 喜树碱简介
1.1.1 喜树简介
1.1.2 喜树碱分子的发现和分子理化性质
1.2 喜树碱目前的研究现状
1.2.1 拓扑替康研究现状
1.2.2 伊利替康研究现状
1.2.3 其他喜树碱衍生物的研究现状
1.3 喜树碱抗肿瘤机制
1.4 课题研究的主要内容
1.4.1 两组喜树碱衍生物结构参数的确定
1.4.2 两组喜树碱衍生物的活性数据半数抑制率(IC_(50))
第二章 定量构效关系(QSAR)概述
2.1 定量构效关系(QSAR)简介
2.1.1 定量构效关系的发展
2.1.2 定量构效关系研究方法
2.2 高斯软件(Gaussian)
2.2.1 计算化学
2.2.2 Gaussian和 GaussView软件的简介
2.2.3 GaussView的功能
2.2.4 Gaussian的功能
2.3 主成分分析
2.3.1 SPSS软件介绍
2.3.2 主成分分析方法分析原理和过程
2.3.3 主成分计算的主要步骤
2.3.4 主成分分析在SPSS19.0 中的主要计算方法
2.4 BP神经网络
2.4.1 MATLAB软件简介
2.4.2 MATLAB软件的优点
2.4.3 BP神经网络
第三章 第一组喜树碱类衍生物的定量构效关系研究
3.1 第一组喜树碱衍生物分子的结构和活性数据
3.2 第一组喜树碱衍生物分子的高斯优化
3.3 第一组具有抗肿瘤活性的喜树碱衍生物分子的主成分分析
3.3.1 第一组喜树碱衍生物分子结构参数标准化处理
3.3.2 第一组喜树碱衍生物分子结构参数的因子分析
3.3.3 第一组喜树碱衍生物分子的主成分得分
3.3.4 第一组喜树碱衍生物分子的主成分分析结果讨论
3.4 第一组喜树碱衍生物分子的BP神经网络预测
第四章 第二组喜树碱衍生物分子的定量构效关系研究
4.1 第二组喜树碱衍生物分子结构和活性数据
4.2 第二组喜树碱衍生物分子的高斯优化
4.3 第二组具有抗肿瘤活性的喜树碱衍生物分子的主成分分析
4.3.1 第二组喜树碱衍生物分子的结构参数的标准化处理
4.3.2 第二组喜树碱衍生物分子结构参数的因子分析
4.3.3 第二组喜树碱衍生物分子的主成分得分
4.3.4 第二组喜树碱衍生物分子的主成分分析总结
4.4 第二组喜树碱衍生物分子的BP神经网络预测
第五章 总结论
参考文献
附录
感谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]应用统计学类课程学习:有“理”才“行”[J]. 曹洪玉,唐乾,唐川,冯宝民. 高教学刊. 2018(23)
[2]中药消癥汤联合羟基喜树碱膀胱灌注预防膀胱癌术后复发的效果及对患者血清VEGF的影响[J]. 刘兵,尹学来,陈国宏,薄海,韩兵. 癌症进展. 2018(12)
[3]胃癌组织DNA拓扑异构酶2α等8种分子的蛋白表达与脉管侵犯的关系[J]. 戴东方,陈德玉,李小琴,顾汉刚,王德强. 江苏大学学报(医学版). 2018(02)
[4]蔗糖水解反应速率常数测定实验数据处理方法的改进[J]. 殷悦,洪琴,孙凯铖,王奇,张海鹏,张增侠,钱彬,王旭涛,濮亚敏,胡俊逸,徐华剑,陈定奔,陈丹,钟爱国. 当代化工. 2018(02)
[5]微生物组学中的高维计数和成分数据分析[J]. 吴昌晶,何顺,邓明华. 中国科学:数学. 2017(12)
[6]DNA双螺旋结构发现者——莫里斯·威尔金斯[J]. 张建. 生物学通报. 2017(12)
[7]基于Matlab的遗传算法在结构优化设计中的应用[J]. 吴立华,白洁,左亚军,谭国所,刘永福,李克天. 机电工程技术. 2017(10)
[8]Gaussian09软件在结构化学教学中的应用:分子轨道的分析[J]. 梁锦霞. 广东化工. 2017(16)
[9]Gaussian09软件在结构化学教学中的应用:优化分子的结构[J]. 梁锦霞. 广东化工. 2017(15)
[10]Gaussian09/GaussView5.0在分析化学教学中的应用[J]. 黎唯,谢惠定,黄燕,宋流东,邵娅婷,邱开雄. 昆明医科大学学报. 2016(10)
博士论文
[1]基于因子分析多元有序Logistic回归对慢性胰腺炎分级诊断模型的研究[D]. 边云.第二军医大学 2016
硕士论文
[1]喜树碱类抗肿瘤药物的设计、合成与构效关系研究[D]. 陈海乐.兰州大学 2017
[2]基于人工神经网络的QSAR模型在混合物联合毒性中的应用研究[D]. 赵亚玲.电子科技大学 2017
[3]依据UGT1A1基因型调整伊立替康剂量对FOLFIRI方案治疗转移性结直肠癌的毒性和疗效影响的前瞻性临床研究[D]. 秦双.安徽医科大学 2017
[4]新型喜树碱类化合物ZH-001的抗肿瘤活性及其分子机制研究[D]. 张卉.浙江工业大学 2016
[5]基于遗传算法的BP神经网络的优化研究及MATLAB仿真[D]. 任谢楠.天津师范大学 2014
[6]基于MATLAB GUI的多功能计算系统设计及实现[D]. 邓昌瑞.南昌大学 2012
[7]基于MATLAB的数据采集与分析系统的研究及设计[D]. 姜衍猛.山东大学 2012
[8]新型拓扑异构酶I抑制剂的计算机设计、合成与抗肿瘤活性研究[D]. 付小旦.温州大学 2010
本文编号：3670779
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 喜树碱综述
1.1 喜树碱简介
1.1.1 喜树简介
1.1.2 喜树碱分子的发现和分子理化性质
1.2 喜树碱目前的研究现状
1.2.1 拓扑替康研究现状
1.2.2 伊利替康研究现状
1.2.3 其他喜树碱衍生物的研究现状
1.3 喜树碱抗肿瘤机制
1.4 课题研究的主要内容
1.4.1 两组喜树碱衍生物结构参数的确定
1.4.2 两组喜树碱衍生物的活性数据半数抑制率(IC_(50))
第二章 定量构效关系(QSAR)概述
2.1 定量构效关系(QSAR)简介
2.1.1 定量构效关系的发展
2.1.2 定量构效关系研究方法
2.2 高斯软件(Gaussian)
2.2.1 计算化学
2.2.2 Gaussian和 GaussView软件的简介
2.2.3 GaussView的功能
2.2.4 Gaussian的功能
2.3 主成分分析
2.3.1 SPSS软件介绍
2.3.2 主成分分析方法分析原理和过程
2.3.3 主成分计算的主要步骤
2.3.4 主成分分析在SPSS19.0 中的主要计算方法
2.4 BP神经网络
2.4.1 MATLAB软件简介
2.4.2 MATLAB软件的优点
2.4.3 BP神经网络
第三章 第一组喜树碱类衍生物的定量构效关系研究
3.1 第一组喜树碱衍生物分子的结构和活性数据
3.2 第一组喜树碱衍生物分子的高斯优化
3.3 第一组具有抗肿瘤活性的喜树碱衍生物分子的主成分分析
3.3.1 第一组喜树碱衍生物分子结构参数标准化处理
3.3.2 第一组喜树碱衍生物分子结构参数的因子分析
3.3.3 第一组喜树碱衍生物分子的主成分得分
3.3.4 第一组喜树碱衍生物分子的主成分分析结果讨论
3.4 第一组喜树碱衍生物分子的BP神经网络预测
第四章 第二组喜树碱衍生物分子的定量构效关系研究
4.1 第二组喜树碱衍生物分子结构和活性数据
4.2 第二组喜树碱衍生物分子的高斯优化
4.3 第二组具有抗肿瘤活性的喜树碱衍生物分子的主成分分析
4.3.1 第二组喜树碱衍生物分子的结构参数的标准化处理
4.3.2 第二组喜树碱衍生物分子结构参数的因子分析
4.3.3 第二组喜树碱衍生物分子的主成分得分
4.3.4 第二组喜树碱衍生物分子的主成分分析总结
4.4 第二组喜树碱衍生物分子的BP神经网络预测
第五章 总结论
参考文献
附录
感谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]应用统计学类课程学习:有“理”才“行”[J]. 曹洪玉,唐乾,唐川,冯宝民. 高教学刊. 2018(23)
[2]中药消癥汤联合羟基喜树碱膀胱灌注预防膀胱癌术后复发的效果及对患者血清VEGF的影响[J]. 刘兵,尹学来,陈国宏,薄海,韩兵. 癌症进展. 2018(12)
[3]胃癌组织DNA拓扑异构酶2α等8种分子的蛋白表达与脉管侵犯的关系[J]. 戴东方,陈德玉,李小琴,顾汉刚,王德强. 江苏大学学报(医学版). 2018(02)
[4]蔗糖水解反应速率常数测定实验数据处理方法的改进[J]. 殷悦,洪琴,孙凯铖,王奇,张海鹏,张增侠,钱彬,王旭涛,濮亚敏,胡俊逸,徐华剑,陈定奔,陈丹,钟爱国. 当代化工. 2018(02)
[5]微生物组学中的高维计数和成分数据分析[J]. 吴昌晶,何顺,邓明华. 中国科学:数学. 2017(12)
[6]DNA双螺旋结构发现者——莫里斯·威尔金斯[J]. 张建. 生物学通报. 2017(12)
[7]基于Matlab的遗传算法在结构优化设计中的应用[J]. 吴立华,白洁,左亚军,谭国所,刘永福,李克天. 机电工程技术. 2017(10)
[8]Gaussian09软件在结构化学教学中的应用:分子轨道的分析[J]. 梁锦霞. 广东化工. 2017(16)
[9]Gaussian09软件在结构化学教学中的应用:优化分子的结构[J]. 梁锦霞. 广东化工. 2017(15)
[10]Gaussian09/GaussView5.0在分析化学教学中的应用[J]. 黎唯,谢惠定,黄燕,宋流东,邵娅婷,邱开雄. 昆明医科大学学报. 2016(10)
博士论文
[1]基于因子分析多元有序Logistic回归对慢性胰腺炎分级诊断模型的研究[D]. 边云.第二军医大学 2016
硕士论文
[1]喜树碱类抗肿瘤药物的设计、合成与构效关系研究[D]. 陈海乐.兰州大学 2017
[2]基于人工神经网络的QSAR模型在混合物联合毒性中的应用研究[D]. 赵亚玲.电子科技大学 2017
[3]依据UGT1A1基因型调整伊立替康剂量对FOLFIRI方案治疗转移性结直肠癌的毒性和疗效影响的前瞻性临床研究[D]. 秦双.安徽医科大学 2017
[4]新型喜树碱类化合物ZH-001的抗肿瘤活性及其分子机制研究[D]. 张卉.浙江工业大学 2016
[5]基于遗传算法的BP神经网络的优化研究及MATLAB仿真[D]. 任谢楠.天津师范大学 2014
[6]基于MATLAB GUI的多功能计算系统设计及实现[D]. 邓昌瑞.南昌大学 2012
[7]基于MATLAB的数据采集与分析系统的研究及设计[D]. 姜衍猛.山东大学 2012
[8]新型拓扑异构酶I抑制剂的计算机设计、合成与抗肿瘤活性研究[D]. 付小旦.温州大学 2010
本文编号：3670779
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